User Tools

Site Tools


informatica:hp_z240mt_biospec_paravision

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
Next revision
Previous revision
Last revision Both sides next revision
informatica:hp_z240mt_biospec_paravision [2016/09/02 16:10]
miquel [Verificació]
informatica:hp_z240mt_biospec_paravision [2016/09/04 12:57]
miquel
Line 1: Line 1:
-====== Tranferència del ParaVision 4.0, 5.0 i 5.1 ======+====== Tranferència dels ParaVision 4.0, 5.0 i 5.1 ======
  
 En comptes d'instal·lar les diferents versions del ParaVision des dels DVD d'instal·lació, provo a tranferir les carpetes de les diferents versions del ParaVision instal·lades a l'estació de treball HP xw4100 actual, En comptes d'instal·lar les diferents versions del ParaVision des dels DVD d'instal·lació, provo a tranferir les carpetes de les diferents versions del ParaVision instal·lades a l'estació de treball HP xw4100 actual,
Line 82: Line 82:
 i amb una cerca més exhaustiva a Internet trobo que el problema és que la versió de //rsync// a l'estació de treball del BioSpec és massa vella i que no és compatible amb el protocol de la versió de //rsync// a la nova estació de treball. Per resoldre el problema cal indicar a aquesta darrera que empri una versió anterior del protocol fent servir l'opció ''--protocol="30"''. i amb una cerca més exhaustiva a Internet trobo que el problema és que la versió de //rsync// a l'estació de treball del BioSpec és massa vella i que no és compatible amb el protocol de la versió de //rsync// a la nova estació de treball. Per resoldre el problema cal indicar a aquesta darrera que empri una versió anterior del protocol fent servir l'opció ''--protocol="30"''.
  
-===== Transferència del ParaVision 5.0 =====+===== Transferència del PV 5.0 =====
  
-==== Transferència incomplerta dels fitxers ====+==== Transferència incompleta ====
  
 <file> <file>
Line 167: Line 167:
  
 Els missatges del tipus //opendir(...): Permission denied// indiquen que l'usuari //sermn// a l'ordinador del BioSpec no té permís per accedir a tots els fitxers i/o carpetes. Em connecto a l'ordinador i comprovo que efectivament hi ha carpetes amb permisos restringits a les que no pot accedir l'usuari //sermn//. Els missatges del tipus //opendir(...): Permission denied// indiquen que l'usuari //sermn// a l'ordinador del BioSpec no té permís per accedir a tots els fitxers i/o carpetes. Em connecto a l'ordinador i comprovo que efectivament hi ha carpetes amb permisos restringits a les que no pot accedir l'usuari //sermn//.
-===== Transferència del ParaVision 5.1 ===== 
  
-==== Transferència incomplerta dels fitxers ====+===== Transferència del PV 5.1 ===== 
 + 
 +==== Transferència incompleta ====
  
 Inicio la transferència de la carpeta ///opt/Pv5.1// Inicio la transferència de la carpeta ///opt/Pv5.1//
Line 291: Line 292:
 Alternativament podria haver fet servir algunes de les solucions descrites a [[http://unix.stackexchange.com/questions/92123/rsync-all-files-of-remote-machine-over-ssh-without-root-user | rsync all files of remote machine over SSH without root user?]] Alternativament podria haver fet servir algunes de les solucions descrites a [[http://unix.stackexchange.com/questions/92123/rsync-all-files-of-remote-machine-over-ssh-without-root-user | rsync all files of remote machine over SSH without root user?]]
  
-===== Transferència del ParaVision 5.0 =====+===== Transferència del PV 5.0 =====
  
 ==== Transferència completa dels fitxers ==== ==== Transferència completa dels fitxers ====
Line 374: Line 375:
 ==== Verificació ==== ==== Verificació ====
  
-^ Tipus de fitxer    Ordinador\\ actual  ^  Nou ordinador +^ Tipus de fitxer    Ordinador\\ actual  ^  Nou\\ ordinador 
-| Fitxer normal     | 29827                | 29827           +| Fitxer normal        29827 |   29827 :+: 
-| Carpeta           | 4264                 | 4264            +| Carpeta               4264 |    4264 :+: 
-| Enllaç simbòlic   | 139                  | 139             |+| Enllaç simbòlic        139 |     139 :+: |
  
-===== Transferència del ParaVision 5.1 =====+===== Transferència del PV 5.1 =====
  
 ==== Transferència completa dels fitxers ==== ==== Transferència completa dels fitxers ====
Line 473: Line 474:
 ==== Verificació ==== ==== Verificació ====
  
-^ Tipus de fitxer      ^  Ordinador\\ al BioSpec   Nou ordinador\\ pel Biospec  ^ +^ Tipus de fitxer   ^  Ordinador\\ actual   Nou\\ ordinador  ^ 
-| Fitxer normal [1]    |  68141                   | 68192                         +| Fitxer normal     |    68141 |   68192 :-: 
-| Carpeta [2]           11897                   | 11897                         +| Carpeta              11897 |   11897 :+: 
-| Enllaç simbòlic [3]   130                     | 130                           |+| Enllaç simbòlic        130 |     130 :+: |
  
-[1] ''find ./Pv5.1/ -type f | wc -l'' \\ +Per veure quins fitxers hi ha al nou ordinador que no hi són a l'ordinador vell, faig un simulacre (''--dry-run'') de la comanda de transferència amb l'opoció ''--delete'', 
-[2''find ./PV5.1/ -type d | wc -l'' \\ + 
-[3] ''find ./PV5.1-type l | wc -l'' \\+<file> 
 +root@cie-50-205:/opt# rsync -Hvax --dry-run --delete --verbose \ 
 +--progress --stats --protocol="30" -e "ssh"
 +--rsync-path="sudo rsync" sermn@cie-55-30.uab.cat:/opt/Pv5.1 . \ 
 +> 20160902-1618-rsync-pv51.log 
 +</file> 
 + 
 +i comprovo el contingut del fitxer de registre //20160902-1618-rsync-pv51.log// on trobo els fitxers de més, 
 + 
 +<file> 
 +opening connection using: ssh -l sermn cie-55-30.uab.cat "sudo rsync" --server --sender -vvnlHogDtprxe.iLsfx . /opt/Pv 
 +5.1  (10 args) 
 +receiving file list ...  
 +expand file_list to 4000 bytes, did move 
 + 
 +[..] 
 + 
 + 77200 files... 
 + 80100 files... 
 +80168 files to consider 
 +deleting in Pv5.1 
 + 3100 files... 
 + 6200 files... 
 + 
 +[...] 
 + 
 + 67800 files... 
 + 70700 files... 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.upnpctrlserver.15589 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.dataserver.15488 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.dataserver.15450 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.AqRackServer.log 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.18355 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.17892 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.17441 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.17029 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.16751 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.16528 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.15895 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.15774 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.15589 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.15498 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.15488 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.15450 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.15448 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.15441 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.dataserver.15488 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.dataserver.15450 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.AqRackServer.log 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.18355 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.17892 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.17441 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.17029 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.16751 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.16528 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.15895 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.15774 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.15589 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.15498 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.15488 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.15450 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.15448 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.15441 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.18355 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.17892 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.17441 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.17029 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.16751 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.16528 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.15895 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.15774 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.15589 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.15498 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.15488 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.15450 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.15448 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.15441 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/SetpreServer.ref 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/ParaVision/pvScan/ScanOverview 
 + 77 
 + 80100 
 +delta-transmission enabled 
 +Pv5.1/.checkedLibDeps is uptodate 
 +Pv5.1/.directory is uptodate 
 +Pv5.1/prog/xtip/xtip is uptodate 
 +Pv5.1/pv is uptodate 
 +Pv5.1/topspin is uptodate 
 +total: matches=0  tag_hits=0  false_alarms=0 data=0 
 + 
 +[...] 
 + 
 +Number of files: 80,168 (reg: 68,141, dir: 11,897, link: 130) 
 +Number of regular files transferred:
 +Total file size: 9,971,638,288 bytes 
 +Total transferred file size: 0 bytes 
 +Literal data: 0 bytes 
 +Matched data: 0 bytes 
 +File list size: 1,706,986 
 +Total bytes sent: 16 
 +Total bytes received: 1,705,370 
 + 
 +sent 16 bytes  received 1,705,370 bytes  162,417.71 bytes/sec 
 +total size is 9,971,638,288  speedup is 5,847.14 (DRY RUN) 
 +</file> 
 + 
 +Llavors executo la comanda de forma real (sense l'opció ''--dry-run'') i comprovo de nou el nombre de fitxers als directoris original i còpia, i trobo que ara ja coincideixen: 
 + 
 +^ Tipus de fitxer    Ordinador\\ actual  ^  Nou\\ ordinador  ^ 
 +| Fitxer normal        68141 |   68141 :+: | 
 +| Carpeta              11897 |   11897 :+: | 
 +| Enllaç simbòlic        130 |     130 :+: | 
 + 
 +===== Transferència del PV 4.0 ===== 
 + 
 +==== Transferència completa dels fitxers ==== 
 + 
 +Transfereixo el contingut de la carpeta ///opt/PV4.0// de l'ordinador actual a la nova estació de treball, 
 + 
 +<file> 
 +root@cie-50-205:/opt# rsync -Hvax --delete --verbose --progress \ 
 +--stats --protocol="30" -e "ssh" --rsync-path="sudo rsync" \ 
 +sermn@cie-55-30.uab.cat:/opt/PV4.0 . \ 
 +tee 20160902-1635-rsync-pv40.log                                           
 + 
 +opening connection using: ssh -l sermn cie-55-30.uab.cat "sudo rsync" --server --sender -vvlHogDtprxe.iLsfx . /opt/PV4.0  (10 args) 
 +sermn@cie-55-30.uab.cat's password:  
 + 
 +receiving file list ...  
 +expand file_list to 4000 bytes, did move 
 +expand file_list to 8000 bytes, did move 
 +expand file_list to 16000 bytes, did move 
 +expand file_list to 32000 bytes, did move 
 + 7100 files... 
 +expand file_list to 64000 bytes, did move 
 + 11100 files... 
 + 14000 files... 
 +
 +
 + 150300 files... 
 + 153000 files... 
 +154559 files to consider 
 +deleting in PV4.0 
 +delta-transmission enabled 
 +PV4.0/ 
 +PV4.0/JacORB-2.2.3/ 
 +PV4.0/JacORB-2.2.3/bin/ 
 +
 +
 +PV4.0/prog/wobble/pp_drx_X 
 +            765 100%   62.26kB/   0:00:00 (xfr#134271, to-chk=6/154559) 
 +PV4.0/prog/wobble/pulsprog_X 
 +            676 100%   55.01kB/   0:00:00 (xfr#134272, to-chk=5/154559) 
 +PV4.0/prog/xtip/xtip 
 +              0   0%    0.00kB/   0:00:00  PV4.0/prog/wobble/pp_birds => PV4.0/prog/wobble/pulsprog_X 
 +      2,826,728 100%   10.74MB/   0:00:00 (xfr#134273, to-chk=3/154559) 
 +total: matches=0  tag_hits=0  false_alarms=0 data=38271461531 
 + 
 +rsync[23982] (receiver) heap statistics: 
 +  arena:       10649600   (bytes from sbrk) 
 +  ordblks:            4   (chunks not in use) 
 +  smblks:             0 
 +  hblks:              4   (chunks from mmap) 
 +  hblkhd:       2899968   (bytes from mmap) 
 +  allmem:      13549568   (bytes from sbrk + mmap) 
 +  usmblks:            0 
 +  fsmblks:            0 
 +  uordblks:     9689920   (bytes used) 
 +  fordblks:      959680   (bytes free) 
 +  keepcost:      959344   (bytes in releasable chunk) 
 + 
 +rsync[21101] (generator) heap statistics: 
 +  arena:       10649600   (bytes from sbrk) 
 +  ordblks:            2   (chunks not in use) 
 +  smblks:             2 
 +  hblks:              4   (chunks from mmap) 
 +  hblkhd:       2899968   (bytes from mmap) 
 +  allmem:      13549568   (bytes from sbrk + mmap) 
 +  usmblks:            0 
 +  fsmblks:           64 
 +  uordblks:     9362192   (bytes used) 
 +  fordblks:     1287408   (bytes free) 
 +  keepcost:     1287072   (bytes in releasable chunk) 
 + 
 +Number of files: 154,559 (reg: 134,334, dir: 20,022, link: 203) 
 +Number of regular files transferred: 134,273 
 +Total file size: 38,292,509,630 bytes 
 +Total transferred file size: 38,271,461,531 bytes 
 +Literal data: 38,271,461,531 bytes 
 +Matched data: 0 bytes 
 +File list size: 3,443,124 
 +Total bytes sent: 2,148,384 
 +Total bytes received: 38,284,805,277 
 + 
 +sent 2,148,384 bytes  received 38,284,805,277 bytes  10,181,346.54 bytes/sec 
 +total size is 38,292,509,630  speedup is 1.00 
 +</file> 
 + 
 +==== Verificació ====
  
 +^ Tipus de fitxer    Ordinador\\ actual  ^  Nou\\ ordinador  ^
 +| Fitxer normal       134334 |  134334 :+: |
 +| Carpeta              20022 |   20022 :+: |
 +| Enllaç simbòlic        203 |     203 :+: |
  
informatica/hp_z240mt_biospec_paravision.txt · Last modified: 2017/08/17 10:26 by miquel