User Tools

Site Tools


informatica:hp_z400_600_topspin363_2

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Next revision
Previous revision
Last revision Both sides next revision
informatica:hp_z400_600_topspin363_2 [2021/08/19 12:25]
miquel created
informatica:hp_z400_600_topspin363_2 [2021/08/30 15:43]
miquel [PENDENT: Configuració del MICS]
Line 1: Line 1:
-====== Configuració del TopSpin ======+====== Avance III 600 MHz - Configuració del TopSpin ======
  
 Aquesta és la llista de tasques de configuració a rer per completar la instal·lació i configuració del TopSpin: Aquesta és la llista de tasques de configuració a rer per completar la instal·lació i configuració del TopSpin:
  
-  * FET edprobe+  * :ok: edprobe
     * comprover quina sonda s'ha reconegut, i copiar els fitxers de la sonda que no està muntada     * comprover quina sonda s'ha reconegut, i copiar els fitxers de la sonda que no està muntada
-  * FET expinstall+  * :ok: expinstall
     * copiar els parameter sets ''~/par/user''     * copiar els parameter sets ''~/par/user''
-  * FIXME edprosol+  * :ok: edprosol
     * comprovar si es poden importar els valors de la darrera instal·lació.     * comprovar si es poden importar els valors de la darrera instal·lació.
-  * FET pulse programs+  * :ok: pulse programs
     * copiar els fitxers de la darrera instal·lació.     * copiar els fitxers de la darrera instal·lació.
-  * FET pulse shapes+  * :ok: pulse shapes
     * copiar els fitxers de la darrera instal·lació.     * copiar els fitxers de la darrera instal·lació.
-  * FIXME iconnmr+  * :fail: **PENDENT** iconnmr
     * importar/copiar els fitxers de la darrera instal·lació.     * importar/copiar els fitxers de la darrera instal·lació.
  
 ===== Edprobe ===== ===== Edprobe =====
  
-Copio els fitxers de configuració de la sonda TBI i comprova que apareix a ''epprobe''.+Les dues sondes disponibles per aquest espectròmetre són,
  
-<WRAP todo> +  * TXI - PH TXI 600S3 H-C/N-D-05 Z BTO - Z8558 / 0038
-completar. Per exempleafegir el llistat de la carpeta on es vegin els noms dels fitxers copiats, etc. +  * TBI - PH TBI 600S3 H/C-BB-D-05 Z BTO - Z8618 0019
-</WRAP>+
  
 +La primera (TXI) és la que està muntada i el TopSpin la detecta via PICS. Per configurar la segona sonda (TBI) copio els fitxers de configuració i comprovo que ja apareix a ''edprobe''.
 +
 +Els fitxers de configuració actuals són,
 +
 +<file>
 +$ pwd
 +/opt/topspin3.6.3/conf/instr/probeheads
 +
 +$ ls -l
 +total 32
 +-rw-rw-rw-. 1 sermnadmin sermnadmin 10111 Aug 19 14:02 Z8558_0038.par
 +-rw-rw-rw-. 1 sermnadmin sermnadmin   726 Aug 13 09:47 Z8558_0038.ph
 +-rw-rw-rw-. 1 sermnadmin sermnadmin  9719 Aug 12 11:42 Z8618_0019.par
 +-rw-rw-rw-. 1 sermnadmin sermnadmin  1153 Jul  1  2020 Z8618_0019.ph
 +</file>
 ===== Expinstall ===== ===== Expinstall =====
  
Line 272: Line 286:
  
 Executo la comanda ''rsh'' per carregar un dels fitxers de shims més actuals. s'0bre la finestra per seleccionar el fitxer a carregar, trio un i el TopSpin el llegeix sense problemes. Executo la comanda ''rsh'' per carregar un dels fitxers de shims més actuals. s'0bre la finestra per seleccionar el fitxer a carregar, trio un i el TopSpin el llegeix sense problemes.
 +
 +===== PENDENT: Configuració del MICS =====
 +
 +Comprovo que MICS ha creat els fitxers ''mics.sh'' i ''mics.csh'' dins ''/etc/profile.d'' per tal que el programa s'executi automàticament cada cop que un usuari obri una sessió.
 +
 +<WRAP todo>
 +Caldrà afegir/completar les següents dades:
 +
 +  * cryoshims actuals
 +  * cryoshims anterior
 +  * registre de lectures anteriors de LHE
 +  * registre de recàrregues de LHE
 +  * registre de recàrregues de LIN
 +
 +</WRAP>
 +
 +Les dades de l'imant són:
 +
 +<file>
 +$ cat /opt/topspin3.6.3/conf/instr/spect/uxnmr.par
 +...
 +##$ConsolePnSn= <P/N H03128OB - S/N 0082>
 +---
 +##$MagnCoilPnSn= <BZH 286/600/70D>
 +##$MagnDewarPnSn= <D 262/54-5051>
 +...
 +##$OrderNo= <PH000806>
 +</file>
 +
 +però quan les entro al formulari per descarregar-me el fitxer BIS, em surt el missatge "BIS file for magnet no 286 / cryostat 5051 not found", de forma que l'hauré de crear manualment.
 +
 +Obro la pàgina ([[https://www.bruker.com/protected/en/services/software-downloads/nmr/mics-support---upgrades/manual-bis-file-creation.html | Manually create BIS File (old systems),]] trio l'opció ''BZH system (4K only)'', i entro el número de l'imant (286) i del criostat (5051). Llavors apareix un avís en pantalla,
 +
 +<file>
 +BIS file for magnet no 286 / cryostat 5051
 +
 +Note:
 +manually creating a BIS file should be done for OLD systems only (e.g. no BIS available for download).
 +Do not attempt to use this function for systems with active cooling and/or liquefaction technology!
 +</file>
 +
 +com que no se'ns aplica, premo el botó <key>Continue</key> i a la pantalla següent es mostren els paràmetres de l'imant i del criostat. Comprovo que coincideixen amb els de la documentació impresa, i premo el botó <key>Continue</key>.
 +
 +Llavors s'obre un nou formulari amb un avís,
 +
 +<file>
 +BIS Parameter Definition
 +
 +This form must be used for NMR magnets only.
 +
 +Please do this very carefully.
 +Parameters should be entered based on magnet manual and type label. Entering wrong data might result in erroneous indications and/or false alarms in system monitoring.
 +</file>
 +
 +Després de llegir l'avís, empleno el formulari amb les dades tècniques que manquen,
 +
 +^ Magnet                                       ||
 +| Magnet BZH Number                       286 |
 +| Frequency                           600 MHz |
 +| Cryobore                      |         70 mm |
 +| Design Letter                             D |
 +| Design Version                |             3 |
 +^ Cryostat                                     ||
 +| Cryostat Serial                        5051 |
 +| Dewar Type                    |          D262 |
 +| RT Bore                               54 mm |
 +^ Helium                                       ||
 +| He Total Volume                       159 L |
 +| He Holdtime                        130 days |
 +| He Boil-Off                         40 mL/h |
 +^ Nitrogen                                     ||
 +| N2 Total Volume                       172 L |
 +| N2 Holdtime                         17 days |
 +| N2 Boil-Off                        400 mL/h |
 +| N2 Vessel Height              |       1020 mm |
 +^ Helium Sensor                                ||
 +| Part Number                    HZ10362 / 00 |
 +| Min. Allowed Level            |          46 % |
 +| Min. Level Energizing                   76% |
 +| Active Length                        700 mm |
 +^ He level graph                               ||
 +| Point1 Level                  |           0 % |
 +| Point1 Volume                          10 L |
 +| Point1 Level                  |          37 % |
 +| Point1 Volume                          20 L |
 +| Point1 Level                  |         100 % |
 +| Point1 Volume                         144 L |
 +^ Nitrogen Sensor (if present)                 ||
 +| Part Number                    n.a          |
 +| Min. Allowed Level            |             % |
 +| Active Length                            mm |
 +
 +i premo el botó <key>Continue</key> per continuar. L'aplicació, després de comprovar les dades entrades, indica que són correctes i que ja es pot generar el fitxer BIS ("all fields are valid. Please check again before creating the BIS file").
 +
 +Premo el botó <key>Create BIS</key> i es genera i em descarrego el fitxer ''286_5051.dat'' que hauré d'importar al MICS.
 +
 +Instal·lo i configuro la darrera versió del MICS (2.09i, juny de 2021), i importo el fitxer BIS de l'imant. Quan finalitza la instal·lació, el programa conté la major part de les dades de l'imant.
 +
 +===== PENDENT: Configuració de l'IconNMR =====
 +
 +<WRAP todo>
 +Documentar la configuració de l'IconNMR.
 +</WRAP>
  
 ===== PENDENT: Instal·lació del gestor de llicències CodeMeter ===== ===== PENDENT: Instal·lació del gestor de llicències CodeMeter =====
informatica/hp_z400_600_topspin363_2.txt · Last modified: 2021/08/31 10:34 by miquel