SeRMN Wiki

User Tools

Site Tools

You are here: sermn_wiki » informatica » hp_z230_400sb_topspin363_2
Trace: • hp_dc5800sff_pau • esbos_116 • hp_z230_400sb_topspin363_1 • seguretat • hp_z400_600_centos7_1
informatica:hp_z230_400sb_topspin363_2

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
Next revision 		Previous revision
informatica:hp_z230_400sb_topspin363_2 [2021/08/25 11:35]
miquel [Configuració dels paràmetres del client i sistema] 		informatica:hp_z230_400sb_topspin363_2 [2021/08/26 17:06] (current)
miquel [TopShim]
Line 5: Line 5:
   * :ok: edprobe   * :ok: edprobe
     * copiar els fitxers de configuració de les sondes i seleccionar la sonda TBI que està muntada     * copiar els fitxers de configuració de les sondes i seleccionar la sonda TBI que està muntada
-  * :fail: expinstall+  * :ok: expinstall
     * copiar els parameter sets ''~/par/user''     * copiar els parameter sets ''~/par/user''
-  * :fail: edprosol +  * :ok: prosol 
-    * comprovar si es poden importar els valors de la darrera instal·lació. +    * copiar els valors de la darrera instal·lació. 
-  * :fail: pulse programs+  * :ok: pulse programs
     * copiar els fitxers de la darrera instal·lació.     * copiar els fitxers de la darrera instal·lació.
-  * :fail: pulse shapes+  * :ok: pulse shapes
     * copiar els fitxers de la darrera instal·lació.     * copiar els fitxers de la darrera instal·lació.
-  * :fail: **PENDENT** iconnmr +  * :ok: compilació dels programes AU amb ''cplbruk all'' i ''cpluser all'' 
-    * importar/copiar els fitxers de la darrera instal·lació.+  * :fail: Variable Temperature Unit (VTU) & EdTE 
 +    * la comanda ''edte'' dona un error i la finestra de control de la VTU s'obre però no conté res. 
 +    * **Aquest error es resol instal·lant la versió 3.6.4 del TopSpin.** 
 +  * :ok: topshim 
 +    * no es pot executar fins que es defineixin els pulsos de 2H al PROSOL 
  
 ===== Edprobe ===== ===== Edprobe =====
  
-Les dues sondes disponibles per aquest espectròmetre són,+Les tres sondes disponibles per aquest espectròmetre són,
  
 ^ Nickname                ^ Probe ID        ^ Description                                ^ ^ Nickname                ^ Probe ID        ^ Description                                ^
Line 151: Line 156:
 found /usr/diskless found /usr/diskless
  
-Every non-Bruker file in /home/sermnadmin/.topspin-cie-56-18.uab.cat/ will be saved: +Every non-Bruker file in /home/sermnadmin/.topspin-cie-54-214.uab.cat/ will be saved: 
  
 Every non-Bruker file in /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/au/src/ will be saved:  Every non-Bruker file in /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/au/src/ will be saved: 
Line 160: Line 165:
 Now writing zip file /opt/topspin3.6.3/nmr_backup/extractedDirectories.zip1... Now writing zip file /opt/topspin3.6.3/nmr_backup/extractedDirectories.zip1...
  
-Every non-Bruker file in /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/lists/base_info/ will be saved:  +[...]
- +
-now extracting from dir /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/lists/base_info/... +
-  +
- +
-[..]  +
- +
-Every non-Bruker file in /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/lists/vd/ will be saved:  +
- +
-now extracting from dir /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/lists/vd/... +
-  +
- +
-Every non-Bruker file in /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/lists/vp/ will be saved:  +
- +
-now extracting from dir /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/lists/vp/... +
-  +
- +
-Every non-Bruker file in /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/lists/vt/ will be saved:  +
- +
-now extracting from dir /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/lists/vt/... +
-  +
- +
-Every non-Bruker file in /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/lists/wave/ will be saved:  +
- +
-now extracting from dir /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/lists/wave/... +
-  +
- +
-Now writing zip file /opt/topspin3.6.3/nmr_backup/extractedDirectories.zip7... +
- +
-Every non-Bruker file in /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/par/ will be saved:  +
- +
-now extracting from dir /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/par/... +
-  +
- +
-Now writing zip file /opt/topspin3.6.3/nmr_backup/extractedDirectories.zip8... +
- +
-Every non-Bruker file in /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/py/ will be saved:  +
- +
-now extracting from dir /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/py/... +
-  +
- +
-Now writing zip file /opt/topspin3.6.3/nmr_backup/extractedDirectories.zip9...+
  
 Now writing zip file /opt/topspin3.6.3/nmr_backup/nmr_backup_sermnadmin_20210812-1137.zip... Now writing zip file /opt/topspin3.6.3/nmr_backup/nmr_backup_sermnadmin_20210812-1137.zip...
Line 210: Line 174:
 The backup file The backup file
  
-/opt/topspin3.6.3/nmr_backup/nmr_backup_sermnadmin_20210812-1137.zip+/opt/topspin3.6.3/nmr_backup/nmr_backup_sermnadmin_20210826-1027.zip
  
 has been generated! has been generated!
Line 217: Line 181:
 </file> </file>
  
-===== Còpia dels fitxers a les carpetes "exp/stan/nmr/*/user/" =====+===== Còpia dels fitxers de PROSOL ===== 
 + 
 +Copio els fitxers que hi ha a la carpeta ''~topspin/conf/instr/spect/prosol'' de la darrera instal·lació del TopSpin, la 3.6.1. 
 + 
 +===== Còpia dels fitxers a les carpetes "~topspin/exp/stan/nmr/*/user/" =====
  
-Copio els fitxers que hi ha a les carpetes ''exp/stan/nmr/*/user/'' de les dues darreres instal·lacions del TopSpin, la 3.5 perquè és la que més s'ha fet servir, i la 3.6 instal·lada al maig per si hi hagués algun fitxer nou.+Copio els fitxers que hi ha a les carpetes ''exp/stan/nmr/*/user/'' de les dues darreres instal·lacions del TopSpin, la 3.6.1 instal·lada al maig perquè és la més recent, i la 3.5 per si de cas conté algun fitxer que no es va importar a la 3.6.1.
  
 ==== exp/stan/nmr/au/src/user ==== ==== exp/stan/nmr/au/src/user ====
Line 241: Line 209:
   * **PENDENT** Copio els fitxers de /mnt/old-opt/topspin/3.5pl6   * **PENDENT** Copio els fitxers de /mnt/old-opt/topspin/3.5pl6
  
 +===== Compilació dels programes AU =====
 +
 +Executo les comandes ''cplbruk all'' per compilar els programes AU de Bruker, i ''cpluser all'' per compilar els de la carpeta ''user''. També es pot fer servir la comanda ''compileall'' per compilar-los tots alhora.
 ===== Configuració dels paràmetres del client i sistema ===== ===== Configuració dels paràmetres del client i sistema =====
  
Line 267: Line 238:
 ^ Central Hotline E-Mail *    | <oscar.benitez@bruker.com>               | ^ Central Hotline E-Mail *    | <oscar.benitez@bruker.com>               |
 ^ System Info                                                           || ^ System Info                                                           ||
-^ Order No. *                 | FIXME                                    |+^ Order No. *                 | Instal·lat al 1993                       |
 ^ Contract Service No         | ---                                      | ^ Contract Service No         | ---                                      |
 ^ System Type                 | Avance III 400 MHz SB - SeRMN, UAB       | ^ System Type                 | Avance III 400 MHz SB - SeRMN, UAB       |
-^ Console Part and Serial No  | FIXME                                    |+^ Console Part and Serial No  | H03128OB / Var 0.00 & 0122 / ECL 01      |
 ^ Coil                        | BZH 161 40 70B                           | ^ Coil                        | BZH 161 40 70B                           |
 ^ Dewar                       | D 105 52 1275                            | ^ Dewar                       | D 105 52 1275                            |
-^ Shim System Offset *        | FIXME                                    |+^ Shim System Offset *        | 769 mm from magnet top / 768 mm          |
 ^ Shim System Angle           | ---                                      | ^ Shim System Angle           | ---                                      |
 ^ CryoProbe Order No.         | ---                                      | ^ CryoProbe Order No.         | ---                                      |
 ^ Location                    | Servei de Ressonància Magnètica Nuclear  | ^ Location                    | Servei de Ressonància Magnètica Nuclear  |
-^ Register No.                | FIXME                                    |+^ Register No.                |                                          |
  
 * Required Fields * Required Fields
Line 297: Line 268:
 Executo la comanda ''rsh'' per carregar un dels fitxers de shims més actuals. s'0bre la finestra per seleccionar el fitxer a carregar, trio un i el TopSpin el llegeix sense problemes. Executo la comanda ''rsh'' per carregar un dels fitxers de shims més actuals. s'0bre la finestra per seleccionar el fitxer a carregar, trio un i el TopSpin el llegeix sense problemes.
  
 +===== TopShim =====
 +
 +Un cop configurat PROSOL, executo la comanda ''topshim'' i funciona sense problemes.
 +
 +===== PROBLEMA - Unitat de temperatura (VTU) =====
 +
 +Provo d'obrir amb la comanda ''edte'' la finestra de control de la Unitat de temperatura (VUT) i em dona un error,
 +
 +<file>
 +Command table does not exist
 +cmdtab_edte.prop
 +(Original message = Command table does not exist
 +cmdtab_edte.prop)
 +
 +====================================================
 +25 August 2021 15:13:17.353 +0200
 +Topspin Version  = TopSpin 3.6.3 (of 2021-01-04 15:18:28),build 311
 +OS Name          = Linux 3.10.0-1160.25.1.el7.x86_64
 +JVM Version      = 1.8.0_202 (32 bit) Oracle Corporation
 +JVM Total memory = 235 MB
 +JVM Free  memory = 155 MB
 +
 +Command table does not exist
 +cmdtab_edte.prop
 +java.lang.reflect.InvocationTargetException
 + at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method)
 + at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(NativeMethodAccessorImpl.java:62)
 + at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAccessorImpl.java:43)
 + at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:498)
 + at de.bruker.nmr.mfw.base.CmdThreadImpl.executeMethod(CmdThreadImpl.java:652)
 + at de.bruker.nmr.mfw.base.CmdThreadImpl.doJmethod(CmdThreadImpl.java:565)
 + at de.bruker.nmr.mfw.base.CmdThreadImpl.exec(CmdThreadImpl.java:514)
 + at de.bruker.nmr.mfw.base.CmdThreadImpl.run(CmdThreadImpl.java:494)
 +Caused by: de.bruker.nmr.mfw.base.CommandTableDoesNotExistsException: Command table does not exist
 +cmdtab_edte.prop
 + at de.bruker.nmr.mfw.base.Comint.<init>(Comint.java:91)
 + at de.bruker.nmr.sc.vtu.ContPanel.<init>(ContPanel.java:81)
 + at de.bruker.nmr.sc.vtu.Starter.createApplFrame(Starter.java:176)
 + ... 8 more
 +</file>
 +
 +i la finestra que s'obre no conté res. Comprovo que hi ha un fitxer amb aquest nom
 +
 +<file>
 +# ls -l /opt/topspin3.6.3/classes/prop/cmdtab_edte.prop 
 +-rw-rw-rw-. 1 nmrsu nmrsu 2427 Jan  4  2021 /opt/topspin3.6.3/classes/prop/cmdtab_edte.prop
 +</file>
 +
 +Comprovo els permisos dels fitxers a ''/opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/lists/eurotherm'' i trobo que el fitxer ''EdteLogSettings.txt'' té permisos incorrectes,
 +
 +<file>
 +# ls -ld /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/lists/eurotherm/
 +drwxrwxrwx. 7 nmrsu nmrsu 95 Aug 25 11:08 /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/lists/eurotherm/
 +
 +# ls -l /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/lists/eurotherm/                                                                                      
 +total 4
 +drwxrwxrwx. 2 nmrsu nmrsu  44 Jun  7  2019 config
 +drwxrwxrwx. 2 nmrsu nmrsu   6 Aug 23 13:47 corr
 +-rw-rw-rw-. 1  1003  1003 345 Aug 21  2019 EdteLogSettings.txt
 +drwxrwxrwx. 2 nmrsu nmrsu   6 Aug 23 13:47 hex
 +drwxrwxrwx. 2 nmrsu nmrsu   6 Aug 23 13:47 record
 +drwxrwxrwx. 2 nmrsu nmrsu   6 Aug 23 13:47 tcf
 +</file>
 +
 +El corregeixo, però això no resol el problema,
 +
 +<file>
 +# chown nmrsu:nmrsu /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/lists/eurotherm/EdteLogSettings.txt 
 +
 +# ls -l /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/lists/eurotherm/EdteLogSettings.txt 
 +-rw-rw-rw-. 1 nmrsu nmrsu 345 Aug 21  2019 /opt/topspin3.6.3/exp/stan/nmr/lists/eurotherm/EdteLogSettings.txt
 +</file>
 +
 +<WRAP important>
 +**Aquest error es resol instal·lant la versió 3.6.4 del TopSpin**
 +
 +<blockquote>
 +4.1   Bug Fixes in TopSpin
 +
 +  * SKB-230: Fixed an error in edte stating that BVT units were not supported
 +
 +<cite>TopSpin. Release Letter 3.6.4- User Manual Version 003. July 19, 2021.</cite>
 +</blockquote>
 +</WRAP>
  
 ===== PENDENT: Instal·lació del gestor de llicències CodeMeter ===== ===== PENDENT: Instal·lació del gestor de llicències CodeMeter =====
informatica/hp_z230_400sb_topspin363_2.1629884139.txt.gz · Last modified: 2021/08/25 11:35 by miquel

Page Tools

Donate Powered by PHP Valid HTML5 Valid CSS Driven by DokuWiki