User Tools

Site Tools


informatica:hp_z240mt_biospec_paravision

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
Next revision
Previous revision
informatica:hp_z240mt_biospec_paravision [2016/09/02 16:10]
miquel [Verificació]
informatica:hp_z240mt_biospec_paravision [2017/08/17 10:26] (current)
miquel [Tranferència dels ParaVision 4.0, 5.0 i 5.1]
Line 1: Line 1:
-====== Tranferència del ParaVision 4.0, 5.0 i 5.1 ======+====== Tranferència dels ParaVision 4.0, 5.0 i 5.1 ======
  
-En comptes d'instal·lar les diferents versions del ParaVision des dels DVD d'instal·lació, provo a tranferir les carpetes de les diferents versions del ParaVision instal·lades a l'estació de treball HP xw4100 actual,+En comptes d'instal·lar les diferents versions del ParaVision des dels DVD d'instal·lació, provo a tranferir les carpetes de les diferents versions del ParaVision instal·lades a l'estació de treball HP xw4300 actual,
  
 ===== Mida de les particions al BioSpec ===== ===== Mida de les particions al BioSpec =====
Line 82: Line 82:
 i amb una cerca més exhaustiva a Internet trobo que el problema és que la versió de //rsync// a l'estació de treball del BioSpec és massa vella i que no és compatible amb el protocol de la versió de //rsync// a la nova estació de treball. Per resoldre el problema cal indicar a aquesta darrera que empri una versió anterior del protocol fent servir l'opció ''--protocol="30"''. i amb una cerca més exhaustiva a Internet trobo que el problema és que la versió de //rsync// a l'estació de treball del BioSpec és massa vella i que no és compatible amb el protocol de la versió de //rsync// a la nova estació de treball. Per resoldre el problema cal indicar a aquesta darrera que empri una versió anterior del protocol fent servir l'opció ''--protocol="30"''.
  
-===== Transferència del ParaVision 5.0 =====+===== Transferència del PV 5.0 =====
  
-==== Transferència incomplerta dels fitxers ====+==== Transferència incompleta ====
  
 <file> <file>
Line 167: Line 167:
  
 Els missatges del tipus //opendir(...): Permission denied// indiquen que l'usuari //sermn// a l'ordinador del BioSpec no té permís per accedir a tots els fitxers i/o carpetes. Em connecto a l'ordinador i comprovo que efectivament hi ha carpetes amb permisos restringits a les que no pot accedir l'usuari //sermn//. Els missatges del tipus //opendir(...): Permission denied// indiquen que l'usuari //sermn// a l'ordinador del BioSpec no té permís per accedir a tots els fitxers i/o carpetes. Em connecto a l'ordinador i comprovo que efectivament hi ha carpetes amb permisos restringits a les que no pot accedir l'usuari //sermn//.
-===== Transferència del ParaVision 5.1 ===== 
  
-==== Transferència incomplerta dels fitxers ====+===== Transferència del PV 5.1 ===== 
 + 
 +==== Transferència incompleta ====
  
 Inicio la transferència de la carpeta ///opt/Pv5.1// Inicio la transferència de la carpeta ///opt/Pv5.1//
Line 291: Line 292:
 Alternativament podria haver fet servir algunes de les solucions descrites a [[http://unix.stackexchange.com/questions/92123/rsync-all-files-of-remote-machine-over-ssh-without-root-user | rsync all files of remote machine over SSH without root user?]] Alternativament podria haver fet servir algunes de les solucions descrites a [[http://unix.stackexchange.com/questions/92123/rsync-all-files-of-remote-machine-over-ssh-without-root-user | rsync all files of remote machine over SSH without root user?]]
  
-===== Transferència del ParaVision 5.0 =====+===== Transferència del PV 5.0 =====
  
 ==== Transferència completa dels fitxers ==== ==== Transferència completa dels fitxers ====
Line 374: Line 375:
 ==== Verificació ==== ==== Verificació ====
  
-^ Tipus de fitxer    Ordinador\\ actual  ^  Nou ordinador +^ Tipus de fitxer    Ordinador\\ actual  ^  Nou\\ ordinador 
-| Fitxer normal     | 29827                | 29827           +| Fitxer normal        29827 |   29827 :+: 
-| Carpeta           | 4264                 | 4264            +| Carpeta               4264 |    4264 :+: 
-| Enllaç simbòlic   | 139                  | 139             |+| Enllaç simbòlic        139 |     139 :+: |
  
-===== Transferència del ParaVision 5.1 =====+===== Transferència del PV 5.1 =====
  
 ==== Transferència completa dels fitxers ==== ==== Transferència completa dels fitxers ====
Line 473: Line 474:
 ==== Verificació ==== ==== Verificació ====
  
-^ Tipus de fitxer      ^  Ordinador\\ al BioSpec   Nou ordinador\\ pel Biospec  ^ +^ Tipus de fitxer   ^  Ordinador\\ actual   Nou\\ ordinador  ^ 
-| Fitxer normal [1]    |  68141                   | 68192                         +| Fitxer normal     |    68141 |   68192 :-: 
-| Carpeta [2]           11897                   | 11897                         +| Carpeta              11897 |   11897 :+: 
-| Enllaç simbòlic [3]   130                     | 130                           |+| Enllaç simbòlic        130 |     130 :+: |
  
-[1] ''find ./Pv5.1/ -type f | wc -l'' \\ +Per veure quins fitxers hi ha al nou ordinador que no hi són a l'ordinador vell, faig un simulacre (''--dry-run'') de la comanda de transferència amb l'opoció ''--delete'', 
-[2''find ./PV5.1/ -type d | wc -l'' \\ + 
-[3] ''find ./PV5.1-type l | wc -l'' \\+<file> 
 +root@cie-50-205:/opt# rsync -Hvax --dry-run --delete --verbose \ 
 +--progress --stats --protocol="30" -e "ssh"
 +--rsync-path="sudo rsync" sermn@cie-55-30.uab.cat:/opt/Pv5.1 . \ 
 +> 20160902-1618-rsync-pv51.log 
 +</file> 
 + 
 +i comprovo el contingut del fitxer de registre //20160902-1618-rsync-pv51.log// on trobo els fitxers de més, 
 + 
 +<file> 
 +opening connection using: ssh -l sermn cie-55-30.uab.cat "sudo rsync" --server --sender -vvnlHogDtprxe.iLsfx . /opt/Pv 
 +5.1  (10 args) 
 +receiving file list ...  
 +expand file_list to 4000 bytes, did move 
 + 
 +[..] 
 + 
 + 77200 files... 
 + 80100 files... 
 +80168 files to consider 
 +deleting in Pv5.1 
 + 3100 files... 
 + 6200 files... 
 + 
 +[...] 
 + 
 + 67800 files... 
 + 70700 files... 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.upnpctrlserver.15589 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.dataserver.15488 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.dataserver.15450 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.AqRackServer.log 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.18355 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.17892 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.17441 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.17029 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.16751 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.16528 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.15895 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.15774 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.15589 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.15498 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.15488 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.15450 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.15448 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stdout.15441 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.dataserver.15488 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.dataserver.15450 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.AqRackServer.log 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.18355 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.17892 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.17441 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.17029 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.16751 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.16528 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.15895 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.15774 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.15589 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.15498 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.15488 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.15450 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.15448 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/stderr.15441 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.18355 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.17892 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.17441 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.17029 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.16751 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.16528 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.15895 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.15774 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.15589 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.15498 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.15488 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.15450 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.15448 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/cd.15441 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/SetpreServer.ref 
 +deleting Pv5.1/prog/curdir/mri/ParaVision/pvScan/ScanOverview 
 + 77 
 + 80100 
 +delta-transmission enabled 
 +Pv5.1/.checkedLibDeps is uptodate 
 +Pv5.1/.directory is uptodate 
 +Pv5.1/prog/xtip/xtip is uptodate 
 +Pv5.1/pv is uptodate 
 +Pv5.1/topspin is uptodate 
 +total: matches=0  tag_hits=0  false_alarms=0 data=0 
 + 
 +[...] 
 + 
 +Number of files: 80,168 (reg: 68,141, dir: 11,897, link: 130) 
 +Number of regular files transferred:
 +Total file size: 9,971,638,288 bytes 
 +Total transferred file size: 0 bytes 
 +Literal data: 0 bytes 
 +Matched data: 0 bytes 
 +File list size: 1,706,986 
 +Total bytes sent: 16 
 +Total bytes received: 1,705,370 
 + 
 +sent 16 bytes  received 1,705,370 bytes  162,417.71 bytes/sec 
 +total size is 9,971,638,288  speedup is 5,847.14 (DRY RUN) 
 +</file> 
 + 
 +Llavors executo la comanda de forma real (sense l'opció ''--dry-run'') i comprovo de nou el nombre de fitxers als directoris original i còpia, i trobo que ara ja coincideixen: 
 + 
 +^ Tipus de fitxer    Ordinador\\ actual  ^  Nou\\ ordinador  ^ 
 +| Fitxer normal        68141 |   68141 :+: | 
 +| Carpeta              11897 |   11897 :+: | 
 +| Enllaç simbòlic        130 |     130 :+: | 
 + 
 +===== Transferència del PV 4.0 ===== 
 + 
 +==== Transferència completa dels fitxers ==== 
 + 
 +Transfereixo el contingut de la carpeta ///opt/PV4.0// de l'ordinador actual a la nova estació de treball, 
 + 
 +<file> 
 +root@cie-50-205:/opt# rsync -Hvax --delete --verbose --progress \ 
 +--stats --protocol="30" -e "ssh" --rsync-path="sudo rsync" \ 
 +sermn@cie-55-30.uab.cat:/opt/PV4.0 . \ 
 +tee 20160902-1635-rsync-pv40.log                                           
 + 
 +opening connection using: ssh -l sermn cie-55-30.uab.cat "sudo rsync" --server --sender -vvlHogDtprxe.iLsfx . /opt/PV4.0  (10 args) 
 +sermn@cie-55-30.uab.cat's password:  
 + 
 +receiving file list ...  
 +expand file_list to 4000 bytes, did move 
 +expand file_list to 8000 bytes, did move 
 +expand file_list to 16000 bytes, did move 
 +expand file_list to 32000 bytes, did move 
 + 7100 files... 
 +expand file_list to 64000 bytes, did move 
 + 11100 files... 
 + 14000 files... 
 +
 +
 + 150300 files... 
 + 153000 files... 
 +154559 files to consider 
 +deleting in PV4.0 
 +delta-transmission enabled 
 +PV4.0/ 
 +PV4.0/JacORB-2.2.3/ 
 +PV4.0/JacORB-2.2.3/bin/ 
 +
 +
 +PV4.0/prog/wobble/pp_drx_X 
 +            765 100%   62.26kB/   0:00:00 (xfr#134271, to-chk=6/154559) 
 +PV4.0/prog/wobble/pulsprog_X 
 +            676 100%   55.01kB/   0:00:00 (xfr#134272, to-chk=5/154559) 
 +PV4.0/prog/xtip/xtip 
 +              0   0%    0.00kB/   0:00:00  PV4.0/prog/wobble/pp_birds => PV4.0/prog/wobble/pulsprog_X 
 +      2,826,728 100%   10.74MB/   0:00:00 (xfr#134273, to-chk=3/154559) 
 +total: matches=0  tag_hits=0  false_alarms=0 data=38271461531 
 + 
 +rsync[23982] (receiver) heap statistics: 
 +  arena:       10649600   (bytes from sbrk) 
 +  ordblks:            4   (chunks not in use) 
 +  smblks:             0 
 +  hblks:              4   (chunks from mmap) 
 +  hblkhd:       2899968   (bytes from mmap) 
 +  allmem:      13549568   (bytes from sbrk + mmap) 
 +  usmblks:            0 
 +  fsmblks:            0 
 +  uordblks:     9689920   (bytes used) 
 +  fordblks:      959680   (bytes free) 
 +  keepcost:      959344   (bytes in releasable chunk) 
 + 
 +rsync[21101] (generator) heap statistics: 
 +  arena:       10649600   (bytes from sbrk) 
 +  ordblks:            2   (chunks not in use) 
 +  smblks:             2 
 +  hblks:              4   (chunks from mmap) 
 +  hblkhd:       2899968   (bytes from mmap) 
 +  allmem:      13549568   (bytes from sbrk + mmap) 
 +  usmblks:            0 
 +  fsmblks:           64 
 +  uordblks:     9362192   (bytes used) 
 +  fordblks:     1287408   (bytes free) 
 +  keepcost:     1287072   (bytes in releasable chunk) 
 + 
 +Number of files: 154,559 (reg: 134,334, dir: 20,022, link: 203) 
 +Number of regular files transferred: 134,273 
 +Total file size: 38,292,509,630 bytes 
 +Total transferred file size: 38,271,461,531 bytes 
 +Literal data: 38,271,461,531 bytes 
 +Matched data: 0 bytes 
 +File list size: 3,443,124 
 +Total bytes sent: 2,148,384 
 +Total bytes received: 38,284,805,277 
 + 
 +sent 2,148,384 bytes  received 38,284,805,277 bytes  10,181,346.54 bytes/sec 
 +total size is 38,292,509,630  speedup is 1.00 
 +</file> 
 + 
 +==== Verificació ====
  
 +^ Tipus de fitxer    Ordinador\\ actual  ^  Nou\\ ordinador  ^
 +| Fitxer normal       134334 |  134334 :+: |
 +| Carpeta              20022 |   20022 :+: |
 +| Enllaç simbòlic        203 |     203 :+: |
  
informatica/hp_z240mt_biospec_paravision.1472825451.txt.gz · Last modified: 2016/09/02 16:10 by miquel