====== Informació sobre la cua de rutina ====== Pàgina en procés d'actualització. La informació continguda podria no ser acurada i/o actual ===== Descripció breu ===== Si ens heu d'enviar un nombre baix de mostres, segurament no us sortirà a compte comprar els tubs de rmn i els solvents deuterats, En aquests casos, com que les mostres les haurem de preparar nosaltres, per cadascuna de les mostres ens haureu d'indicar, * el solvent en què l'hem de dissoldre, i la solubilitat de la mostra en el solvent triat **(*)**; * la quantitat de mostra a dissoldre, tenint present que el volum final serà aproximadament de 0,6 a 0,7 mil·lilitres; i * qualsevol indicació o precaució a tenir present en la preparació de la mostra. **(*)** Els solvents deuterats són més cars que els no enriquits isotòpicament, per això és convenient que comproveu la solubilitat de la mostra al solvent (versió no deuterada) triat. Alhora, tampoc és raonable sol·licitar-nos un compte al servidor de dades per poder recuperar les vostres dades. És per això que, un cop adquirits els espectres, us els farem arribar per correu electrònic en format de fitxer comprimit. Per ara aquesta pàgina és un recull de diverses informacions d'interès pels usuaris. ===== Facturació dels serveis prestats ===== El cost de l'anàlisi inclourà habitualment els següents conceptes: * la preparació de la mostra, si el realitza el personal del SeRMN (preu fixe per mostra); * la programació dels experiments de RMN (preu fixe per experiment); * el temps d'espectròmetre assignat als teus experiments; i * el temps dedicat pel personal del SeRMN al processament bàsic i a representar els espectres de la teva mostra (preu fixe per espectre). ===== Consulta de la cua de rutina ===== [[http://sermn.uab.cat/cua-rutina/icon_setup.html | L'estat actual de la cua de rutina]] i el [[http://sermn.uab.cat/cua-rutina/icon_history.html | registre d'experiments més recents]] es poden consultar on-line. ===== Descripció detallada del funcionament de la cua de rutina ===== El fitxer {{:informacio_usuaris:sermn_informacio_rutina_industria-20061031.pdf| Informació de la Cua de Rutina per Indústria (v. 2006-10-31)}} conté una breu descripció del funcionament de la cua de rutina per empreses, així com el cost de cadascun dels tipus d'espectres i d'altres tasques com la preparació de les mostres i la representació dels espectres adquirits **(COMPTE! les tarifes esmentades al document són de 2006.)** ==== Tarifes de la cua de rutina ==== Les tarifes oficials per empreses es poden consultar a la web del SeRMN: * [[http://sct.uab.cat/sermn/content/tarifa-externa | Tarifa per empreses]] Les empreses pertanyents al [[http://www.uab.cat/web/entitats/empreses-1345676360560.html | Parc de Recerca UAB (PRUAB)]] es beneficien d'una tarifa reduïda: * [[http://sct.uab.cat/sermn/content/tarifa-mixta-empreses-pruab | Tarifa per empreses del PRUAB]] ==== Condicions de funcionament ==== === Horari de càrrega === El robot es carrega de dilluns a divendres, a les 10:00, 13:00 i 17:00 hores. El personal del SeRMN podrà carregar-lo excepcionalment més cops, per exemple, quan ho pugui combinar amb les altres tasques que estigui realitzant, quan el robot estigui parat, en casos de mostres que requereixen l'adquisició immediata de l'espectre, etcètera. === Experiments disponibles === ^ Monodimensionals ^ Bidimensionals ^ | 1H | 1H-1H COSY | | 13C | 1H-1H NOESY | | DEPT-135 | 1H-1H TOCSY | | 31P | 1H-13C HSQC | | 31P{1H} | 1H-13C HSQCed | | | 1H-13C HMBC | Per més informació sobre aquests experiments i la informació que proporcionen podeu consultar els //Exemples d'experiments (en el 360 MHz)// disponibles a [[http://sct.uab.cat/sermn/content/manuals | Manuals del SeRMN.]] === Condicions de les mostres i tubs per la cua de rutina === Les condicions que han de complir les mostres que portis a la cua de rutina venen condicionades pel fet que els tubs són carregats a l'espectròmetre per un robot bescanviador de mostres, i perquè l'adquisició es fa de forma automatitzada, sense intervenció de cap operador que pugui adaptar les condicions d'adquisició a les característiques de la mostra. ^ Especificació ^ Condició a complir ^ Actuació en cas d'incompliment ^ ^ Condicions de la mostra ^^^ | Quantitat | La màxima possible | Es programa la mostra **[1]** | | Volum de solvent | aprox. 0,7 ml | Mostra descartada **[2]** | | Alçada de la mostra | aprox. 4 cm | Mostra descartada **[2]** | ^ El tub de rmn ^^^ | Diàmetre extern | 5 mm | Mostra descartada **[3]** | | Llargada mínima del tub | 17 cm | Mostra descartada **[4]** | | Estat del tub | Extrem superior no estarà trencat o esquerdat | Mostra descartada **[5]** | ^ Etiquetat del tub ^^^ | A la part superior del tub o en el tap || Risc de mostra descartada **[6]** | | Els 13 cm inferiors del tub no han de tenir cap tipus d'identificació (escrits, etiquetes enganxades, etcètera) || Mostra descartada **[7]** | **[1]** Procurar no alteraran significativament les condicions de viscositat del solvent. Una major viscositat comporta pics més amples, és a dir, menor resolució. **[2]** La rutina encarregada de millorar l'homogeneïtat del camp magnètic està optimada per un volum de mostra en el rang 0,6-0,8 ml, que corresponen aproximadament a 4±1 cm. Un volum de mostra insuficient comporta que es descarti automàticament la mostra. Les mostres amb un volum excessiu es programen, però l'espectre podria no tenir una qualitat òptima. Per altra banda, utilitzar un excés de dissolvent implica un major cost innecessari de la preparació de la mostra. Al document [[http://sermn.uab.cat/rmn3/pdf/robot/Requisitsmostresrobot.pdf | Requisits de les Mostres per la Cua de Rutina]] trobaràs una plantilla a mida real de les condicions a complir pel tub i mostra. **[3]** Consultar més avall les especificacions mínimes exigides **[4]** El robot bescanviador de mostres no pot manipular correctament tubs amb una llargada inferior a 17 cm. **[5]** L'extrem superior del tub és per on els agafa el robot bescanviador de mostres. Un extrem superior fràgil (trencat o esquerdat) comporta que es descarti el tub. **[6]** S'intentarà programar la mostra. Recorda que has d'escriure al tub el //nom de la mostra// escrit a la butlleta de registre, * usuaris interns: inicials + número d'ordre (entre 001 i 999), * usuaris externs: número d'ordre (entre 001 i 999) i nom de la mostra **[7]** Aquesta és la part del tub en contacte amb el suport del tub (//spinner//) i amb la sonda. Si no es pot netejar fàcilment aquesta part del tub es descartarà la mostra. ==== Espectres de carboni-13 i DEPT-135 ==== En el cas dels espectres de [[http://sermn.uab.cat/rmn3/pdf/expt/13cmultiplicitat.pdf | carboni-13]] (13C) o [[http://sermn.uab.cat/rmn3/pdf/fitxes/dept135360.pdf | DEPT-135]] el cost final dependrà del temps necessari per adquirir l'espectre, que alhora dependrà de, * la quantitat de mostra dissolta. El fitxer {{:informacio_usuaris:a250bacs.13c-dept.acqparam.20051220.pdf | Temps d'acumulació per 13C i DEPT a la Cua de Rutina}} conté una taula resum del nombre d'escombrats/temps d'acumulació recomanats en funció de la quantitat de mostre __dissolta__ al tub. Per exemple, * una concentració de mostra de 40 mg/tub (0,6-0,7 ml) comporta un temps d'adquisició inferior a les 2 hores; mentre que * una concentració de mostra de 20 mg/tub (0,6-0,7 ml) fa que el temps d'acumulació s'allargui fins les 8 hores. * La relació senyal-soroll desitjada. A la taula del punt anterior s'esmenten dues //qualitats// d'espectre, * la //qualitat recerca// és suficient pels espectres de treball: anàlisi rutinari de mostres, control de reaccions, etcètera; mentre que * la //qualitat publicació// és la recomanada per espectres de referència, per exemple, figures de publicacions internes o externes. Per altra banda, cal tenir present que els espectres de 13C s'adquireixin habitualment en condicions no quantitatives (TR < 5*T1, impuls d'excitació de 30°). Adquirir els espectres en condicions semi-quantitatives o quantitatives —és a dir, que hi hagi una major o total proporcionalitat entre la intensitat dels pics i el nombre d'àtoms de 13C— comporta l'ús d'un impuls de 90° i de temps de reciclatge més llargs, per exemple, de 3, 5 ó 10 segons). Això es tradueix en un major temps d'acumulació per un mateix nombre d'escombrats, fet que redunda en un major cost dels espectres. ===== Altres fitxers i enllaços d'interès ===== * {{:informacio_usuaris:sermn_recomanacions_compra_tubs.2008-02-14.pdf| Recomanacions per la compra de tubs de rmn.}} * {{:informacio_usuaris:sermn_especificacions_tubs.2005-10-10.pdf| Especificacions dels tubs de rmn.}} * [[http://www.eurisotop.com/nmr_tubes_and_accessories | euriso-top - NMR Tubes and Accessories]] * [[https://www.sigmaaldrich.com/labware/labware-products.html?TablePage=9579380 | NMR Tubes and Accessories]] Entry page for all nmr glassware at Sigma-Aldrich. * [[https://www.sigmaaldrich.com/labware/labware-products.html?TablePage=109809773 | Economy NMR Tubes for Routine NMR]] Lists all nmr tubes suitable for routine analysis. The nmr frequency should be 200 MHz or higher. * [[https://www.sigmaaldrich.com/labware/labware-products.html?TablePage=109809382 | High Resolution NMR Tubes]] Lists all high-grade nmr tubes suitable for high-resolution analysis. The nmr frequency should be equal or higher than the frequency of the spectrometer you intend to use. * [[http://www.sigmaaldrich.com/catalog/substance/norellstandardseries5mmnmrtubes1234598765 | Sigma-Aldrich - Norell® Standard Series™ 5 mm NMR tubes]] When comparing prices, take into account the number of tubes per package, for instance "5EA" in Z569216-5EA means that there are 5 tubes in the box, while "50EA" in NOR5027-50EA means that you are purchasing a box containing 50 tubes. A recommendation about the tube length: always buy tubes 7- or 8-inches long, and never buy 9-inches tubes because they are way too long and it is too easy to break them when manipulating the tube. Also, it may be easier to recover the samples from within the shorter 7-inches than from 8-inches tubes.