Instal·lació de Topspin 2.1

Copio el contingut del DVD d'instal·lació del Topspin 2.1 al disc dur per tal de fer més ràpida la instal·lació,

[sermnadmin@cie-55-32 Topspin-2.1]$ md5sum ts21.iso 
80f22b9cd6863054326612ca448c7b25  ts21.iso

A continuació, munto el fitxer ISO ¹⁾ com a superusuari,

# mount -t iso9660 -o loop .TopSpin-3.2.3.iso /mnt/iso/
# df -hl | grep iso
/home/sermnadmin/Downloads/Topspin-2.1/TopSpin-2.1.8.iso
                      2.7G  2.7G     0 100% /mnt/iso

Llavors executo el programa autorun per iniciar la instal·lació del Tospin, i marco les opcions,

• Install Bruker software including TopSpin 3.2 and CMC-assist 2.0
• Install GPL licensed GNU GCC 4.5.3 compiler (recommended)

que s'instal·laran a /opt/topspin3.2

Com a setup type trio

• Customized per triar quins mòduls s'instal·len, i a la pantalla següent trio
  • TOPSPIN
  • ICON-NMR Automation
  • NMR-SIM
  • NMR-GUIDE
  • NMR-Data
  • NMR-GLP
• descarto la instal·lació del gestor de llicències FLEXLM perquè ja es va instal·lar amb el Topspin-3

A la pantalla següent em demana si vull importar la configuració d'un dels espectròmetres disponibles a /opt/topspin3.2 i trio que s'importi la configuració de spect definida a la v. 3.2.

Quan em pregunta si vull actualitzar el contingut de la variable global PATH a la nova instal·lació de Topspin. Com que per ara es farà servir aquesta versió del Topspin, faig una còpia de seguretat del fitxer actual (/etc/profile.d/topspin.sh i /etc/profiled.d/topspin.csh) i després trio l'opció d'actualitzar el PATH.

Com a NMR Super User trio nmrsu, que ja es va crear en instal·lar el Topspin-3.2, i llavors entro la constrasenya habitual pel compte d'administrador del Topspin.

Llavors comença la instal·lació dels diferents mòduls i finalitza pocs minuts després sense cap missatge d'error. El fitxer que conté el registre de la instal·lació es pot consultar a /opt/topspin2.1/install.log.

Aquestes són les tasques realitzades,

• executar ha i verificar els mòduls detectats
• cf funciona correctament i el fitxer de configuració final (afegir-ho!) coincideix amb el del Topspin 2.1 de l'ordinador vell
• expinstall
• edhead, edprosol, i la resta de comandes no donen cap problema. Cal importar a mà els parameter sets i altres fitxers de configuració que no s'hagin transferit.
• cplbruk all per compilar tots els programes AU de Bruker.
• cpluser all per compilar tots els programes AU de la carpeta user.

Es fa la calibració (Cortab) dels següents nuclis:

• 1H, 2H, 6Li, 7Li, 11B, 13C, 15N, 19F
• 23Na, 27Al, 29Si, 31P, 39K, 67Zn, 71Ga, 77Se, 79Br, 87Rb, 95Mo
• 103Rh, 111Cd, 113Cd, 119Sn, 127I, 195Pt, 199Hg, 207Pb.