Estació de treball HP xw4300 per l'Avance DPX 500

Aquesta és l'estació de treball originalment instal-lada a l'Avance II 400wb i després substituïda per l'estació de treball HP xw4400 procedent de l'Avance III 400sb. Un cop instal·lada la darrera versió GNU/Linux Debian 7 (aka, Wheezy, oldstable), i les versions 1.3 del Topspin, s'instal·la i configura com a estació de treball de l'espectròmetre Avance DPX 500.

Especificacions del maquinari amb data de 2015-08-20:

root@partedmagic:~# lshw   
partedmagic
    description: Mini Tower Computer
    product: HP xw4300 Workstation (PS988AV)
    vendor: Hewlett-Packard
    serial: CZC5460C75
    width: 32 bits
    capabilities: smbios-2.4 dmi-2.4 smp-1.4 smp vsyscall32
    configuration: boot=normal chassis=mini-tower cpus=1 family=103C_53335X sku=PS988AV uuid=BA800D8B-6656-DA11-BBDA-C25CE9EF0014
  *-core
       description: Motherboard
       product: 0A00h
       vendor: Hewlett-Packard
       physical id: 0
       serial: CZC5460C75
     *-firmware
          description: BIOS
          vendor: Hewlett-Packard
          physical id: 1
          version: 786D3 v01.03
          date: 09/21/2005
          size: 128KiB
          capacity: 960KiB
          capabilities: pci pnp upgrade shadowing cdboot bootselect edd int13floppytoshiba int13floppy360 int13floppy1200 int13floppy720 int5printscreen int9keyboard int14serial int17printer acpi usb ls120boot zipboot biosbootspecification netboot
     *-cpu:0
          description: CPU
          product: Intel(R) Pentium(R) 4 CPU 3.40GHz
          vendor: Intel Corp.
          physical id: 5
          bus info: cpu@0
          version: 15.4.3
          serial: 0000-0F43-0000-0000-0000-0000
          slot: XU1 PROCESSOR
          size: 3400MHz
          capacity: 3400MHz
          width: 64 bits
          clock: 800MHz
          capabilities: boot fpu fpu_exception wp vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 clflush dts acpi mmx fxsr sse sse2 ss ht tm pbe syscall nx x86-64 constant_tsc pebs bts nopl pni dtes64 monitor ds_cpl est cid cx16 xtpr cpufreq
          configuration: id=0
        *-cache:0
             description: L1 cache
             physical id: 7
             slot: Internal L1 Cache
             size: 28KiB
             capacity: 28KiB
             capabilities: burst internal write-through data
        *-cache:1
             description: L2 cache
             physical id: 8
             slot: Cache L2
             size: 2MiB
             capacity: 4MiB
             capabilities: burst internal write-back data
        *-logicalcpu:0
             description: Logical CPU
             physical id: 0.1
             width: 64 bits
             capabilities: logical
        *-logicalcpu:1
             description: Logical CPU
             physical id: 0.2
             width: 64 bits
             capabilities: logical
     *-cpu:1 DISABLED
          description: CPU [empty]
          vendor: Intel
          physical id: 6
          slot: XU1 PROCESSOR 2
     *-memory:0
          description: System Memory
          physical id: 36
          slot: System board or motherboard
        *-bank:0
             description: DIMM DDR2 Synchronous 667 MHz (1.5 ns)
             product: 9905321-038.A00LF
             vendor: JEDEC ID:7F 98 00 00 00 00 00 00
             physical id: 0
             serial: 32E13B8B
             slot: XMM1
             size: 2GiB
             width: 64 bits
             clock: 667MHz (1.5ns)
        *-bank:1
             description: DIMM DDR2 Synchronous [empty]
             vendor: JEDEC ID:
             physical id: 1
             slot: XMM2
        *-bank:2
             description: DIMM DDR2 Synchronous 667 MHz (1.5 ns)
             product: 9905321-038.A00LF
             vendor: JEDEC ID:7F 98 00 00 00 00 00 00
             physical id: 2
             serial: 846B3A8C
             slot: XMM3
             size: 2GiB
             width: 64 bits
             clock: 667MHz (1.5ns)
        *-bank:3
             description: DIMM DDR2 Synchronous [empty]
             vendor: JEDEC ID:
             physical id: 3
             slot: XMM4
     *-memory:1 UNCLAIMED
          description: Flash Memory
          physical id: 37
          slot: System board or motherboard
          capacity: 1MiB
        *-bank UNCLAIMED
             description: Chip FLASH Non-volatile
             physical id: 0
             slot: SYSTEM ROM
             size: 1MiB
             width: 2 bits
     *-memory:2 UNCLAIMED
          physical id: 0
     *-memory:3 UNCLAIMED
          physical id: 2
     *-pci
          description: Host bridge
          product: 82955X Memory Controller Hub
          vendor: Intel Corporation
          physical id: 100
          bus info: pci@0000:00:00.0
          version: 00
          width: 32 bits
          clock: 33MHz
        *-pci:0
             description: PCI bridge
             product: 82955X PCI Express Root Port
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1
             bus info: pci@0000:00:01.0
             version: 00
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: pci pm msi pciexpress normal_decode bus_master cap_list
             configuration: driver=pcieport
             resources: irq:16 ioport:1000(size=4096) memory:e8800000-e8afffff ioport:e0000000(size=136314880)
           *-display:0
                description: VGA compatible controller
                product: RV370 [Radeon X300]
                vendor: Advanced Micro Devices, Inc. [AMD/ATI]
                physical id: 0
                bus info: pci@0000:01:00.0
                version: 00
                width: 32 bits
                clock: 33MHz
                capabilities: pm pciexpress msi vga_controller bus_master cap_list rom
                configuration: driver=radeon latency=0
                resources: irq:42 memory:e0000000-e7ffffff ioport:1000(size=256) memory:e8a00000-e8a0ffff memory:e8000000-e801ffff
           *-display:1 UNCLAIMED
                description: Display controller
                product: RV370 [Radeon X300 SE]
                vendor: Advanced Micro Devices, Inc. [AMD/ATI]
                physical id: 0.1
                bus info: pci@0000:01:00.1
                version: 00
                width: 32 bits
                clock: 33MHz
                capabilities: pm pciexpress bus_master cap_list
                configuration: latency=0
                resources: memory:e8a10000-e8a1ffff
        *-multimedia
             description: Audio device
             product: NM10/ICH7 Family High Definition Audio Controller
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1b
             bus info: pci@0000:00:1b.0
             version: 01
             width: 64 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: pm msi pciexpress bus_master cap_list
             configuration: driver=snd_hda_intel latency=0
             resources: irq:41 memory:e8b00000-e8b03fff
        *-pci:1
             description: PCI bridge
             product: NM10/ICH7 Family PCI Express Port 1
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1c
             bus info: pci@0000:00:1c.0
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: pci pciexpress msi pm normal_decode bus_master cap_list
             configuration: driver=pcieport
             resources: irq:0 ioport:3000(size=4096) memory:e8c00000-e8dfffff ioport:e8e00000(size=2097152)
        *-pci:2
             description: PCI bridge
             product: 82801GR/GH/GHM (ICH7 Family) PCI Express Port 5
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1c.4
             bus info: pci@0000:00:1c.4
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: pci pciexpress msi pm normal_decode bus_master cap_list
             configuration: driver=pcieport
             resources: irq:16 ioport:4000(size=4096) memory:e8500000-e87fffff ioport:e9000000(size=3145728)
           *-network
                description: Ethernet interface
                product: NetXtreme BCM5751 Gigabit Ethernet PCI Express
                vendor: Broadcom Corporation
                physical id: 0
                bus info: pci@0000:28:00.0
                logical name: eth0
                version: 01
                serial: 00:10:18:14:2a:8a
                size: 1Gbit/s
                capacity: 1Gbit/s
                width: 64 bits
                clock: 33MHz
                capabilities: pm vpd msi pciexpress bus_master cap_list rom ethernet physical tp 10bt 10bt-fd 100bt 100bt-fd 1000bt 1000bt-fd autonegotiation
                configuration: autonegotiation=on broadcast=yes driver=tg3 driverversion=3.132 duplex=full firmware=5751-v3.29a ip=192.168.2.7 latency=0 link=yes multicast=yes port=twisted pair speed=1Gbit/s
                resources: irq:16 memory:e8500000-e850ffff memory:e9000000-e900ffff
        *-pci:3
             description: PCI bridge
             product: 82801GR/GH/GHM (ICH7 Family) PCI Express Port 6
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1c.5
             bus info: pci@0000:00:1c.5
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: pci pciexpress msi pm normal_decode bus_master cap_list
             configuration: driver=pcieport
             resources: irq:17 ioport:5000(size=4096) memory:e8200000-e84fffff ioport:e9300000(size=2097152)
           *-network
                description: Ethernet interface
                product: NetXtreme BCM5752 Gigabit Ethernet PCI Express
                vendor: Broadcom Corporation
                physical id: 0
                bus info: pci@0000:3f:00.0
                logical name: eth1
                version: 01
                serial: 00:14:c2:5c:e9:ef
                capacity: 1Gbit/s
                width: 64 bits
                clock: 33MHz
                capabilities: pm vpd msi pciexpress bus_master cap_list ethernet physical tp 10bt 10bt-fd 100bt 100bt-fd 1000bt 1000bt-fd autonegotiation
                configuration: autonegotiation=on broadcast=yes driver=tg3 driverversion=3.132 firmware=5752-v3.10 latency=0 link=no multicast=yes port=twisted pair
                resources: irq:43 memory:e8400000-e840ffff
        *-usb:0
             description: USB controller
             product: NM10/ICH7 Family USB UHCI Controller #1
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1d
             bus info: pci@0000:00:1d.0
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: uhci bus_master
             configuration: driver=uhci_hcd latency=0
             resources: irq:20 ioport:2000(size=32)
        *-usb:1
             description: USB controller
             product: NM10/ICH7 Family USB UHCI Controller #2
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1d.1
             bus info: pci@0000:00:1d.1
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: uhci bus_master
             configuration: driver=uhci_hcd latency=0
             resources: irq:18 ioport:2020(size=32)
        *-usb:2
             description: USB controller
             product: NM10/ICH7 Family USB UHCI Controller #3
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1d.2
             bus info: pci@0000:00:1d.2
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: uhci bus_master
             configuration: driver=uhci_hcd latency=0
             resources: irq:21 ioport:2040(size=32)
        *-usb:3
             description: USB controller
             product: NM10/ICH7 Family USB UHCI Controller #4
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1d.3
             bus info: pci@0000:00:1d.3
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: uhci bus_master
             configuration: driver=uhci_hcd latency=0
             resources: irq:22 ioport:2060(size=32)
        *-usb:4
             description: USB controller
             product: NM10/ICH7 Family USB2 EHCI Controller
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1d.7
             bus info: pci@0000:00:1d.7
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: pm debug ehci bus_master cap_list
             configuration: driver=ehci-pci latency=0
             resources: irq:20 memory:e8b04000-e8b043ff
        *-pci:4
             description: PCI bridge
             product: 82801 PCI Bridge
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1e
             bus info: pci@0000:00:1e.0
             version: e1
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: pci subtractive_decode bus_master cap_list
        *-isa
             description: ISA bridge
             product: 82801GB/GR (ICH7 Family) LPC Interface Bridge
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1f
             bus info: pci@0000:00:1f.0
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: isa bus_master cap_list
             configuration: driver=lpc_ich latency=0
             resources: irq:0
        *-ide
             description: IDE interface
             product: 82801G (ICH7 Family) IDE Controller
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1f.1
             bus info: pci@0000:00:1f.1
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: ide bus_master
             configuration: driver=ata_piix latency=0
             resources: irq:17 ioport:1f0(size=8) ioport:3f6 ioport:170(size=8) ioport:376 ioport:20a0(size=16)
        *-storage
             description: SATA controller
             product: NM10/ICH7 Family SATA Controller [AHCI mode]
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1f.2
             bus info: pci@0000:00:1f.2
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 66MHz
             capabilities: storage msi pm ahci_1.0 bus_master cap_list
             configuration: driver=ahci latency=0
             resources: irq:40 ioport:20d0(size=8) ioport:20e8(size=4) ioport:20d8(size=8) ioport:20ec(size=4) ioport:20b0(size=16) memory:e8b04400-e8b047ff
     *-scsi:0
          physical id: 3
          logical name: scsi0
          capabilities: emulated
        *-disk
             description: ATA Disk
             product: SAMSUNG HD160JJ
             physical id: 0.0.0
             bus info: scsi@0:0.0.0
             logical name: /dev/sda
             version: WU10
             serial: S08HJ1LYA11987
             size: 149GiB (160GB)
             capabilities: partitioned partitioned:dos
             configuration: ansiversion=5 sectorsize=512 signature=9c879c87
           *-volume:0
                description: EXT3 volume
                vendor: Linux
                physical id: 1
                bus info: scsi@0:0.0.0,1
                logical name: /dev/sda1
                version: 1.0
                serial: 96defc23-8eca-4133-96ca-ad245fee257e
                size: 125MiB
                capacity: 125MiB
                capabilities: primary bootable journaled ext3 ext2 initialized
                configuration: created=2005-12-23 15:44:45 filesystem=ext3 label=/boot modified=2015-08-18 10:44:43 mounted=2015-07-13 11:25:31 state=clean
           *-volume:1
                description: EXT3 volume
                vendor: Linux
                physical id: 2
                bus info: scsi@0:0.0.0,2
                logical name: /dev/sda2
                version: 1.0
                serial: 4e23072e-22cf-4ce5-b9fe-4ebc61e6bc74
                size: 15GiB
                capacity: 15GiB
                capabilities: primary journaled ext3 ext2 initialized
                configuration: created=2005-12-23 15:44:39 filesystem=ext3 label=/ modified=2015-08-18 10:44:46 mounted=2015-07-13 11:25:27 state=clean
           *-volume:2
                description: Linux swap volume
                physical id: 3
                bus info: scsi@0:0.0.0,3
                logical name: /dev/sda3
                version: 1
                size: 2047MiB
                capacity: 2047MiB
                capabilities: primary nofs swap initialized
                configuration: filesystem=swap pagesize=4096
           *-volume:3
                description: EXT3 volume
                vendor: Linux
                physical id: 4
                bus info: scsi@0:0.0.0,4
                logical name: /dev/sda4
                version: 1.0
                serial: 0c91115e-85e4-4061-abab-540985bd8894
                size: 131GiB
                capacity: 131GiB
                capabilities: primary journaled ext3 ext2 initialized
                configuration: created=2005-12-23 15:44:46 filesystem=ext3 label=/opt modified=2015-08-18 10:44:42 mounted=2015-07-13 11:25:31 state=clean
     *-scsi:1
          physical id: 4
          logical name: scsi4
          capabilities: emulated
        *-cdrom
             description: DVD writer
             product: DVDRRW GWA-4166B
             vendor: HL-DT-ST
             physical id: 0.0.0
             bus info: scsi@4:0.0.0
             logical name: /dev/cdrom
             logical name: /dev/sr0
             version: 1.03
             serial: [
             capabilities: removable audio cd-r cd-rw dvd dvd-r
             configuration: ansiversion=5 status=nodisc    

Especificacions del processador amb data de 2015-08-20:

root@partedmagic:~# cat /proc/cpuinfo 
processor	: 0
vendor_id	: GenuineIntel
cpu family	: 15
model		: 4
model name	: Intel(R) Pentium(R) 4 CPU 3.40GHz
stepping	: 3
microcode	: 0x5
cpu MHz		: 3400.000
cache size	: 2048 KB
physical id	: 0
siblings	: 2
core id		: 0
cpu cores	: 1
apicid		: 0
initial apicid	: 0
fpu		: yes
fpu_exception	: yes
cpuid level	: 5
wp		: yes
flags		: fpu vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 clflush dts acpi mmx fxsr sse sse2 ss ht tm pbe syscall nx lm constant_tsc pebs bts nopl pni dtes64 monitor ds_cpl est cid cx16 xtpr
bogomips	: 6800.55
clflush size	: 64
cache_alignment	: 128
address sizes	: 36 bits physical, 48 bits virtual
power management:

processor	: 1
vendor_id	: GenuineIntel
cpu family	: 15
model		: 4
model name	: Intel(R) Pentium(R) 4 CPU 3.40GHz
stepping	: 3
microcode	: 0x5
cpu MHz		: 3400.000
cache size	: 2048 KB
physical id	: 0
siblings	: 2
core id		: 0
cpu cores	: 1
apicid		: 1
initial apicid	: 1
fpu		: yes
fpu_exception	: yes
cpuid level	: 5
wp		: yes
flags		: fpu vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 clflush dts acpi mmx fxsr sse sse2 ss ht tm pbe syscall nx lm constant_tsc pebs bts nopl pni dtes64 monitor ds_cpl est cid cx16 xtpr
bogomips	: 6800.55
clflush size	: 64
cache_alignment	: 128
address sizes	: 36 bits physical, 48 bits virtual
power management:

root@partedmagic:~# lscpu
Architecture:          x86_64
CPU op-mode(s):        32-bit, 64-bit
Byte Order:            Little Endian
CPU(s):                2
On-line CPU(s) list:   0,1
Thread(s) per core:    2
Core(s) per socket:    1
Socket(s):             1
NUMA node(s):          1
Vendor ID:             GenuineIntel
CPU family:            15
Model:                 4
Model name:            Intel(R) Pentium(R) 4 CPU 3.40GHz
Stepping:              3
CPU MHz:               3400.000
BogoMIPS:              6800.55
L1d cache:             16K
L2 cache:              2048K
NUMA node0 CPU(s):     0,1

La targeta gràfica que ve per defecte es una nVidia Quadro FX 540 (NV43GL), amb 128 MiB de memòria. El controlador que es fa servir és el noveau???.

• Manual: (search Google for “quadro fx 560 type:pdf”)
• http://www.techpowerup.com/gpudb/1334/quadro-fx-540.html
• http://www8.hp.com/h20195/v2/GetPDF.aspx/c04287946.pdf
• http://www.gpureview.com/Quadro-FX-540-card-346.html
• http://www.hardwaresecrets.com/everything-you-need-to-know-about-the-pci-express/
• http://www.overclock.net/a/the-final-answer-to-the-controversial-pcie-x16-version-compatibility
• http://www.ni.com/white-paper/4037/en/
• http://tecnovortex.com/la-biblia-de-las-placas-pci-express/

El ventilador d'aquesta targeta no funciona, i això fa que la GPU s'escalfi i que l'ordinador s'aturi. Provisionalment la substitueixo por una Dell ATI Radeon X600 PCI-e 128MB DVI Video Card H9142 (128MB PCI-e Graphics Card with S-Video and DVI-I Dual Link connectors) recuperada d'un ordinador Dell Optiplex GX620 en desús.

• http://www.techpowerup.com/gpudb/1815/radeon-x600-se.html
• http://www.cnet.com/products/ati-radeon-x600-graphics-card-radeon-x600-128-mb/specs/
• https://en.wikipedia.org/wiki/Radeon_X300-X600_Series

Aquesta primera targeta dóna problemes, per això provo una Dell ATI Tech ATI Radeon X300SE 128MB PCI Express DVI/VGA/TV-Out-Video Graphics Card Mfr P/N 102A3340600 procedent d'un ordinador Dell Dimension 5000 en desús.

• http://www.techpowerup.com/gpudb/513/radeon-x300-le.html
• https://en.wikipedia.org/wiki/Radeon_X300-X600_Series

Afegeixo dos mòduls de memòria Kingston KTH-XW4400E6/2G (KINGSTON MEMORY/2GB 240-Pin DDR2 SDRAM ECC DDR2 800 PC2-6400) de 2 Gigabytes cadascun per substituir els dos mòduls de memòria de Hynix 512 MB (HYS72T64000HU-3S-A - PC2-5300E-555-12-F0) i ampliar la memòria en placa fins als 4 GB.

Els mòduls antics i els nous no són compatibles i no es poden instal·lar conjuntament.

Detallar les dades tècniques dels monitors i la seva connexió inicial.

• http://www.pcworld.com/product/1415006/hp-l1950g-lcd-monitor.html
• http://www8.hp.com/h20195/v2/GetPDF.aspx/c04142176.pdf
• http://www.cnet.com/products/hp-l1950g-lcd-monitor-19-series/specs/

Per ara faig la instal·lació al disc dur original de l'estació de treball, però caldrà substituir-ho tan aviat com sigui possible perquè, tot i que no dona errors i el registre d'errors està buit, el registre de SMART indica que porta moltes hores en funcionament.

Model Family:     SAMSUNG SpinPoint P80 SD
Device Model:     SAMSUNG HD160JJ
Serial Number:    S08HJ1LYA11987
Firmware Version: WU100-33
User Capacity:    160,041,885,696 bytes [160 GB]
Sector Size:      512 bytes logical/physical
Device is:        In smartctl database [for details use: -P show]
ATA Version is:   7
ATA Standard is:  ATA/ATAPI-7 T13 1532D revision 4a
Local Time is:    Thu Aug 20 12:16:58 2015 CEST
SMART support is: Available - device has SMART capability.
SMART support is: Enabled

[...]

SMART Attributes Data Structure revision number: 16
Vendor Specific SMART Attributes with Thresholds:
ID# ATTRIBUTE_NAME          FLAG     VALUE WORST THRESH TYPE      UPDATED  WHEN_FAILED RAW_VALUE
  1 Raw_Read_Error_Rate     0x000f   253   100   051    Pre-fail  Always       -       0
  3 Spin_Up_Time            0x0007   100   100   025    Pre-fail  Always       -       5952
  4 Start_Stop_Count        0x0032   100   100   000    Old_age   Always       -       84
  5 Reallocated_Sector_Ct   0x0033   253   253   010    Pre-fail  Always       -       0
  7 Seek_Error_Rate         0x000f   253   253   051    Pre-fail  Always       -       0
  8 Seek_Time_Performance   0x0025   253   253   015    Pre-fail  Offline      -       0
  9 Power_On_Hours          0x0032   100   100   000    Old_age   Always       -       80989
 10 Spin_Retry_Count        0x0033   253   253   051    Pre-fail  Always       -       0
 11 Calibration_Retry_Count 0x0012   253   253   000    Old_age   Always       -       0
 12 Power_Cycle_Count       0x0032   100   100   000    Old_age   Always       -       73
190 Airflow_Temperature_Cel 0x0022   067   056   000    Old_age   Always       -       33
194 Temperature_Celsius     0x0022   067   056   000    Old_age   Always       -       33
195 Hardware_ECC_Recovered  0x001a   100   100   000    Old_age   Always       -       3283
196 Reallocated_Event_Count 0x0032   253   253   000    Old_age   Always       -       0
197 Current_Pending_Sector  0x0012   253   253   000    Old_age   Always       -       0
198 Offline_Uncorrectable   0x0030   253   253   000    Old_age   Offline      -       0
199 UDMA_CRC_Error_Count    0x003e   200   200   000    Old_age   Always       -       0
200 Multi_Zone_Error_Rate   0x000a   253   100   000    Old_age   Always       -       0
201 Soft_Read_Error_Rate    0x000a   253   100   000    Old_age   Always       -       0
202 Data_Address_Mark_Errs  0x0032   253   253   000    Old_age   Always       -       0

SMART Error Log Version: 1
No Errors Logged

La distribució de GNU/Linux instal·lada és la Debian version 7.8.0, released on January 10th, 2015, codenamed wheezy, AMD64 architecture.

• Language: English
• Country: Spain
• Locale: en_US.UTF-8
• Keymap: Spanish
• Host name: sermn107 (configuració manual)
• Domain name: sermn.net (configuració manual)
• User name:
  • sermnuab (SeRMN-UAB Users)
  • sermnadmin (SeRMN-UAB Staff)
• Time zone: Madrid

Aplico el mateix esquema de partició emprat a l'estacio de treball Z400 del 600 i xw4400 del 400sb:

• Partició primària / (root) de 20 GB. Inclou /usr i /tmp
• Partició lògica /var de 5 GB.
• Partició swap de 12 GB.
• Partició lògica /opt de 20 GB. Pel Topspin i altre programari Bruker.
• Partició lògica /home de 95 GB (resta d'espai al disc). Entre altres, és on es guardaran les dades dels usuaris.

root@sermn107:/etc/apt# sfdisk -l

Disk /dev/sda: 19457 cylinders, 255 heads, 63 sectors/track
Warning: extended partition does not start at a cylinder boundary.
DOS and Linux will interpret the contents differently.
Units = cylinders of 8225280 bytes, blocks of 1024 bytes, counting from 0

   Device Boot Start     End   #cyls    #blocks   Id  System
/dev/sda1   *      0+   2431-   2432-  19530752   83  Linux
/dev/sda2       2431+  19457-  17026- 136757249    5  Extended
/dev/sda3          0       -       0          0    0  Empty
/dev/sda4          0       -       0          0    0  Empty
/dev/sda5       2431+   3039-    608-   4881408   83  Linux
/dev/sda6       3039+   4498-   1459-  11717632   82  Linux swap / Solaris
/dev/sda7       4498+   6929-   2432-  19529728   83  Linux
/dev/sda8       6929+  19457-  12528- 100625408   83  Linux

Les col·leccions de programes a instal·lar seleccionades són:

• Desktop Environment
• SSH Server
• Standard System

La resta de programes que poguessin ser necessaris, s'instal·laran més endavant.

GRUB Boot Loader s'instal·la al MBR.

Un cop s'han instal·lat tots els paquets, reinicio l'ordinador i entro a la sessió de GNU/Debian Wheezy.

Simplifico l'escriptori:

• Elimino el panel inferior. Abans de fer-ho, moc els applets Window List i Workspace Switcher al panel superior.
• Elimino els applets Notification Area i Window Selector al panel superior, el primer perquè no vull que els usuaris enredin les connexions a la xarxa, i el segon perquè és redundant amb el Window List.
• Al Workspace Switcher redueixo el nombre d'escriptoris a 2. Els usuaris de MS-Windows no coneixen el concepte d'escriptoris i acostumen a perdre's.
• Canvio la configuració del Workpsace Switcher
  • Show windows from all workspaces
  • Always group windows
  • Restore to native workspace (les finestres minimitzades s'obren a l'escriptori on es van tancar)
• Afegeixo els applets Lock Screen Button per bloquejar la pantalla, i Log Out Button per sortir de la sessió o per canviar a un altre usuari.

Edito el menú per amagar les aplicacions que no vull que vegin els usuaris (jocs i altres entreteniments). Més endavant miraré d'esbrinar cóm es poden desinstal·lar algunes d'aquestes aplicacions innecessàries. Entre altres:

• L'usuari “normal” no hauria de veure el menú System | Administration
• L'usuari “normal” no hauria de veure moltes de les opcions disponibles al menú System | Preferences
• …

Configuro els dos monitors en mode “Dual Display” d'acord amb les instruccions Gnome Shell 3.2 and Multiple Monitors a thebinaryidiot.com.

Afegeixo altres magatzems (repositories) de programes:

• deb http://ftp.caliu.cat/debian/ wheezy-backports main contrib non-free
• deb http://ftp.caliu.cat/debian/ wheezy-updates main contrib non-free
• deb http://www.deb-multimedia.org/ wheezy main contrib non-free

i la signatura (debian-multimedia-keyring) del magatzem deb-multimedia, i instal·lo:

• Adobe Acrobat Reader

També afegeixo el magatzem del navegador Chrome de Google,

• deb http://dl.google.com/linux/chrome/deb/ oldstable main

i instal·lo la seva clau de signatura pública d'acord amb les instruccions a la pàgina Google Linux Software Repositories.

A la pàgina https://sites.google.com/site/mydebiansourceslist/ es poden consultar altres magatzems disponibles.

Com que el sistema operatiu instal·lat és de 64-bits, per poder executar programes de 32-bits cal afegir l'arquitectura i386 i instal·lar les biblioteques

• libc6-dev (i les seves dependències)
• libc6-dev-i386 (i les seves dependències)
• libpthread-stubs0 (no té dependències)

Afegeixo els següents paquets o programes (aquest no és un llistat exhaustiu, només inclou els dimonis i servidors de xarxa, i altres programes importants):

• ssh (openssh-server, openssh-client)
• mc (midnight commander)
• rsync
• ftp-ssl en comptes de ftp
• denyhosts
• nfs-kernel-server
• tftp-hpa
• tftpd-hpa Cal reconfigurar!
• bootparamd Cal reconfigurar!
• xinetd (en comptes del programa per defecte: openbsd-inetd)
• deborphan
• lshw & lshw-gtk
• chkconfig

Elimino els paquets o programes:

• telnet
• …

Elimino els següents metapackages per poder eliminar altres paquets o programes que depenen d'ells sense haver de desinstal·lar altres paquets que sí que m'interessen,

• gnome

i tot seguit desinstal·lo:

• gnome-games, gnome-games-data, gnome-games-extra-data
• simple-scan, xsane, xsane-common, i les biblioteques relacionades
• …

Instal·lo Java 7 (openjdk-7-jre, openjdk-7-jre-headless i openjdk-7-jre-lib) i elimino Java 6 (openjdk-6-jre, openjdk-6-jre-headless i openjdk-6-jre-lib) i els paquets que en depenen (default-jre, default-jre-headless, icedtea-6-jre-cacao, icedtea-6-jre-jamvm).

Instal·lo el programa Wireshark i executo la comanda dpkg-reconfigure wireshark-common per donar permís de captura als usuaris normals que siguin membres del grup wireshark.

La targeta gràfica instal·lada provisionalment és una Radeon X300 (RV370 5B60, PCIE)

root@sermn107:/etc# lspci -nn | grep VGA
01:00.0 VGA compatible controller [0300]: Advanced Micro Devices [AMD] nee ATI RV370 5B60 [Radeon X300 (PCIE)] [1002:5b60]

i el driver que fa servir és el radeon, que és de codi obert i es distribueix al paquet xserver-xorg-video-radeon. Si aquest driver donés problemes, es podria substituir pel driver propietari seguint les instrucciona a https://wiki.debian.org/ATIProprietary

Comprovo quin firmware es fa servir i trobo que no es carrega el firmware perquè no està disponible,

root@sermn107:/etc# dmesg | grep -E 'drm|radeon' | grep -iE 'firmware|microcode'
[    4.914145] [drm] Loading R300 Microcode
[    5.115022] platform radeon_cp.0: firmware: agent aborted loading radeon/R300_cp.bin (not found?)
[    5.115199] [drm:r100_cp_init] *ERROR* Failed to load firmware!

i per resoldre el problema instal·lo els paquets

• firmware-linux-free
• firmware-linux-nonfree

Per més informació consultar:

• https://wiki.debian.org/AtiHowTo
• https://wiki.debian.org/ATIProprietary
• http://packages.debian.org/search?keywords=radeon
• https://packages.debian.org/search?keywords=fglrx

La segona targeta de xarxa és una NetXtreme BCM5751 Gigabit Ethernet PCI Express [14E4:1677] i funciona amb el driver tg3.

Consultar el Chapter 5. Network setup de la Debian Reference (v2) (2014-12-03 15:28:23 UTC)

La configuració actual és estàtica** amb els següents paràmetres:

• Hostname: sermn107
• Domain: sermn.net
• IP address: 192.168.2.7
• Broadcast: 192.168.2.255
• Netmask: 255.255.255.0
• Gateway: 192.168.2.1
• DNS:
  • domain sermn.net
  • search sermn.net
  • nameserver 192.168.2.1

La configuració de més amunt és l'emprada per la targeta de xarxa addicional,

eth0      Link encap:Ethernet  HWaddr 00:10:18:14:2a:8a  
          inet addr:192.168.2.7  Bcast:192.168.2.255  Mask:255.255.255.0
          inet6 addr: fe80::210:18ff:fe14:2a8a/64 Scope:Link
          UP BROADCAST RUNNING MULTICAST  MTU:1500  Metric:1
          RX packets:250633 errors:0 dropped:0 overruns:0 frame:0
          TX packets:143036 errors:0 dropped:0 overruns:0 carrier:0
          collisions:0 txqueuelen:1000 
          RX bytes:330464497 (315.1 MiB)  TX bytes:17604639 (16.7 MiB)
          Interrupt:16

La configuració de servidors de noms és,

root@sermn107:/home/sermnadmin# cat /etc/resolv.conf 
# Generated by NetworkManager
search sermn.net
nameserver 192.168.2.1

La connexió de xarxa ethernet a la placa base també es reconeix,

eth1      Link encap:Ethernet  HWaddr 00:14:c2:5c:e9:ef  
          UP BROADCAST MULTICAST  MTU:1500  Metric:1
          RX packets:0 errors:0 dropped:0 overruns:0 frame:0
          TX packets:0 errors:0 dropped:0 overruns:0 carrier:0
          collisions:0 txqueuelen:1000 
          RX bytes:0 (0.0 B)  TX bytes:0 (0.0 B)
          Interrupt:17 

i aquesta és la configuració estàtica fent servir els paràmetres de connexió emprats per la connexió de l'antiga estació de treball a la consola:

• IP address: 149.236.99.1
• Broadcast: 149.236.99.255
• Netmask: 255.255.255.0
• Gateway: 149.236.99.1 caldrà eliminar si dóna problemas de routing

Per evitar que en algun moment es pugui bescanviar la configuració de les targetes de xarxa poso en pràctica les opcions esmentades a How to reorder or rename logical interface names in Linux i comprovo al fitxer /etc/udev/rules.d/70-persistent-net.rules si l'assignació del nom de dispositiu, eth0 o eth1 feta pel programa udev és fixe, i que no hi ha perill de que canviï en reiniciar l'ordinador,

root@sermn107:/etc/udev/rules.d# cat 70-persistent-net.rules 
# This file was automatically generated by the /lib/udev/write_net_rules
# program, run by the persistent-net-generator.rules rules file.
#
# You can modify it, as long as you keep each rule on a single
# line, and change only the value of the NAME= key.

# PCI device 0x14e4:/sys/devices/pci0000:00/0000:00:1c.5/0000:3f:00.0 (tg3)
SUBSYSTEM=="net", ACTION=="add", DRIVERS=="?*", ATTR{address}=="00:14:c2:5c:e9:ef", ATTR{dev_id}=="0x0", ATTR{type}=="1", KERNEL=="eth*", NAME="eth1"

# PCI device 0x14e4:/sys/devices/pci0000:00/0000:00:1c.4/0000:28:00.0 (tg3)
SUBSYSTEM=="net", ACTION=="add", DRIVERS=="?*", ATTR{address}=="00:10:18:14:2a:8a", ATTR{dev_id}=="0x0", ATTR{type}=="1", KERNEL=="eth*", NAME="eth0"

Desactivo el servei avahi amb la comanda

root@sermn107:/etc/avahi# update-rc.d avahi-daemon disable
update-rc.d: using dependency based boot sequencing
insserv: warning: current start runlevel(s) (empty) of script `avahi-daemon' overrides LSB defaults (2 3 4 5).
insserv: warning: current stop runlevel(s) (0 1 2 3 4 5 6) of script `avahi-daemon' overrides LSB defaults (0 1 6).

No és necessari pel TopSpin 1.3.

Comprovar si és necessari pel TopSpin 1.3

Servei configurat. El contingut del fitxer /opt/topspin1.3/prog/bin/install.net/bootparams

spect   root=ASP_ST2:/usr/diskless/clients/spect/root swap=ASP_ST2:/usr/diskless/clients/spect/swapfile dump=ASP_ST2:/usr/diskless/clients/spect/dump

es copia correctament al fitxer /etc/bootparams, i el servei bfs s'afegeix al fitxer /etc/services

bfs             2201/udp        # BRUKER: bootfileserver 

Servei configurat. El contingut del fitxer /opt/topspin1.3/prog/bin/install.net/exports.linux

/usr/diskless/dl_usr            spect(sync,ro)
/usr/diskless/clients/spect     spect(sync,rw,no_root_squash)

es copia correctament al fitxer /etc/exports.

Instal·lo el paquet ntp i al final del fitxer /etc/ntp.conf afegeixo els següents servidors de temps,

• server swisstime.ethz.ch
• server ntp.uab.es
• server ntp.univ-lyon1.fr
• …

Afegeixo els programes:

• Firefox del lloc web de Mozilla
• Filezilla? potser no cal, perquè el gestor de fitxers ja incorpora un client de ftp/ssh.
• …

Instal·lo el paquet devilspie2.

quan s'hagi instal·lat el TopSpin, caldrà configurar la posició i mida de les finestres.

• Devil's Pie is a window-matching utility, inspired by Sawfish's “Matched Windows” option and the lack of the functionality in Metacity. Metacity lacking window matching is not a bad thing — Metacity is a lean window manager, and window matching does not have to be a window manager task. Devil's Pie can be configured to detect windows as they are created, and match the window to a set of rules. If the window matches the rules, it can perform a series of actions on that window. For example, I can make all windows created by X-Chat appear on all workspaces, and the main Gkrellm1 window does not appear in the pager or task list.
• Devilspie is a non-gui utility that lets you make applications start in specified workplaces, in specified sizes and placements, minimized or maximized and much more based on simple config files.
• http://ubuntuforums.org/showthread.php?t=1976354
• GDevilspie is a user friendly interface to the devilspie window matching daemon, to create rules easily.
  • How do I tell a start up program to start minimized?

cercar recomanacions per Gnome 3.

Consultar els següents enllaços sobre cóm millorar o personalitzar el comportament de Gnome 3 Fallback (aka Classic) mode

• http://askubuntu.com/questions/58172/how-to-revert-to-gnome-classic-desktop
• http://joesteiger.com/2011/07/02/enable-desktop-icons-and-right-click-gnome-3-gnome-shell-ubuntu-11-04/
• https://www.linux.com/learn/tutorials/781916-easy-steps-to-make-gnome-3-more-efficient
• GNOME at ArchLinux
  • GNOME Tips
  • Configuring GDM 2.28

• Instal·lació del Topspin 1.3