Estació de treball HP xw4400 per l'Avance III 400sb

Aquesta és l'estació de treball originalment instal-lada a l'AvanceII+ 600 i que posteriorment es va substituir per una estació de treball HP Z400. Un cop instal·lat el GNU/Linux Debian i les versions 2.x i 3.x del Topspin, s'instal·la i configura com a estació de treball de l'espectròmetre AvanceIII 400sb.

Especificacions del maquinari amb data de 2013-01-07:

root@cie-55-31:~# lshw
cie-55-31                 
    description: Mini Tower Computer
    product: HP xw4400 Workstation
    vendor: Hewlett-Packard
    serial: CZC70116S7
    width: 64 bits
    capabilities: smbios-2.4 dmi-2.4 vsyscall64 vsyscall32
    configuration: boot=normal chassis=mini-tower uuid=A76CC2A8-7E9C-DB11-BBDA-BB57969B0019
  *-core
       description: Motherboard
       product: 0A68h
       vendor: Hewlett-Packard
       physical id: 0
       serial: CZC70116S7
     *-firmware
          description: BIOS
          vendor: Hewlett-Packard
          physical id: 1
          version: 786D7 v01.03 (09/28/2006)
          size: 128KiB
          capacity: 960KiB
          capabilities: pci pnp upgrade shadowing cdboot bootselect edd int13floppytoshiba int13floppy360 int13floppy1200 int13floppy720 int5printscreen int9keyboard int14serial int17printer acpi usb ls120boot zipboot biosbootspecification netboot
     *-cpu:0
          description: CPU
          product: Intel(R) Core(TM)2 CPU          6600  @ 2.40GHz
          vendor: Intel Corp.
          physical id: 5
          bus info: cpu@0
          version: Intel(R) Core(TM)2 CPU          6600  @ 2.40GHz
          slot: XU1 PROCESSOR
          size: 1596MHz
          capacity: 1596MHz
          width: 64 bits
          clock: 1066MHz
          capabilities: fpu fpu_exception wp vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 clflush dts acpi mmx fxsr sse sse2 ss ht tm pbe syscall nx x86-64 constant_tsc arch_perfmon pebs bts rep_good aperfmperf pni dtes64 monitor ds_cpl vmx est tm2 ssse3 cx16 xtpr pdcm lahf_lm tpr_shadow cpufreq
        *-cache:0
             description: L1 cache
             physical id: 7
             slot: Internal L1 Cache
             size: 64KiB
             capacity: 64KiB
             capabilities: burst internal write-through data
        *-cache:1
             description: L2 cache
             physical id: 8
             slot: Cache L2
             size: 4MiB
             capacity: 4MiB
             capabilities: burst internal write-back data
     *-cpu:1
          description: CPU
          vendor: Intel
          physical id: 6
          bus info: cpu@1
          version: Intel(R) Core(TM)2 CPU          6600  @ 2.40GHz
          slot: XU1 PROCESSOR 2
          size: 1596MHz
          capacity: 1596MHz
          clock: 1066MHz
          capabilities: cpufreq
     *-memory:0
          description: System Memory
          physical id: 36
          slot: System board or motherboard
        *-bank:0
             description: DIMM DDR2 Synchronous 667 MHz (1.5 ns)
             product: K
             vendor: JEDEC ID:7F 98 00 00 00 00 00 00
             physical id: 0
             serial: B792208C
             slot: XMM1
             size: 2GiB
             width: 64 bits
             clock: 667MHz (1.5ns)
        *-bank:1
             description: DIMM DDR2 Synchronous [empty]
             vendor: JEDEC ID:
             physical id: 1
             slot: XMM2
        *-bank:2
             description: DIMM DDR2 Synchronous 667 MHz (1.5 ns)
             product: K
             vendor: JEDEC ID:7F 98 00 00 00 00 00 00
             physical id: 2
             serial: B788208C
             slot: XMM3
             size: 2GiB
             width: 64 bits
             clock: 667MHz (1.5ns)
        *-bank:3
             description: DIMM DDR2 Synchronous [empty]
             vendor: JEDEC ID:
             physical id: 3
             slot: XMM4
     *-memory:1 UNCLAIMED
          description: Flash Memory
          physical id: 37
          slot: System board or motherboard
          capacity: 1MiB
        *-bank UNCLAIMED
             description: Chip FLASH Non-volatile
             physical id: 0
             slot: SYSTEM ROM
             size: 1MiB
             width: 2 bits
     *-memory:2 UNCLAIMED
          physical id: 0
     *-memory:3 UNCLAIMED
          physical id: 2
     *-pci
          description: Host bridge
          product: 82975X Memory Controller Hub
          vendor: Intel Corporation
          physical id: 100
          bus info: pci@0000:00:00.0
          version: 00
          width: 32 bits
          clock: 33MHz
          configuration: driver=i82975x_edac
          resources: irq:0
        *-pci:0
             description: PCI bridge
             product: 82975X PCI Express Root Port
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1
             bus info: pci@0000:00:01.0
             version: 00
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: pci pm msi pciexpress normal_decode bus_master cap_list
             configuration: driver=pcieport
             resources: irq:24 ioport:1000(size=4096) memory:e1000000-e31fffff ioport:d0000000(size=270532608)
           *-display
                description: VGA compatible controller
                product: G73GL [Quadro FX 560]
                vendor: nVidia Corporation
                physical id: 0
                bus info: pci@0000:01:00.0
                version: a1
                width: 64 bits
                clock: 33MHz
                capabilities: pm msi pciexpress vga_controller bus_master cap_list rom
                configuration: driver=nouveau latency=0
                resources: irq:16 memory:e1000000-e1ffffff memory:d0000000-dfffffff(prefetchable) memory:e2000000-e2ffffff ioport:1000(size=128) memory:e0000000-e001ffff(prefetchable)
        *-multimedia
             description: Audio device
             product: N10/ICH 7 Family High Definition Audio Controller
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1b
             bus info: pci@0000:00:1b.0
             version: 01
             width: 64 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: pm msi pciexpress bus_master cap_list
             configuration: driver=HDA Intel latency=0
             resources: irq:21 memory:e0a00000-e0a03fff
        *-pci:1
             description: PCI bridge
             product: N10/ICH 7 Family PCI Express Port 1
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1c
             bus info: pci@0000:00:1c.0
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: pci pciexpress msi pm normal_decode bus_master cap_list
             configuration: driver=pcieport
             resources: irq:25 ioport:3000(size=4096) memory:e0800000-e09fffff memory:e0b00000-e0cfffff(prefetchable)
        *-pci:2
             description: PCI bridge
             product: 82801GR/GH/GHM (ICH7 Family) PCI Express Port 5
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1c.4
             bus info: pci@0000:00:1c.4
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: pci pciexpress msi pm normal_decode bus_master cap_list
             configuration: driver=pcieport
             resources: irq:26 ioport:4000(size=4096) memory:e0500000-e07fffff memory:e0d00000-e0efffff(prefetchable)
           *-network
                description: Ethernet interface
                product: NetXtreme BCM5751 Gigabit Ethernet PCI Express
                vendor: Broadcom Corporation
                physical id: 0
                bus info: pci@0000:28:00.0
                logical name: eth0
                version: 21
                serial: 00:10:18:27:55:de
                size: 100MB/s
                capacity: 1GB/s
                width: 64 bits
                clock: 33MHz
                capabilities: pm vpd msi pciexpress bus_master cap_list rom ethernet physical tp 10bt 10bt-fd 100bt 100bt-fd 1000bt 1000bt-fd autonegotiation
                configuration: autonegotiation=on broadcast=yes driver=tg3 driverversion=3.116 duplex=full firmware=5751-v3.58 ip=158.109.55.31 latency=0 link=yes multicast=yes port=twisted pair speed=100MB/s
                resources: irq:29 memory:e0500000-e050ffff memory:e0d00000-e0d0ffff(prefetchable)
        *-pci:3
             description: PCI bridge
             product: 82801GR/GH/GHM (ICH7 Family) PCI Express Port 6
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1c.5
             bus info: pci@0000:00:1c.5
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: pci pciexpress msi pm normal_decode bus_master cap_list
             configuration: driver=pcieport
             resources: irq:27 ioport:5000(size=4096) memory:e0200000-e04fffff memory:e3200000-e33fffff(prefetchable)
           *-network DISABLED
                description: Ethernet interface
                product: NetXtreme BCM5755 Gigabit Ethernet PCI Express
                vendor: Broadcom Corporation
                physical id: 0
                bus info: pci@0000:3f:00.0
                logical name: eth1
                version: 02
                serial: 00:19:bb:57:96:9b
                capacity: 1GB/s
                width: 64 bits
                clock: 33MHz
                capabilities: pm vpd msi pciexpress bus_master cap_list ethernet physical tp 10bt 10bt-fd 100bt 100bt-fd 1000bt 1000bt-fd autonegotiation
                configuration: autonegotiation=on broadcast=yes driver=tg3 driverversion=3.116 firmware=5755-v3.17 latency=0 link=yes multicast=yes port=twisted pair
                resources: irq:17 memory:e0400000-e040ffff
        *-usb:0
             description: USB Controller
             product: N10/ICH 7 Family USB UHCI Controller #1
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1d
             bus info: pci@0000:00:1d.0
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: uhci bus_master
             configuration: driver=uhci_hcd latency=0
             resources: irq:20 ioport:2000(size=32)
        *-usb:1
             description: USB Controller
             product: N10/ICH 7 Family USB UHCI Controller #2
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1d.1
             bus info: pci@0000:00:1d.1
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: uhci bus_master
             configuration: driver=uhci_hcd latency=0
             resources: irq:18 ioport:2020(size=32)
        *-usb:2
             description: USB Controller
             product: N10/ICH 7 Family USB UHCI Controller #3
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1d.2
             bus info: pci@0000:00:1d.2
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: uhci bus_master
             configuration: driver=uhci_hcd latency=0
             resources: irq:21 ioport:2040(size=32)
        *-usb:3
             description: USB Controller
             product: N10/ICH 7 Family USB UHCI Controller #4
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1d.3
             bus info: pci@0000:00:1d.3
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: uhci bus_master
             configuration: driver=uhci_hcd latency=0
             resources: irq:22 ioport:2060(size=32)
        *-usb:4
             description: USB Controller
             product: N10/ICH 7 Family USB2 EHCI Controller
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1d.7
             bus info: pci@0000:00:1d.7
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: pm debug ehci bus_master cap_list
             configuration: driver=ehci_hcd latency=0
             resources: irq:20 memory:e0a04000-e0a043ff
        *-pci:4
             description: PCI bridge
             product: 82801 PCI Bridge
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1e
             bus info: pci@0000:00:1e.0
             version: e1
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: pci subtractive_decode bus_master cap_list
        *-isa
             description: ISA bridge
             product: 82801GB/GR (ICH7 Family) LPC Interface Bridge
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1f
             bus info: pci@0000:00:1f.0
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: isa bus_master cap_list
             configuration: latency=0
        *-ide
             description: IDE interface
             product: 82801G (ICH7 Family) IDE Controller
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1f.1
             bus info: pci@0000:00:1f.1
             logical name: scsi0
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 33MHz
             capabilities: ide bus_master emulated
             configuration: driver=ata_piix latency=0
             resources: irq:17 ioport:1f0(size=8) ioport:3f6 ioport:170(size=8) ioport:376 ioport:20a0(size=16)
           *-cdrom
                description: DVD writer
                product: DVDRW SHM-165H6S
                vendor: LITE-ON
                physical id: 0.0.0
                bus info: scsi@0:0.0.0
                logical name: /dev/cdrom
                logical name: /dev/cdrw
                logical name: /dev/dvd
                logical name: /dev/dvdrw
                logical name: /dev/scd0
                logical name: /dev/sr0
                version: HQSA
                capabilities: removable audio cd-r cd-rw dvd dvd-r
                configuration: ansiversion=5 status=nodisc
        *-storage
             description: RAID bus controller
             product: 82801GR/GH (ICH7 Family) SATA RAID Controller
             vendor: Intel Corporation
             physical id: 1f.2
             bus info: pci@0000:00:1f.2
             logical name: scsi2
             version: 01
             width: 32 bits
             clock: 66MHz
             capabilities: storage msi pm bus_master cap_list emulated
             configuration: driver=ahci latency=0
             resources: irq:28 ioport:20d0(size=8) ioport:20e8(size=4) ioport:20d8(size=8) ioport:20ec(size=4) ioport:20b0(size=16) memory:e0a04400-e0a047ff
           *-disk
                description: ATA Disk
                product: ST3160812AS
                vendor: Seagate
                physical id: 0.0.0
                bus info: scsi@2:0.0.0
                logical name: /dev/sda
                version: 3.AH
                serial: 5LS68H19
                size: 149GiB (160GB)
                capabilities: partitioned partitioned:dos
                configuration: ansiversion=5 signature=0007ec7d
              *-volume:0
                   description: EXT3 volume
                   vendor: Linux
                   physical id: 1
                   bus info: scsi@2:0.0.0,1
                   logical name: /dev/sda1
                   logical name: /
                   version: 1.0
                   serial: f6c9a4b4-3aa9-430b-b7cf-225fb0500549
                   size: 18GiB
                   capacity: 18GiB
                   capabilities: primary bootable journaled extended_attributes large_files ext3 ext2 initialized
                   configuration: created=2012-05-18 13:23:14 filesystem=ext3 label=ROOT modified=2013-01-02 16:04:59 mount.fstype=ext3 mount.options=rw,relatime,errors=remount-ro,data=ordered mounted=2013-01-02 16:05:47 state=mounted
              *-volume:1
                   description: Extended partition
                   physical id: 2
                   bus info: scsi@2:0.0.0,2
                   logical name: /dev/sda2
                   size: 130GiB
                   capacity: 130GiB
                   capabilities: primary extended partitioned partitioned:extended
                 *-logicalvolume:0
                      description: Linux filesystem partition
                      physical id: 5
                      logical name: /dev/sda5
                      logical name: /var
                      capacity: 4767MiB
                      configuration: mount.fstype=ext3 mount.options=rw,relatime,errors=continue,data=ordered state=mounted
                 *-logicalvolume:1
                      description: Linux swap / Solaris partition
                      physical id: 6
                      logical name: /dev/sda6
                      capacity: 11GiB
                      capabilities: nofs
                 *-logicalvolume:2
                      description: Linux filesystem partition
                      physical id: 7
                      logical name: /dev/sda7
                      logical name: /opt
                      capacity: 18GiB
                      configuration: mount.fstype=ext3 mount.options=rw,relatime,errors=continue,data=ordered state=mounted
                 *-logicalvolume:3
                      description: Linux filesystem partition
                      physical id: 8
                      logical name: /dev/sda8
                      logical name: /home
                      capacity: 95GiB
                      configuration: mount.fstype=ext3 mount.options=rw,relatime,errors=continue,data=ordered state=mounted
root@cie-55-31:~#

Especificacions del processador amb data de 2013-01-07:

root@cie-55-31:~# cat /proc/cpuinfo 
processor	: 0
vendor_id	: GenuineIntel
cpu family	: 6
model		: 15
model name	: Intel(R) Core(TM)2 CPU          6600  @ 2.40GHz
stepping	: 6
cpu MHz		: 1596.000
cache size	: 4096 KB
physical id	: 0
siblings	: 2
core id		: 0
cpu cores	: 2
apicid		: 0
initial apicid	: 0
fpu		: yes
fpu_exception	: yes
cpuid level	: 10
wp		: yes
flags		: fpu vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 clflush dts acpi mmx fxsr sse sse2 ss ht tm pbe syscall nx lm constant_tsc arch_perfmon pebs bts rep_good aperfmperf pni dtes64 monitor ds_cpl vmx est tm2 ssse3 cx16 xtpr pdcm lahf_lm tpr_shadow
bogomips	: 4799.58
clflush size	: 64
cache_alignment	: 64
address sizes	: 36 bits physical, 48 bits virtual
power management:

processor	: 1
vendor_id	: GenuineIntel
cpu family	: 6
model		: 15
model name	: Intel(R) Core(TM)2 CPU          6600  @ 2.40GHz
stepping	: 6
cpu MHz		: 1596.000
cache size	: 4096 KB
physical id	: 0
siblings	: 2
core id		: 1
cpu cores	: 2
apicid		: 1
initial apicid	: 1
fpu		: yes
fpu_exception	: yes
cpuid level	: 10
wp		: yes
flags		: fpu vme de pse tsc msr pae mce cx8 apic sep mtrr pge mca cmov pat pse36 clflush dts acpi mmx fxsr sse sse2 ss ht tm pbe syscall nx lm constant_tsc arch_perfmon pebs bts rep_good aperfmperf pni dtes64 monitor ds_cpl vmx est tm2 ssse3 cx16 xtpr pdcm lahf_lm tpr_shadow
bogomips	: 4800.49
clflush size	: 64
cache_alignment	: 64
address sizes	: 36 bits physical, 48 bits virtual
power management:

La targeta gràfica que ve per defecte es una nVidia Quadro FX 560 (G73GL), amb 128 MiB de memòria. El controlador que es fa servir és el noveau.

• Manual: (search Google for “quadro fx 560 type:pdf”)

Afegeixo dos mòduls de memòria Kingston KTH-XW4300E/2G (KINGSTON MEMORY/2GB ECC DDR2 667MHZ CL6 MODULE) de 2 Gigabytes cadascun per substituir els dos mòduls de memòria de Hynix 512 MB (HYMP654U72CP8-Y5 AB-C - PC2-5300E-555-12) i ampliar la memòria en placa fins als 4 GB.

Els mòduls antics i els nous no són compatibles i no es poden instal·lar conjuntament.

La distribució de GNU/Linux instal·lada és la Debian version 6.0.3, released on October 8th, 2011, codenamed squeeze, AMD64 architecture, actualitzada via xarxa a Debian version 6.0.5 released on May 12th, 2012.

• Language: English
• Country: Spain
• Locale: en_US.UTF-8
• Keymap: Spanish
• Host name: cie-55-31 (configuració manual)
• Domain name: sermn.net (configuració manual)
• User name:
  • sermnuab (SeRMN-UAB Users)
  • sermnadmin (SeRMN-UAB Staff)
• Time zone: Madrid

Aplico el mateix esquema de partició emprat a l'estacio de treball Z400 del 600:

• Partició primària / (root) de 20 GB. Inclou /usr i /tmp
• Partició lògica /var de 5 GB.
• Partició swap de 12 GB.
• Partició lògica /opt de 20 GB. Pel Topspin i altre programari Bruker.
• Partició lògica /home de 95 GB (resta d'espai al disc). Entre altres, és on es guardaran les dades dels usuaris.

root@cie-55-31:/etc/apt# sfdisk -l

Disk /dev/sda: 19457 cylinders, 255 heads, 63 sectors/track
Warning: extended partition does not start at a cylinder boundary.
DOS and Linux will interpret the contents differently.
Units = cylinders of 8225280 bytes, blocks of 1024 bytes, counting from 0

   Device Boot Start     End   #cyls    #blocks   Id  System
/dev/sda1   *      0+   2431-   2432-  19530752   83  Linux
/dev/sda2       2431+  19457-  17026- 136757249    5  Extended
/dev/sda3          0       -       0          0    0  Empty
/dev/sda4          0       -       0          0    0  Empty
/dev/sda5       2431+   3039-    608-   4881408   83  Linux
/dev/sda6       3039+   4498-   1459-  11717632   82  Linux swap / Solaris
/dev/sda7       4498+   6929-   2432-  19529728   83  Linux
/dev/sda8       6929+  19457-  12528- 100625408   83  Linux

Les col·leccions de programes a instal·lar seleccionades són:

• Desktop Environment
• Standard System

La resta de programes que poguessin ser necessaris, s'instal·laran més endavant.

GRUB Boot Loader s'instal·la al MBR.

Un cop s'han instal·lat tots els paquets, reinicio l'ordinador i entro a la sessió de GNU/Debian Squeeze.

Simplifico l'escriptori:

• Elimino el panel inferior. Abans de fer-ho, moc els applets Window List i Workspace Switcher al panel superior.
• Elimino els applets Notification Area i Window Selector al panel superior, el primer perquè no vull que els usuaris enredin les connexions a la xarxa, i el segon perquè és redundant amb el Window List.
• Al Workspace Switcher redueixo el nombre d'escriptoris a 2. Els usuaris de MS-Windows no coneixen el concepte d'escriptoris i tenen tendència a perdre's.
• Canvio la configuració del Workpsace Switcher
  • Show windows from all workspaces
  • Group windows when space is limited
  • Restore to native workspace (les finestres minimitzades s'obren a l'escriptori on es van tancar)
• Afegeixo els applets Lock Screen Button per bloquejar la pantalla, i Log Out Button per sortir de la sessió o per canviar a un altre usuari.

Edito el menú per amagar les aplicacions que no vull que vegin els usuaris (jocs i altres entreteniments). Més endavant miraré d'esbrinar cóm es poden desinstal·lar algunes d'aquestes aplicacions innecessàries. Entre altres:

• L'usuari “normal” no hauria de veure el menú System | Administration
• L'usuari “normal” no hauria de veure moltes de les opcions disponibles al menú System | Preferences
• …

Afegeixo altres magatzems (repositories) de programes:

• deb http://backports.debian.org/debian-backports/ squeeze-backports main
• deb http://www.deb-multimedia.org/ squeeze main contrib non-free

i la signatura (debian-multimedia-keyring) del magatzem deb-multimedia, i instal·lo:

• Adobe Acrobat Reader

També afegeixo el magatzem del navegador Chrome de Google:

• deb http://dl.google.com/linux/chrome/deb/ stable main

A la pàgina https://sites.google.com/site/mydebiansourceslist/ es poden consultar altres magatzems disponibles.

Afegeixo els següents paquets o programes (aquest no és un llistat exhaustiu, només inclou els dimonis i servidors de xarxa, i altres programes importants):

• ssh (openssh-server, openssh-client)
• mc (midnight commander)
• rsync
• ftp-ssl en comptes de ftp
• denyhosts
• nfs-kernel-server
• tftp-hpa
• tftpd-hpa Cal reconfigurar!
• bootparamd Cal reconfigurar!
• xinetd (en comptes del programa per defecte: openbsd-inetd)
• lshw i lshw-gtk

Elimino els paquets o programes:

• telnet
• …

Elimino els següents metapackages per poder eliminar altres paquets o programes que depenen d'ells sense haver de desinstal·lar altres paquets que sí que m'interessen,

• gnome
• gnome-desktop-environment
• gnome-office

Llavors desinstal·lo:

• gnome-games, gnome-games-data, gnome-games-extra-data
• simple-scan, xsane, xsane-common, i les biblioteques relacionades
• …

Substitueixo:

• la versió lliure de Java (java-6-openjdk i paquets que en dependen) per la versió oficial (sun-java6-jdk i paquets que en depenen).

La connexió a la placa base s'identifica com a eth1 i és una

product: NetXtreme BCM5755 Gigabit Ethernet PCI Express [14E4:167B]
vendor: Broadcom Corporation [14E4]
bus info: pci@0000:3f:00.0
logical name: eth1
version: 02
serial: 00:19:bb:57:96:9b
capacity: 1GB/s
width: 64 bits
clock: 33MHz
configuration:
	autonegotiation: on
	broadcast: yes
	driver: tg3
	driverversion: 3.116
	firmware: 5755-v3.17
	latency: 0
	link: yes
	multicast: yes
	port: twisted pair
this device has been disabled

i la targeta de xarxa addicional s'identifica com a eth0 és una

product: NetXtreme BCM5751 Gigabit Ethernet PCI Express [14E4:1677]
vendor: Broadcom Corporation [14E4]
bus info: pci@0000:28:00.0
logical name: eth0
version: 21
serial: 00:10:18:27:55:de
size: 100MB/s
capacity: 1GB/s
configuration:
	autonegotiation: on
	broadcast: yes
	driver: tg3
	driverversion: 3.116
	duplex: full
	ip: 158.109.55.31
	link: yes
	port: twisted pair
	speed: 100MB/s

Cal editar el fitxer /etc/udev/rules.d/70-persistent-net.rules (veure més avall) per tal que l'assignació de les targetes al sistema operatiu sigui estàtica i no es faci cada cop que es reinicia l'ordinador, de forma que la targeta a la placa base sigui sempre eth1 i correspongui a la connexió a la consola (IPSO), i que la targeta addicional sigui sempre eth0 i es faci servir per la connexió a la xarxa local (LAN).

Actualment la configuració de la xarxa de la UAB la proporciona un servidor de DHCP. Per evitar que la caiguda de la xarxa afecti el funcionament de l'espectròmetre, la configuració es canvia a estàtica. Els paràmetres són,

• Hostname: cie-55-31
• Domain: uab.es
• IP address: 158.109.55.31
• Broadcast: 158.109.63.255
• Netmask: 255.255.240.0
• DNS:
  • domain uab.es
  • search uab.es
  • nameserver 158.109.0.9
  • nameserver 158.109.254.130
  • nameserver 158.109.0.1

tal i com es pot comprovar a partir de la configuració del dispositiu eth0,

eth0      Link encap:Ethernet  HWaddr 00:10:18:27:55:de  
          inet addr:158.109.55.31  Bcast:158.109.63.255  Mask:255.255.240.0
          inet6 addr: fec0::a:210:18ff:fe27:55de/64 Scope:Site
          inet6 addr: 2002:9e6d:3b49:a:210:18ff:fe27:55de/64 Scope:Global
          inet6 addr: fe80::210:18ff:fe27:55de/64 Scope:Link
          UP BROADCAST RUNNING MULTICAST  MTU:1500  Metric:1
          RX packets:10859429 errors:0 dropped:0 overruns:0 frame:0
          TX packets:273141 errors:0 dropped:0 overruns:0 carrier:0
          collisions:0 txqueuelen:1000 
          RX bytes:4370405934 (4.0 GiB)  TX bytes:25363690 (24.1 MiB)
          Interrupt:16

i dels servidors de noms,

root@cie-55-31:/etc# more resolv.conf 
domain uab.es
search uab.es
nameserver 158.109.0.9
nameserver 158.109.254.130
nameserver 158.109.0.1

El dispositiu eth1 també es reconeix,

eth1      Link encap:Ethernet  HWaddr 00:19:bb:57:96:9b  
          UP BROADCAST MULTICAST  MTU:1500  Metric:1
          RX packets:0 errors:0 dropped:0 overruns:0 frame:0
          TX packets:0 errors:0 dropped:0 overruns:0 carrier:0
          collisions:0 txqueuelen:1000 
          RX bytes:0 (0.0 B)  TX bytes:0 (0.0 B)
          Interrupt:17 

però no té una configuració assignada. Caldrà configurar-la de forma estàtica amb els paràmetres de connexió emprats actualment per la connexió de l'estació de treball a la consola.

Com que la configuració de la xarxa és estàtica, per evitar problemes elimino,

• network-manager i network-manager-gnome, i
• isc-dhcp i isc-dhpc-common,

i instal·lo

• net-tools, i
• ifupdown-extra, que alhora arrossega els paquets
  • ethtools, i
  • iputils-arping
• wireshark

Per evitar que en algun moment es pugui bescanviar la configuració de les targetes de xarxa poso en pràctica les opcions esmentades a How to reorder or rename logical interface names in Linux.

Una consulta al fitxer /etc/udev/rules.d/70-persistent-net.rules indica que l'assignació del nom de dispositiu, eth0 o eth1 feta pel programa udev és fixe, i que no hi ha perill de que canviï en reiniciar l'ordinador,

root@cie-55-31:/etc/udev/rules.d# more 70-persistent-net.rules 
# This file was automatically generated by the /lib/udev/write_net_rules
# program, run by the persistent-net-generator.rules rules file.
#
# You can modify it, as long as you keep each rule on a single
# line, and change only the value of the NAME= key.

# PCI device 0x14e4:0x167b (tg3)
SUBSYSTEM=="net", ACTION=="add", DRIVERS=="?*", ATTR{address}=="00:19:bb:57:96:9b",
ATTR{dev_id}=="0x0", ATTR{type}=="1", KERNEL=="eth*", NAME="eth1"

# PCI device 0x14e4:0x1677 (tg3)
SUBSYSTEM=="net", ACTION=="add", DRIVERS=="?*", ATTR{address}=="00:10:18:27:55:de",
ATTR{dev_id}=="0x0", ATTR{type}=="1", KERNEL=="eth*", NAME="eth0"

Així doncs, podem fer servir eth0 i eth1 al fitxer de configuració etc/network/interfaces sense preocupacions.

• Network Configuration a la wiki de Debian.
• NetworkManager a la wiki de Debian.
• Chapter 5. Network setup, a Debian Reference, by Osamu Aoki.
• Disable NetworkManager
• …

Aquesta és la configuració de xarxa provissional emprada per la instal·lació i configuració del sistema operatiu i del programa TopSpin.

/etc/hosts

127.0.0.1	localhost
127.0.1.1	cie-55-31.uab.es	cie-55-31

/etc/resolv.conf

domain uab.es
search uab.es
nameserver 158.109.0.9
nameserver 158.109.254.130
nameserver 158.109.0.1

/etc/network/interfaces

# This file describes the network interfaces available on your system
# and how to activate them. For more information, see interfaces(5).

# The loopback network interface
auto lo
iface lo inet loopback

# Ethernet interfaces are assigned to physical devices in a
# persistent way according to rules in file:
#
#   /etc/udev/rules.d/70-persistent-net.rules
#
# Hence, each of eth0 and eth1 will **always** correspond to
# the same device. The configuration below assumes that,
#
#   eth0 -> lan (internet)
#   eth1 -> nmr (spectrometer ccu or ipso)
#
auto eth0 eth1

# LAN / INTERNET - Assigned to the primary network interface,
# which usually will be the motherboard integrated NIC.
#
iface eth0 inet static
    address 158.109.55.31
    netmask 255.255.240.0
    broadcast 158.109.63.255
    gateway 158.109.0.3

# NMR CONSOLE LAN - Assigned to the secondary network interface,
# which usually will be the added NIC.
#
iface eth1 inet static
    address 149.236.99.1
    netmask 255.255.255.0
    network 149.236.99.0
    broadcast 10.10.255.255

/etc/udev/rules.d/70-persistent-net.rules

# This file was automatically generated by the /lib/udev/write_net_rules
# program, run by the persistent-net-generator.rules rules file.
#
# You can modify it, as long as you keep each rule on a single
# line, and change only the value of the NAME= key.

# PCI device 0x14e4:0x167b (tg3)
SUBSYSTEM=="net", ACTION=="add", DRIVERS=="?*", ATTR{address}=="00:10:18:27:55:de",
ATTR{dev_id}=="0x0", ATTR{type}=="1", KERNEL=="eth*", NAME="eth0"

# PCI device 0x14e4:0x1677 (tg3)
SUBSYSTEM=="net", ACTION=="add", DRIVERS=="?*", ATTR{address}=="00:19:bb:57:96:9b",
ATTR{dev_id}=="0x0", ATTR{type}=="1", KERNEL=="eth*", NAME="eth1"

S'ha de configurar (fitxer /etc/avahi/avahi-daemon.conf) per tal de restringir la difusió dels serveis disponibles a l'ordinador i, potser, la cerca de serveis a la xarxa.

Enllaços sobre la configuració del tftpd

• http://chschneider.eu/linux/server/tftpd-hpa.shtml
• http://diablo.craem.net/wordpress/?p=171
• …

Cal configurar-lo per servir el sistema operatiu de la consola.

Cal configurar-lo per servir el sistema operatiu de la consola.

Instal·lo el paquet ntp i al final del fitxer /etc/ntp.conf afegeixo els següents servidors de temps,

• server swisstime.ethz.ch
• server ntp.uab.es
• server ntp.univ-lyon1.fr

He afegit nous magatzems (repositories) per tal de poder instal·lar programes addicionals o versions més noves d'alguns programes.

En primer lloc, em descarrego i afegeixo la clau del magatzem Debian Mozilla

# wget -O- -q http://mozilla.debian.net/archive.asc | gpg --import
# gpg --check-sigs --fingerprint --keyring /usr/share/keyrings/debian-archive-keyring.gpg
# gpg --export -a 06C4AE2A | apt-key add -

i la clau del magatzem Debian Multimedia,

# aptitude install deb-multimedia-keyring

Després actualitzo el registres dels programes apt-get i aptitude

# apt-get update
# aptitude update

La targeta gràfica és una NVIDIA Quadro FX 560 (G73GL [10DE:39E]) que funciona amb el driver Noveau, però per tenir les màximes prestacions decideixo instal·lar el driver propietari de Nvidia. Per això, instal·lo el paquet nvidia-legacy-304xx-driver que alhora instal·la els paquets necessaris per compilar el mòdul del driver pel kernel, entre altres:

• cpp-4.8, gcc-4.8
• dkms, fakeroot,
• glx-alternative-mesa, glx-alternative-nvidia, glx-diversions,
• nvidia-installer-cleanup, nvidia-kernel-common, nvidia-legacy-304xx-alternative, nvidia-legacy-304xx-kernel-dkms, nvidia-settings-legacy-304xx, nvidia-support,
• xserver-xorg-video-nvidia-legacy-304xx

També instal·lo nvidia-detect tot i que no és imprescindible.

Un cop completada la instal·lació, cal reiniciar l'ordinador per fer servir el nou controlador gràfic.

La targeta de xarxa addicional és una NetXtreme BCM5751 Gigabit Ethernet PCI Express ([14E4:1677]) de Broadcom Corporation, i funciona amb el driver tg3 que ve per defecte amb el kernel, de forma que no cal instal·lar cap paquet de software addicional.

Quan tot estigui funcionant caldrà verificar la configuració de la BIOS, per exemple, per protegir l'accés amb una contrasenya.

• Debian SELinux support. The Debian packaged Linux kernels have had SELinux support compiled in (but disabled by default) since version 2.6.9.
  • SELinux Setup
• Security-Enhanced_Linux
• SELinux Project Wiki
• SELINUX (Security-Enhanced Linux)
• Securing and Hardening Red Hat Linux Production Systems. A Practical Guide to Basic Linux Security in Production Enterprise Environments. Written by Werner Puschitz.

• Devil's Pie is a window-matching utility, inspired by Sawfish's “Matched Windows” option and the lack of the functionality in Metacity. Metacity lacking window matching is not a bad thing — Metacity is a lean window manager, and window matching does not have to be a window manager task. Devil's Pie can be configured to detect windows as they are created, and match the window to a set of rules. If the window matches the rules, it can perform a series of actions on that window. For example, I can make all windows created by X-Chat appear on all workspaces, and the main Gkrellm1 window does not appear in the pager or task list.
• Devilspie is a non-gui utility that lets you make applications start in specified workplaces, in specified sizes and placements, minimized or maximized and much more based on simple config files.
• GDevilspie is a user friendly interface to the devilspie window matching daemon, to create rules easily.
  • How do I tell a start up program to start minimized?

• TeamViewer the All-In-One Solution for Remote Access and Support over the Internet. TeamViewer connects to any PC or server around the world within a few seconds. You can remote control your partner's PC as if you were sitting right in front of it.

Consultar els següents enllaços sobre cóm millorar o personalitzar el comportament de Gnome

• GNOME at ArchLinux
  • GNOME Tips
  • Configuring GDM 2.28

• Instal·lació del Topspin 3.5
• Instal·lació del Topspin 3.1 Actualment desinstal·lat
• Instal·lació del Topspin 2.1 Actualment desinstal·lat

La millora consisteix en l'actualització del kernel a la versió 3.x.

Segueixo les instruccions a nixCraft. De forma resumida:

root@cie-55-31:~# apt-get -t squeeze-backports install linux-image-3.2.0-0.bpo.4-amd64 firmware-linux-free firmware-linux-nonfree linux-headers-3.2.0-0.bpo.4-amd64 
Reading package lists... Done
Building dependency tree       
Reading state information... Done
firmware-linux-free is already the newest version.
The following extra packages will be installed:
  initramfs-tools linux-base linux-headers-3.2.0-0.bpo.4-common linux-kbuild-3.2
Suggested packages:
  linux-doc-3.2 debian-kernel-handbook
The following NEW packages will be installed:
  linux-headers-3.2.0-0.bpo.4-amd64 linux-headers-3.2.0-0.bpo.4-common linux-image-3.2.0-0.bpo.4-amd64
  linux-kbuild-3.2
The following packages will be upgraded:
  firmware-linux-nonfree initramfs-tools linux-base
3 upgraded, 4 newly installed, 0 to remove and 114 not upgraded.
Need to get 28.7 MB of archives.
After this operation, 142 MB of additional disk space will be used.
Do you want to continue [Y/n]? 

Contesto y[es] per iniciar la descàrrega i instal·lació dels paquets necessàries. Aquest cop només surten alguns avisos i preguntes relatius a l'actualització d'alguns programes, i l'actualització es completa sense problemes.

Setting up linux-base (3.4~bpo60+1) ...
Setting up linux-image-3.2.0-0.bpo.4-amd64 (3.2.46-1~bpo60+1) ...
Running depmod.
Examining /etc/kernel/postinst.d.
run-parts: executing /etc/kernel/postinst.d/initramfs-tools 3.2.0-0.bpo.4-amd64 /boot/vmlinuz-3.2.0-0.bpo.4-amd64
update-initramfs: Generating /boot/initrd.img-3.2.0-0.bpo.4-amd64
run-parts: executing /etc/kernel/postinst.d/pm-utils 3.2.0-0.bpo.4-amd64 /boot/vmlinuz-3.2.0-0.bpo.4-amd64
run-parts: executing /etc/kernel/postinst.d/update-notifier 3.2.0-0.bpo.4-amd64 /boot/vmlinuz-3.2.0-0.bpo.4-amd64
run-parts: executing /etc/kernel/postinst.d/zz-update-grub 3.2.0-0.bpo.4-amd64 /boot/vmlinuz-3.2.0-0.bpo.4-amd64
Generating grub.cfg ...
Found background image: /usr/share/images/desktop-base/desktop-grub.png
Found linux image: /boot/vmlinuz-3.2.0-0.bpo.4-amd64
Found initrd image: /boot/initrd.img-3.2.0-0.bpo.4-amd64
Found linux image: /boot/vmlinuz-2.6.32-5-amd64
Found initrd image: /boot/initrd.img-2.6.32-5-amd64
done
Setting up firmware-linux-nonfree (0.36+wheezy.1~bpo60+1) ...
update-initramfs: deferring update (trigger activated)
Setting up linux-headers-3.2.0-0.bpo.4-common (3.2.46-1~bpo60+1) ...
Setting up linux-kbuild-3.2 (3.2.1-2~bpo60+1) ...
Setting up linux-headers-3.2.0-0.bpo.4-amd64 (3.2.46-1~bpo60+1) ...
Processing triggers for initramfs-tools ...
update-initramfs: Generating /boot/initrd.img-3.2.0-0.bpo.4-amd64
root@cie-55-31:~# 

Després de reiniciar l'ordinador comprovo que s'estigui executant el nou kernel,

sermnadmin@cie-56-18:~$ cat /proc/version
Linux version 3.2.0-0.bpo.4-amd64 (debian-kernel@lists.debian.org) (gcc version 4.4.5 (Debian 4.4.5-8) ) #1 SMP Debian 3.2.46-1~bpo60+1

sermnadmin@cie-56-18:~$ uname -a
Linux cie-56-18 3.2.0-0.bpo.4-amd64 #1 SMP Debian 3.2.46-1~bpo60+1 x86_64 GNU/Linux

La targeta gràfica d'aquesta estació de treball és,

VGA compatible controller
/0/100/1/0

product: G73GL [Quadro FX 560] [10DE:39E]
vendor: nVidia Corporation [10DE]
bus info: pci@0000:01:00.0
version: a1
width: 64 bits
clock: 33MHz
capabilities:
	Power Management,
	Message Signalled Interrupts,
	PCI Express,
	vga_controller,
	bus mastering,
	PCI capabilities listing,
	extension ROM
configuration:
	driver: nouveau
	latency: 0
resources:
	irq: 16
	memory: e1000000-e1ffffff
	memory: d0000000-dfffffff
	memory: e2000000-e2ffffff
	ioport: 1000(size=128)
	memory: e0000000-e001ffff

Segueixo les instruccions a Wiki Debian per la instal·lació del NVIDIA Proprietary Driver a Debian 6.0 “Squeeze”, però instal·lo una versió més nova del controlador disponible a squeeze-backports,

root@cie-55-31:/etc/X11# aptitude -t squeeze-backports install nvidia-kernel-dkms
The following NEW packages will be installed:
  dkms{a} fakeroot{a} glx-alternative-mesa{a} glx-alternative-nvidia{a} glx-diversions{a} libgl1-nvidia-alternatives{a} 
  libgl1-nvidia-glx{a} libglx-nvidia-alternatives{a} libvdpau1{a} make{a} nvidia-alternative{a} nvidia-glx{a} 
  nvidia-installer-cleanup{a} nvidia-kernel-common{a} nvidia-kernel-dkms nvidia-support{a} nvidia-vdpau-driver{a} 
  xserver-xorg-video-nvidia{a} 
0 packages upgraded, 18 newly installed, 0 to remove and 114 not upgraded.
Need to get 26.0 MB of archives. After unpacking 88.9 MB will be used.
Do you want to continue? [Y/n/?]

després de contestar y[es] es descarreguen i instal·len els nous paquets,

Get:1 http://ftp.caliu.cat/debian/ squeeze/main libvdpau1 amd64 0.4.1-2 [32.2 kB]
Get:2 http://ftp.caliu.cat/debian/ squeeze/main make amd64 3.81-8 [398 kB]      
Get:3 http://ftp.caliu.cat/debian/ squeeze/main fakeroot amd64 1.14.4-1 [100 kB]
Get:4 http://backports.debian.org/debian-backports/ squeeze-backports/contrib nvidia-installer-cleanup amd64 20111111+1~bpo60+1 [16.1 kB]


[...]

update-initramfs: deferring update (trigger activated)
Setting up nvidia-kernel-dkms (295.59-1~bpo60+2) ...
Loading new nvidia-295.59 DKMS files...
First Installation: checking all kernels...
Building only for 3.2.0-0.bpo.4-amd64
Building initial module for 3.2.0-0.bpo.4-amd64
Done.

nvidia.ko:
Running module version sanity check.
 - Original module
   - No original module exists within this kernel
 - Installation
   - Installing to /lib/modules/3.2.0-0.bpo.4-amd64/updates/dkms/

update-initramfs: deferring update (trigger activated)
Setting up nvidia-kernel-dkms (295.59-1~bpo60+2) ...
Loading new nvidia-295.59 DKMS files...
First Installation: checking all kernels...
Building only for 3.2.0-0.bpo.4-amd64
Building initial module for 3.2.0-0.bpo.4-amd64
Done.

nvidia:
Running module version sanity check.
 - Original module
   - No original module exists within this kernel
 - Installation
   - Installing to /lib/modules/3.2.0-0.bpo.4-amd64/updates/dkms/

depmod......

DKMS: install Completed.
Setting up fakeroot (1.14.4-1) ...
update-alternatives: using /usr/bin/fakeroot-sysv to provide /usr/bin/fakeroot (fakeroot) in auto mode.
Processing triggers for nvidia-alternative ...
update-alternatives: using /usr/lib/nvidia/current to provide /usr/lib/nvidia/nvidia (nvidia) in auto mode.
Processing triggers for glx-alternative-nvidia ...
update-alternatives: using /usr/lib/nvidia to provide /usr/lib/glx (glx) in auto mode.
Setting up libgl1-nvidia-glx (295.59-1~bpo60+2) ...
Setting up xserver-xorg-video-nvidia (295.59-1~bpo60+2) ...
Setting up nvidia-glx (295.59-1~bpo60+2) ...
No diversion 'diversion of /usr/lib/xorg/modules/extensions/libGLcore.so to /usr/lib/nvidia/libGLcore.so.xlibmesa by nvidia-glx', none removed.
No diversion 'diversion of /usr/lib/xorg/modules/extensions/libGLcore.a to /usr/lib/nvidia/libGLcore.a.xlibmesa by nvidia-glx', none removed.
No diversion 'diversion of /usr/lib/xorg/modules/extensions/libglx.a to /usr/lib/nvidia/libglx.a.xlibmesa by nvidia-glx', none removed.
Processing triggers for initramfs-tools ...
update-initramfs: Generating /boot/initrd.img-3.2.0-0.bpo.4-amd64

Processing triggers for glx-alternative-mesa ...

Durant el procés d'instal·lació ha sortit un missatge per indicar la incompatibilitat entre el nou controlador acabat d'instal·lar i el mòdul noveau del kernel. Aquesta incompatibilitat es resol amb la desactivació del mòdul noveau (comanda update-initramfs -u, ja executada pel programa d'instal·lació) i serà efectiva el primer cop que es reiniciï l'ordinador.

El darrer pas és crear un fitxer de configuració del servidor Xorg fent servir la comanda nvidia-xconfig, però primer he d'instal·lar el paquet corresponent,

root@cie-55-31:/etc/X11# aptitude install nvidia-xconfig
The following NEW packages will be installed:
  nvidia-xconfig 
0 packages upgraded, 1 newly installed, 0 to remove and 1 not upgraded.
Need to get 79.7 kB of archives. After unpacking 254 kB will be used.
Get:1 http://ftp.caliu.cat/debian/ squeeze/contrib nvidia-xconfig amd64 195.36.31-1 [79.7 kB]
Fetched 79.7 kB in 0s (2,191 kB/s)
Selecting previously deselected package nvidia-xconfig.
(Reading database ... 133326 files and directories currently installed.)
Unpacking nvidia-xconfig (from .../nvidia-xconfig_195.36.31-1_amd64.deb) ...
Processing triggers for man-db ...
Setting up nvidia-xconfig (195.36.31-1) ...

root@cie-55-31:/etc/X11# nvidia-xconfig 

WARNING: Unable to locate/open X configuration file.

New X configuration file written to '/etc/X11/xorg.conf'

El fitxer creat conté la configuració bàsica de tots els dispositius, però en realitat sembla ser que n'hi hauria prou amb incloure el dispositiu de la targeta gràfica, ja que aquest és l'únic que no detecta el kernel,

Section "Device"
    Identifier     "Device0"
    Driver         "nvidia"
    VendorName     "NVIDIA Corporation"
EndSection

sermnuab@cie-55-31:~/data$ pwd
/home/sermnuab/data
sermnuab@cie-55-31:~/data$ rsync -aHxv sermn@cie-55-32.uab.cat:/opt/sermn-uab/data .
sermn@cie-55-32.uab.cat's password: 
receiving file list ... 

...
data/test/nmr/tune-31P/1/shimvalues
data/test/nmr/tune-31P/1/uxnmr.par

sent 17704056 bytes  received 76377836597 bytes  8068388.94 bytes/sec
total size is 76313158145  speedup is 1.00

sermnadmin@cie-55-31:~$ df -hl
Filesystem            Size  Used Avail Use% Mounted on
/dev/sda1              19G  3.4G   15G  20% /
tmpfs                 2.0G     0  2.0G   0% /lib/init/rw
udev                  2.0G  188K  2.0G   1% /dev
tmpfs                 2.0G  8.0K  2.0G   1% /dev/shm
/dev/sda8              95G   82G  8.0G  92% /home
/dev/sda7              19G  3.9G   14G  23% /opt
/dev/sda5             4.6G  593M  3.8G  14% /var

En cas d'urgència, es podria reduir la mida de les particions SWAP (de 12 GB a 4 GB) i OPT (de 20 GB a 8 GB) i ampliar la partició HOME en 20 GB, però em sembla que seria molta feina per tan poc guany.

Per evitar que els usuaris facin ús dels ports USB per connectar pendrives o discos externs, o del lector de CD/DVD, edito el fitxer /etc/group i els bloquejo l'accés eliminant l'usuari sermnuab dels grups cdrom i plugdev.

Afegeixo un segon monitor HP Compaq LA1951g de 19“ procedent de l'ordinador de l'AvanceII+ 600 MHz, i el configuro a través del programa nvidia-settings com a monitor secundari en mode TwinView ( NVIDIA Accelerated Linux Graphics Driver README and Installation Guide - Chapter 13. Configuring TwinView).

A continuació, redueixo el nombre d'espais de treball (workspaces) de dos a un, i configuro les finestres del TopSpin, Lock Display i BSMS Control Suite amb el programa devilspie perquè s'obrin al monitor principal (TopSpin, pantalla sencera), o la monitor secundari (Lock Display i BSMS Control Suite).

Mentre no es canviï el disc dur per un de més capacitat (aquest només és de 160 GB i està molt plè), caldrà tenir present que la partició per dades de rmn té una capacitat útil d'uns 80-90 GB,

sermnadmin@cie-55-31:~$ df -hl
Filesystem            Size  Used Avail Use% Mounted on
:
/dev/sda8              95G   82G  8.0G  92% /home

i que tot sovint s'omplirà. En aquests casos, caldrà esborrar els fitxers que contenen els espectres bidimensionals transformats: primer els 2ir, 2ii i 2ri de més de sis mesos d'antiguitat, i després els 2rr de més d'un any d'antiguitat. Aquests intervals de temps es podrien reduir si fos necessari.

Per esborrar els fitxers 2ir, 2ii i 2ri de més de sis mesos (183 dies) d'antiguitat, com a superusuari executarem les següents comandes en una finestra de terminal:

• find . -ctime +183 -name 2i[r,i] -ls -exec rm -f {} \;
• find . -ctime +183 -name 2ri -ls -exec rm -f {} \;

root@cie-55-31:/home/sermnuab/# cd ./data

root@cie-55-31:/home/sermnuab/data# find . -ctime +183 -name 2i[r,i] -ls -exec rm -f {} \;
1032503 8204 -rw-r--r--   1 sermnuab sermnuab  8388608 Nov 12  2015 ./pau/nmr/estric151112/6/pdata/1/2ii
1032501 8204 -rw-r--r--   1 sermnuab sermnuab  8388608 Nov 12  2015 ./pau/nmr/estric151112/6/pdata/1/2ir
1017626 8204 -rw-r--r--   1 sermnuab sermnuab  8388608 Nov 12  2015 ./pau/nmr/estric151112/4/pdata/1/2ii
1017624 8204 -rw-r--r--   1 sermnuab sermnuab  8388608 Nov 12  2015 ./pau/nmr/estric151112/4/pdata/1/2ir
1017604 16404 -rw-r--r--   1 sermnuab sermnuab 16777216 Nov 12  2015 ./pau/nmr/estric151112/3/pdata/1/2ii
1024179 8204 -rw-r--r--   1 sermnuab sermnuab  8388608 Nov 12  2015 ./pau/nmr/estric151112/5/pdata/1/2ii
1024180 8204 -rw-r--r--   1 sermnuab sermnuab  8388608 Nov 12  2015 ./pau/nmr/estric151112/5/pdata/1/2ir
:
:
root@cie-55-31:/home/sermnuab/data# find . -ctime +183 -name 2ri -ls -exec rm -f {} \;
:
11873 8204 -rw-r--r--   1 sermnuab sermnuab  8388608 Nov 12  2015 ./pau/nmr/estric151112-2/4/pdata/1/2ri
11843 8204 -rw-r--r--   1 sermnuab sermnuab  8388608 Nov 12  2015 ./pau/nmr/estric151112-2/2/pdata/1/2ri
6152831 8204 -rw-r--r--   1 sermnuab sermnuab  8388608 Nov 12  2015 ./pau/nmr/estric151112-2/8/pdata/1/2ri
238353 8204 -rw-r--r--   1 sermnuab sermnuab  8388608 Nov 24  2015 ./pau/nmr/estric151112-2/9/pdata/1/2ri
:

Per esborrar els fitxers 2rr de més d'un any (365 dies) d'antiguitat, com a superusuari executarem la següent comanda en una finestra de terminal:

• find . -ctime +365 -name 2rr -ls -exec rm -f {} \;

Per exemple:

root@cie-55-31:/home/sermnuab/# cd ./data

root@cie-55-31:/home/sermnuab/data# find . -ctime +365 -name 2rr -ls -exec rm -f {} \;
:
1032500 8204 -rw-r--r--   1 sermnuab sermnuab  8388608 Nov 12  2015 ./pau/nmr/estric151112/6/pdata/1/2rr
1017623 8204 -rw-r--r--   1 sermnuab sermnuab  8388608 Nov 12  2015 ./pau/nmr/estric151112/4/pdata/1/2rr
1017603 16404 -rw-r--r--   1 sermnuab sermnuab 16777216 Nov 12  2015 ./pau/nmr/estric151112/3/pdata/1/2rr
984227 16404 -rw-r--r--   1 sermnuab sermnuab 16777216 Nov 12  2015 ./pau/nmr/estric151112/2/pdata/1/2rr
1024184 8204 -rw-r--r--   1 sermnuab sermnuab  8388608 Nov 12  2015 ./pau/nmr/estric151112/5/pdata/1/2rr
:

La fallida sobtada del disc dur de l'ordinador fa que hagi de substiuir el disc i reinstal·lar el sistema operatiu i el TopSpin, fet que aprofito per actualitzar-los a les darreres versions disponibles:

• GNU/Linux Debian 8.8.0, Codename Jessie
• Bruker TopSpin 3.5 pl-6.

Els detalls del procés d'actualització es poden consultar a la següent pàgina.

S'actualitza l'ordinador amb la reconfiguració dels volums lògics (particions) al disc:

• es redueix l'espai del volum lògic home de ~440 Gb a 400 Gb, i
• amb l'espai alliberat es crea el volum lògic opt, i
• s'allibera espai a la volum lògic root

Això permet la instal·lació de:

• Linux Kernel 4.9.0

Finalment, s'instal·la la darrera versió de TopSpin disponible per consoles AvanceIII:

• Bruker TopSpin 3.6.1

Els detalls del procés d'actualització es poden consultar a la següent pàgina.