Estació de treball HP Z240T pel BioSpec 70/30USR

Aquesta estació de treball es va comprar al juliol de 2016 per substituir l'estació de treball HP xw4300 de l'espectròmetre Bruker BioSpec 70/30USR.

Es va instal·lar la versió 8.x de GNU/Linux Debian, i la versio 5.x del ParaVision.

Especificacions del maquinari amb data de 2016-xx-xx:

root@partedmagic:~# lshw
partedmagic               
    description: Mini Tower Computer
    product: ...
             

Especificacions del processador amb data de 2016-xx-xx:

root@partedmagic:~# cat /proc/cpuinfo 
processor	: 0
vendor_id	: GenuineIntel
...

Per la connexió amb la consola via Ethernet compro a Misco una targeta Intel Ethernet I210-T1 Gigabit NIC comercialitzada per Hewlett Packard,

HP Tarjeta Intel Ethernet L210-T1 GBE NIC

i la instal·lo en un port PCIe 3.0 x4.

Per la connexió amb la consola via port sèrie, compro a Misco una targeta StarTech.com 2 Port Native PCI Express RS232 Serial Adapter Card with 16950 UART

i la instal·lo en un port PCIe 3.0 x1.

Aquest cop no cal fer cap operació especial amb el disc dur abans d'instal·lar el Debian GNU/Linux.

El disc dur ve amb Windows 7 / Windows 10 pre-instal·lats. Com que no els volem per res, decideixo sobreescriure el contingut i les particions de Windows, i aprofitar tot el disc per la instal·lació de GNU/Linux.

En comptes de crear les particions abans d'instal·lar el Debian GNU/Linux, faré servir el programa d'instal·lació per repartir el disc fent ús del gestor de volums lògics LVM2, però miraré de seguir l'esquema de partició emprat a altres estacions de treball d'espectròmetres:

• Partició primària / (root) de 20 GiB. Inclou /usr i /tmp
• Partició lògica /var de 10 GiB.
• Partició swap de 12 GiB.
• Partició lògica /opt de 40 GiB. Pel ParaVision i altre programari Bruker.
• Partició lògica /home de 350 GiB.

tot i que caldrà adaptar-ho al major volum de les dades adquirides amb el BioSpec, i a l'ús del gestor de volums lògics LVM2 en comptes de particions tradicionals.

Instal·lo la distribució GNU/Linux a partir d'un pendrive. La distribució de GNU/Linux instal·lada és la Debian version 8.5, released on June 4th, 2016, codenamed jessie, AMD64 architecture. El programa d'instal·lació detecta que es tracta d'un ordinador compatible amb UEFI i tria aquesta versió del programa debian-installer.

• Language: English
• Country: Spain
• Locale: en_US.UTF-8
• Keymap: Spanish
• Host name: cie-50-189 (configuració manual provisional)
• Domain name: uab.cat (configuració manual provisional)
• User name:
  • sermnuab (SeRMN-UAB Users)
  • sermnadmin (SeRMN-UAB Staff)
• Time zone: Madrid

Faig servir l'opció “Whole disk using LVM” que crea les següents particions al disc:

esquema de particions: boot + ESP (UEFI) + LVM

amb la configuració del LVM:

Physical volume: /dev/sda3
Volume groups:   cie-50-189-vg
Logical volumes: home, root, swap_1, tmp, var

Les col·leccions de programes a instal·lar seleccionades són:

• Desktop Environment
• Standard System

La resta de programes que poguessin ser necessaris, s'instal·laran més endavant.

GRUB Boot Loader s'instal·la a /dev/sda

Un cop s'han instal·lat tots els paquets, reinicio l'ordinador i entro a la sessió de GNU/Debian Jessie.

Quan reinicio l'ordinador, surt un missatge que indica que no troba cap sistema operatiu al disc. Segueixo les indicacions a les pàgines següents per comprovar què passa:

• https://wiki.debian.org/UEFI
• https://wiki.debian.org/GrubEFIReinstall

i la solució final és to force grub-efi installation to the removable media path o to hijack the uefi fallback boot loader.

Per més informació sobre UEFI i els problemes associats a una implementació incorrecte consultar:

• UEFI - Debian Wiki
• UEFI - Ubuntu Official Documentation
• Booting with EFI
• Documentation for the rEFInd boot manager

Afegeixo altres magatzems (repositories) de programes a etc/apt/sources.list.d/:

• 0-stable.list (Debian Stable repository)
• 1-security.list (Debian Security repository)
• 2-mozilla.list (Debian Mozilla repository). Proporciona el navegador Firefox.
• 3-google-chrom.list (Google Chrome for Debian repository). Proporciona el navegador Chrome de Google.
• 5-deb-multimedia.list (Debian Multimedia repository). Proporciona el programa Acrobar Reader.

Abans de poder treballar amb el magatzem de Debian Mozilla instal·lo primer el paquet pkg-mozilla-archive-keyring del magatzem de Debian Stable.

Per poder treballar amb el magatzem de Debian Multimedia, el primer paquet a descarregar i install·lo és el deb-multimedia-keyring.

Per poder treballar amb el magatzem de Google Chrome per Debian, primer cal descarregar-se i instal·lar la seva clau de signatura amb la comanda wget -q -O - https://dl.google.com/linux/linux_signing_key.pub | sudo apt-key add -.

A les següents pàgines es poden consultar altres magatzems disponibes:

• Debian Wiki - Unofficial Repositories
• My Debian source.list. Craigevil's Giant Debian /etc/apt/sources.list Updated October 24, 2012. Si aquesta data és correcta, llavors aquesta llista no està actualitzada i cal prendre-se-la amb precaució.

Afegeixo els següents paquets o programes (aquest no és un llistat exhaustiu, només inclou els dimonis i servidors de xarxa, i altres programes importants):

• ssh (openssh-server, openssh-client)
• mc (midnight commander)
• htop, iotop, sysstat
• glances, atop, nmon
• iftop, nethogs, iptraf-ng
• strace, ltrace, latrace
• sysdig (Per ara no l'instal·lo perquè requereix la instal·lació d'un munt de paquets addicionals. M'hauré de pensar si compensa).
• rsync
• ftp-ssl en comptes de ftp
• fail2ban (substitueix a denyhosts pels motius exposats a Debian Bug report logs - #732712. Per configurar fail2ban consultar els enllaços Replacing denyhosts with fail2ban for Debian i Migrate from DenyHosts to Fail2ban.
• nfs-kernel-server
• tftp-hpa
• tftpd-hpa Cal reconfigurar!
• bootparamd Cal reconfigurar!
• xinetd (en comptes del programa per defecte: openbsd-inetd)
• lshw i lshw-gtk
• system-config-lvm
• gparted, testdisk

Elimino els paquets o programes:

• telnet
• …

Elimino els següents metapackages per poder eliminar altres paquets o programes que depenen d'ells sense haver de desinstal·lar altres paquets que sí que m'interessen,

• gnome
• gnome-desktop-environment
• gnome-office

Llavors desinstal·lo:

• gnome-games, gnome-games-data, gnome-games-extra-data
• simple-scan, xsane, xsane-common, i les biblioteques relacionades
• …

Substitueixo:

• la versió lliure de Java (java-6-openjdk i paquets que en dependen) per la versió oficial (sun-java6-jdk i paquets que en depenen).

La pantalla es configura automàticament amb una resolució de 1024×768 en comptes de la resolució òptima del monitor: 1920×1080. Alhora, al menú Display no surt la marca i model del monitor, com si no el reconegués correctament, però comprovo que el sistema operatiu sí que detecta correctament el monitor,

root@cie-50-189:~# hwinfo --monitor
20: None 00.0: 10002 LCD Monitor                                
  [Created at monitor.95]
  Unique ID: rdCR.2arDg51H8e3
  Hardware Class: monitor
  Model: "VIEWSONIC VA2445 SERIES"
  Vendor: VSC "VIEWSONIC"
  Device: eisa 0x712e "VA2445 SERIES"
  Serial ID: "TSQ160140056"
  Resolution: 720x400@70Hz
  Resolution: 640x480@60Hz
  ...
  Resolution: 1600x900@60Hz
  Resolution: 1920x1080@60Hz
  Size: 521x293 mm
  Detailed Timings #0:
     Resolution: 1920x1080
     Horizontal: 1920 2008 2052 2200 (+88 +132 +280) +hsync
       Vertical: 1080 1084 1089 1125 (+4 +9 +45) +vsync
    Frequencies: 148.50 MHz, 67.50 kHz, 60.00 Hz
  Driver Info #0:
    Max. Resolution: 1920x1080
    Vert. Sync Range: 50-75 Hz
    Hor. Sync Range: 24-82 kHz
    Bandwidth: 148 MHz
  Config Status: cfg=new, avail=yes, need=no, active=unknown

i també la targeta gràfica que hi ha a la placa base,

root@cie-50-189:~# hwinfo --framebuffer
02: None 00.0: 11001 VESA Framebuffer                           
  [Created at bios.459]
  Unique ID: rdCR.QstqgPARaQB
  Hardware Class: framebuffer
  Model: ""
  Vendor: ""
  Device: ""
  SubVendor: "Intel(R) SKL Mobile/Desktop Graphics Chipset Accelerated VGA BIOS"
  SubDevice: 
  Revision: ""
  Memory Size: 127 MB + 960 kB
  Memory Range: 0xc0000000-0xc7feffff (rw)
  Mode 0x0307: 1280x1024 (+1280), 8 bits
  ...
  Mode 0x037d: 1920x1080 (+1920), 8 bits
  Mode 0x037e: 1920x1080 (+3840), 16 bits
  Mode 0x037f: 1920x1080 (+7680), 24 bits
  Config Status: cfg=new, avail=yes, need=no, active=unknown

Així doncs, tot apunta a que hi ha un problema amb el controlador de la targeta gràfica.

Algun d'aquests enllaços podria ser útil:

• Graphics Drivers for Linux - Support Home Intel® Graphics Drivers¡
• Intel Graphics for Linux
  • Intel Graphics Installer for Linux* 1.4.0 - Intel Graphics for Linux
• Early Intel Skylake Linux Users May Run Into A Silly Issue
• Intel Skylake HD Graphics 530 Performance On Linux
• Can't get Intel HD Graphics 530 (Skylake i7 6700) to work
• Missing firmware in Debian? Learn how to deal with the problem

Al final, després de consultar un munt de pàgines i fòrums a Internet, i després de comprovar els registres del sistema (entre altres: Xorg.0.log, dmesg, lspci) i comparlar-los amb els de l'estació de treball HP Z230, aconsegueixo acotar el problema al DRM/DRI del gestor de gràfics.

Així doncs, al fitxer Xorg.0.log de l'estació de treball HP Z240 veig que manca la línia (II) xfree86: Adding drm device (/dev/dri/card0) que sí que surt al fitxer de registre Xorg.0.log de l'estació de treball HP Z230, i que això es tradueix en un seguit d'errors a l'hora d'instal·lar diferents mòduls del gestor de gràfics X11.

root@cie-50-189:/var/log# more Xorg.0.log 
[     9.613] 
X.Org X Server 1.16.4
Release Date: 2014-12-20
[     9.613] X Protocol Version 11, Revision 0
[     9.613] Build Operating System: Linux 3.16.0-4-amd64 x86_64 Debian
[     9.613] Current Operating System: Linux cie-50-189 3.16.0-4-amd64 #1 SMP Debian 3.16.7-ckt25-2+deb8u3 (2016-07-02
) x86_64
[     9.613] Kernel command line: BOOT_IMAGE=/vmlinuz-3.16.0-4-amd64 root=/dev/mapper/cie--50--189--vg-root ro
[     9.613] Build Date: 11 February 2015  12:32:02AM
[     9.613] xorg-server 2:1.16.4-1 (http://www.debian.org/support) 
...
[     9.685] (==) ModulePath set to "/usr/lib/xorg/modules"
[     9.685] (II) The server relies on udev to provide the list of input devices.
	If no devices become available, reconfigure udev or disable AutoAddDevices.
[     9.685] (II) Loader magic: 0x7f8383d1ed80
[     9.685] (II) Module ABI versions:
[     9.685] 	X.Org ANSI C Emulation: 0.4
[     9.685] 	X.Org Video Driver: 18.0
[     9.685] 	X.Org XInput driver : 21.0
[     9.685] 	X.Org Server Extension : 8.0
[     9.687] (--) PCI:*(0:0:2:0) 8086:191d:103c:802f rev 6, Mem @ 0xd0000000/16777216, 0xc0000000/268435456, I/O @ 0x0
0003000/64
[     9.687] (II) LoadModule: "glx"
[     9.688] (II) Loading /usr/lib/xorg/modules/extensions/libglx.so
...
[     9.758] (EE) open /dev/dri/card0: No such file or directory
[     9.758] (WW) Falling back to old probe method for modesetting
[     9.758] (EE) open /dev/dri/card0: No such file or directory
...

root@cie-55-32:/var/log# more Xorg.0.log
[    24.069] 
X.Org X Server 1.16.4
Release Date: 2014-12-20
[    24.069] X Protocol Version 11, Revision 0
[    24.069] Build Operating System: Linux 3.16.0-4-amd64 x86_64 Debian
[    24.069] Current Operating System: Linux cie-55-32 4.4.0-0.bpo.1-amd64 #1 SMP Debian 4.4.6-1~bpo8+1 (2016-03-20) x
86_64
[    24.069] Kernel command line: BOOT_IMAGE=/boot/vmlinuz-4.4.0-0.bpo.1-amd64 root=UUID=71ea6b15-3a41-424f-8ade-86b90
d79aece ro
[    24.069] Build Date: 11 February 2015  12:32:02AM
[    24.069] xorg-server 2:1.16.4-1 (http://www.debian.org/support) 
...
[    24.168] (==) ModulePath set to "/usr/lib/xorg/modules"
[    24.168] (II) The server relies on udev to provide the list of input devices.
	If no devices become available, reconfigure udev or disable AutoAddDevices.
[    24.168] (II) Loader magic: 0x5572dcb65d80
[    24.169] (II) Module ABI versions:
[    24.169] 	X.Org ANSI C Emulation: 0.4
[    24.169] 	X.Org Video Driver: 18.0
[    24.169] 	X.Org XInput driver : 21.0
[    24.169] 	X.Org Server Extension : 8.0
[    24.169] (II) xfree86: Adding drm device (/dev/dri/card0)
[    24.170] (--) PCI:*(0:0:2:0) 8086:041a:103c:1905 rev 6, Mem @ 0xef000000/4194304, 0xd0000000/268435456, I/O @ 0x00
00f000/64
[    24.170] (II) LoadModule: "glx"
[    24.181] (II) Loading /usr/lib/xorg/modules/extensions/libglx.so
...

La solució és tan simple com actualitzar els paquets libdrm a la darrera versió disponible a jessie-backports,

root@cie-50-189:/boot# apt-cache search libdrm
libdrm-dev - Userspace interface to kernel DRM services -- development files
libdrm-intel1 - Userspace interface to intel-specific kernel DRM services -- runtime
libdrm-intel1-dbg - Userspace interface to intel-specific kernel DRM services -- debugging symbols
libdrm-nouveau2 - Userspace interface to nouveau-specific kernel DRM services -- runtime
libdrm-nouveau2-dbg - Userspace interface to nouveau-specific kernel DRM -- debugging symbols
libdrm-radeon1 - Userspace interface to radeon-specific kernel DRM services -- runtime
libdrm-radeon1-dbg - Userspace interface to radeon-specific kernel DRM services -- debugging symbols
libdrm2 - Userspace interface to kernel DRM services -- runtime
libdrm2-dbg - Userspace interface to kernel DRM services -- debugging symbols
libdrmaa1.0-java - Distributed resource management Application API library - Java bindings
libdrmaa1.0-java-doc - Distributed resource management Application API library - Java bindings docs
libdrmaa1.0-ruby - Distributed resource management Application API library - Ruby bindings
libdrm-amdgpu1 - Userspace interface to amdgpu-specific kernel DRM services -- runtime
libdrm-amdgpu1-dbg - Userspace interface to amdgpu-specific kernel DRM services -- debugging symbols
root@cie-50-189:/boot# 
root@cie-50-189:/boot# apt-get -t jessie-backports install libdrm-intel1 libdrm2
Reading package lists... Done
Building dependency tree       
Reading state information... Done
The following packages will be upgraded:
  libdrm-intel1 libdrm2
2 upgraded, 0 newly installed, 0 to remove and 112 not upgraded.
Need to get 102 kB of archives.
After this operation, 53.2 kB disk space will be freed.
Get:1 http://ftp.caliu.cat/debian/ jessie-backports/main libdrm2 amd64 2.4.70-1~bpo8+1 [35.9 kB]
Get:2 http://ftp.caliu.cat/debian/ jessie-backports/main libdrm-intel1 amd64 2.4.70-1~bpo8+1 [65.7 kB]
Fetched 102 kB in 0s (660 kB/s)         
Reading changelogs... Done
(Reading database ... 153262 files and directories currently installed.)
Preparing to unpack .../libdrm2_2.4.70-1~bpo8+1_amd64.deb ...
Unpacking libdrm2:amd64 (2.4.70-1~bpo8+1) over (2.4.58-2) ...
Preparing to unpack .../libdrm-intel1_2.4.70-1~bpo8+1_amd64.deb ...
Unpacking libdrm-intel1:amd64 (2.4.70-1~bpo8+1) over (2.4.58-2) ...
Setting up libdrm2:amd64 (2.4.70-1~bpo8+1) ...
Setting up libdrm-intel1:amd64 (2.4.70-1~bpo8+1) ...
Processing triggers for libc-bin (2.19-18+deb8u4) ...
root@cie-50-189:/boot# /etc/init.d/gdm3 restart
[ ok ] Restarting gdm3 (via systemctl): gdm3.service.

El programari de Bruker s'installa a la carpeta /opt i per evitar que estigui al volum logic root creo un volum logic per opt, pero per fer-ho haure de reduir de mida algun dels volums existents,

root@debian:/mnt/testroot/etc/lvm/backup# pvs
  PV         VG            Fmt  Attr PSize   PFree
  /dev/sda3  cie-50-189-vg lvm2 a--  930.77g    0 

root@debian:/mnt/testroot/etc/lvm/backup# vgs
  VG            #PV #LV #SN Attr   VSize   VFree
  cie-50-189-vg   1   6   0 wz--n- 930.77g    0 

root@debian:/mnt/testroot/etc/lvm/backup# lvs
  LV     VG            Attr       LSize   Pool Origin Data%  Meta%  Move Log Cpy%Sync Convert
  home   cie-50-189-vg -wi-a----- 905.51g                                                    
  root   cie-50-189-vg -wi-ao----   6.52g                                                    
  swap_1 cie-50-189-vg -wi-a-----  15.58g                                                    
  tmp    cie-50-189-vg -wi-a----- 380.00m                                                    
  var    cie-50-189-vg -wi-ao----   2.79g    

El volum logic triat es home perque es el mes gran. Arrenco l'ordinador amb una versio de Debian Live i instalo els seguents paquets per poder treballar amb els volums logics,

• lvm2 i paquets dels que depen
• system-config-lvm

Des del programa system-config-lvm selecciono el volum logic home i edito les seves propietats per reduir-lo de mida i alliberar 100 GBytes d'espai al grup de volums.

Llavors creo un nou volum logic amb el nom opt que ocupa l'espai de 100 GBytes disponible al grup de volums. Mes endavant, si cal, ja ajustare la mida d'aquest i altres volums logics.

El resultat es la creacio d'un nou volum logic opt dins el grup de volums cie-50-189-vg del volum fisic dev/sda3:

root@debian:/mnt/testroot/etc/lvm/backup# pvs
  PV         VG            Fmt  Attr PSize   PFree
  /dev/sda3  cie-50-189-vg lvm2 a--  930.77g    0 

root@debian:/mnt/testroot/etc/lvm/backup# vgs
  VG            #PV #LV #SN Attr   VSize   VFree
  cie-50-189-vg   1   6   0 wz--n- 930.77g    0 

root@debian:/mnt/testroot/etc/lvm/backup# lvs
  LV     VG            Attr       LSize   Pool Origin Data%  Meta%  Move Log Cpy%Sync Convert
  home   cie-50-189-vg -wi-a----- 805.51g                                                    
  opt    cie-50-189-vg -wi-ao---- 100.00g                                                    
  root   cie-50-189-vg -wi-ao----   6.52g                                                    
  swap_1 cie-50-189-vg -wi-a-----  15.58g                                                    
  tmp    cie-50-189-vg -wi-a----- 380.00m                                                    
  var    cie-50-189-vg -wi-ao----   2.79g    

amb les seguents especificacions,

  --- Logical volume ---
  LV Path                /dev/cie-50-189-vg/opt
  LV Name                opt
  VG Name                cie-50-189-vg
  LV UUID                zGzc38-VmXs-LtyG-m9TI-7Mhc-FV81-YikQ5H
  LV Write Access        read/write
  LV Creation host, time debian, 2016-08-29 08:42:23 +0000
  LV Status              available
  # open                 1
  LV Size                100.00 GiB
  Current LE             25601
  Segments               1
  Allocation             inherit
  Read ahead sectors     auto
  - currently set to     256
  Block device           254:5

Llavors munto provissionalment els volums logics root i opt i,

• copio el contingut de la carpeta root/opt/ a opt,
• canvio el nom de la carpeta root/opt/ a root/opt2 per conservar-la com a copia de seguretat, i
• creo una nova carpeta root/opt on es muntara el volum logic opt.

Tot seguit, edito el fitxer /etc/fstab per afegir el punt de muntatge del nou volum logic opt i fer que es munti al posar en marxa l'ordinador,

/dev/mapper/cie--50--189--vg-opt /opt    ext4    defaults    0    2

Finalment, reinicio l'ordinador per comprovar que els canvis s'apliquen i que tot funciona correctament.

La connexió a la placa base s'identifica com a eth1 i és una

Ethernet interface
/0/100/19

product: Ethernet Connection I217-LM [8086:153A]
vendor: Intel Corporation [8086]
bus info: pci@0000:00:19.0
logical name: eth1
version: 05
serial: 50:65:f3:3a:12:5e
size: 100Mbit/s
capacity: 1Gbit/s
width: 32 bits
clock: 33MHz
capabilities:
	Power Management,
	Message Signalled Interrupts,
	bus mastering,
	PCI capabilities listing,
	ethernet,
	Physical interface,
	twisted pair,
	10Mbit/s,
	10Mbit/s (full duplex),
	100Mbit/s,
	100Mbit/s (full duplex),
	1Gbit/s (full duplex),
	Auto-negotiation
configuration:
	autonegotiation: on
	broadcast: yes
	driver: e1000e
	driverversion: 2.3.2-k
	duplex: full
	firmware: 0.13-4
	latency: 0
	link: no
	multicast: yes
	port: twisted pair
	speed: 100Mbit/s
resources:
	irq: 40
	memory: efc00000-efc1ffff
	memory: efc3d000-efc3dfff
	ioport: f080(size=32)
this device has been disabled

i la targeta de xarxa addicional s'identifica com a eth0 és una

Ethernet interface
/0/100/1c.1/0

product: I210 Gigabit Network Connection [8086:1533]
vendor: Intel Corporation [8086]
bus info: pci@0000:02:00.0
logical name: eth0
version: 03
serial: a0:36:9f:8f:0a:b3
size: 1Gbit/s
capacity: 1Gbit/s
width: 32 bits
clock: 33MHz
capabilities:
	Power Management,
	Message Signalled Interrupts,
	MSI-X,
	PCI Express,
	bus mastering,
	PCI capabilities listing,
	extension ROM,
	ethernet,
	Physical interface,
	twisted pair,
	10Mbit/s,
	10Mbit/s (full duplex),
	100Mbit/s,
	100Mbit/s (full duplex),
	1Gbit/s (full duplex),
	Auto-negotiation
configuration:
	autonegotiation: on
	broadcast: yes
	driver: igb
	driverversion: 5.0.5-k
	duplex: full
	firmware: 3.16, 0x800004ff, 1.304.0
	ip: 192.168.2.14
	latency: 0
	link: yes
	multicast: yes
	port: twisted pair
	speed: 1Gbit/s
resources:
	irq: 17
	memory: efa00000-efafffff
	memory: efb00000-efb03fff
	memory: ef900000-ef9fffff

Cal comprovar el fitxer /etc/udev/rules.d/70-persistent-net.rules (veure més avall) per tal que l'assignació de les targetes al sistema operatiu sigui estàtica i no es faci cada cop que es reinicia l'ordinador, de forma que la targeta a la placa base sigui sempre eth1 i correspongui a la connexió a la consola (IPSO), i que la targeta addicional sigui sempre eth0 i es faci servir per la connexió a la xarxa local (LAN).

Actualment la configuració de la xarxa interna del SeRMN la proporciona el propi ordinador en mode estàtica i els paràmetres són,

• Hostname: cie-55-32
• Domain: sermn.net
• IP address: 192.168.2.14
• Broadcast: 192.168.2.255
• Netmask: 255.255.225.0
• DNS:
  • domain sermn.net
  • search sermn.net
  • nameserver 192.168.2.1

tal i com es pot comprovar a partir de la configuració del dispositiu eth0,

eth0      Link encap:Ethernet  HWaddr a0:36:9f:8f:0a:b3  
          inet addr:192.168.2.14  Bcast:192.168.2.255  Mask:255.255.255.0
          inet6 addr: fe80::a236:9fff:fe8f:ab3/64 Scope:Link
          UP BROADCAST RUNNING MULTICAST  MTU:1500  Metric:1
          RX packets:347295 errors:0 dropped:0 overruns:0 frame:0
          TX packets:242868 errors:0 dropped:0 overruns:0 carrier:0
          collisions:0 txqueuelen:1000 
          RX bytes:356548362 (340.0 MiB)  TX bytes:29710200 (28.3 MiB)
          Memory:efa00000-efafffff 

i dels servidors de noms,

root@cie-55-32:/etc# more resolv.conf
# Generated by NetworkManager
nameserver 192.168.2.1
root@cie-55-32:/etc# 

El dispositiu eth1 també es reconeix,

eth1      Link encap:Ethernet  HWaddr 50:65:f3:3a:12:5e  
          BROADCAST MULTICAST  MTU:1500  Metric:1
          RX packets:0 errors:0 dropped:0 overruns:0 frame:0
          TX packets:432 errors:0 dropped:0 overruns:0 carrier:0
          collisions:0 txqueuelen:1000 
          RX bytes:0 (0.0 B)  TX bytes:36715 (35.8 KiB)
          Interrupt:20 Memory:efc00000-efc20000 

però no té una configuració assignada. Caldrà configurar-ho de forma estàtica amb els paràmetres de connexió emprats actualment per la connexió de l'estació de treball a la consola.

Com que la configuració de la xarxa és estàtica, per evitar problemes elimino els paquets,

• isc-dhcp-client (que alhora desinstal·la network-manager i network-manager-gnome), i
• isc-dhpc-common,

i instal·lo

• ifupdown-extra, que alhora arrossega els paquets
  • curl, i
  • ethtools
• wireshark

Per evitar que en algun moment es pugui bescanviar la configuració de les targetes de xarxa poso en pràctica les opcions esmentades a How to reorder or rename logical interface names in Linux.

Una consulta al fitxer /etc/udev/rules.d/70-persistent-net.rules indica que l'assignació del nom de dispositiu, eth0 o eth1 feta pel programa udev és fixe, i que no hi ha perill de que canviï en reiniciar l'ordinador,

root@cie-55-32:/etc/udev/rules.d# more 70-persistent-net.rules 
# This file was automatically generated by the /lib/udev/write_net_rules
# program, run by the persistent-net-generator.rules rules file.
#
# You can modify it, as long as you keep each rule on a single
# line, and change only the value of the NAME= key.

# PCI device 0x8086:0x1533 (igb)
SUBSYSTEM=="net", ACTION=="add", DRIVERS=="?*", ATTR{address}=="a0:36:9f:8f:0a:b3", ATTR{dev_id}=="0x0", 
ATTR{type}=="1", KERNEL=="eth*", NAME="eth0"

# PCI device 0x8086:0x153a (e1000e)
SUBSYSTEM=="net", ACTION=="add", DRIVERS=="?*", ATTR{address}=="50:65:f3:3a:12:5e", ATTR{dev_id}=="0x0", 
ATTR{type}=="1", KERNEL=="eth*", NAME="eth1"

Així doncs, podem fer servir eth0 i eth1 al fitxer de configuració etc/network/interfaces sense preocupacions.

• Network Configuration a la wiki de Debian.
• NetworkManager a la wiki de Debian.
• Chapter 5. Network setup, a Debian Reference, by Osamu Aoki.
• Disable NetworkManager
• How to disable Network Manager on Linux
• RHEL 7 - Networking Guide - 2.3. Using the NetworkManager Command Line Tool, nmcli
• How do I prevent Network Manager from controlling an interface?
• What Is the Job of Network Manager on a Server?
• NetworkManager for Administrators Part 1
• NetworkManager on Server-Type Machines (or, why our initscripts suck)

Aquesta és la configuració de xarxa provisional emprada per la instal·lació i configuració del sistema operatiu i del programa TopSpin.

/etc/hosts

127.0.0.1	localhost
192.168.2.14	cie-55-32.sermn.net	cie-55-32

/etc/resolv.conf

# Generated by NetworkManager
nameserver 192.168.2.1

/etc/network/interfaces

# This file describes the network interfaces available on your system
# and how to activate them. For more information, see interfaces(5).

source /etc/network/interfaces.d/*

# The loopback network interface
auto lo
iface lo inet loopback

# Ethernet interfaces are assigned to physical devices in a
# persistent way according to rules in file:
#
#   /etc/udev/rules.d/70-persistent-net.rules
#
# Hence, each of eth0 and eth1 will **always** correspond to
# the same device. The configuration below assumes that,
#
#   eth0 -> lan (internet)
#   eth1 -> nmr (spectrometer ccu or ipso)
#
auto eth0 eth1

# LAN / INTERNET - Assigned to the primary network interface,
# which usually will be the motherboard integrated NIC.
#
iface eth0 inet static
    address 192.168.2.14
    netmask 255.255.255.0
    broadcast 192.168.2.255
    gateway 192.168.2.1

# NMR CONSOLE LAN - Assigned to the secondary network interface,
# which usually will be the added NIC.
#
iface eth1 inet static
    address 149.236.99.1
    netmask 255.255.255.0
    network 149.236.99.0
    broadcast 10.10.255.255

/etc/udev/rules.d/70-persistent-net.rules

# This file was automatically generated by the /lib/udev/write_net_rules
# program, run by the persistent-net-generator.rules rules file.
#
# You can modify it, as long as you keep each rule on a single
# line, and change only the value of the NAME= key.

# PCI device 0x8086:0x1533 (igb)
SUBSYSTEM=="net", ACTION=="add", DRIVERS=="?*", ATTR{address}=="a0:36:9f:8f:0a:b3", ATTR{dev_id}=="0x0", 
ATTR{type}=="1", KERNEL=="eth*", NAME="eth0"

# PCI device 0x8086:0x153a (e1000e)
SUBSYSTEM=="net", ACTION=="add", DRIVERS=="?*", ATTR{address}=="50:65:f3:3a:12:5e", ATTR{dev_id}=="0x0", 
ATTR{type}=="1", KERNEL=="eth*", NAME="eth1"
root@cie-55-32:/etc/udev/rules.d# 

S'ha de configurar (fitxer /etc/avahi/avahi-daemon.conf) per tal de restringir la difusió dels serveis disponibles a l'ordinador i, potser, la cerca de serveis a la xarxa.

Enllaços sobre la configuració del tftpd

• http://chschneider.eu/linux/server/tftpd-hpa.shtml
• http://diablo.craem.net/wordpress/?p=171
• …

Cal configurar-lo per servir el sistema operatiu de la consola.

Cal configurar-lo per servir el sistema operatiu de la consola.

Instal·lo el paquet ntp i al final del fitxer /etc/ntp.conf afegeixo els següents servidors de temps,

• server swisstime.ethz.ch
• server ntp.uab.es
• server ntp.univ-lyon1.fr

Instal·lo el paquet isc-dhcpd-server que alhora reinstal·la el paquet isc-dhcp-common.

Instal·lo el paquet cu

Executo la comanda dpkg –add-architecture i386 per afegir els paquets de 32-bits que es necessiten per executar alguns programes de Topspin de 32-bits (per exemple, el servei bfsd).

Instal·lo els següents paquets:

• libc6-i386
• …

• Tranferència del ParaVision 4.0, 5.0 i 5.1
• Tranferència de la documentació del ParaVision i BioSpec
• Tranferència del diskless i FlexLM
• Instal·lació del ParaVision 5.0 Patchlevel xx

• Tranferència de les carpetes `home'