User Tools

Site Tools


informatica:hp_z240mt_biospec

This is an old revision of the document!


Estació de treball HP Z240T pel BioSpec 70/30USR

Aquesta estació de treball es va comprar al juliol de 2016 per substituir l'estació de treball HP xw4300 de l'espectròmetre Bruker BioSpec 70/30USR.

Es va instal·lar la versió 8.x de GNU/Linux Debian, i la versio 5.x del ParaVision.

Hardware specifications

FIXME Especificacions del maquinari amb data de 2016-xx-xx:

root@partedmagic:~# lshw
partedmagic               
    description: Mini Tower Computer
    product: ...
             

CPU Specifications (cpuinfo)

FIXME Especificacions del processador amb data de 2016-xx-xx:

root@partedmagic:~# cat /proc/cpuinfo 
processor	: 0
vendor_id	: GenuineIntel
...

Descripció tècnica

Dades per l'inventari

Descripció Estació de treball HP Z240T
Marca Hewlett Packard
Model HP Workstation Z240T
Núm. sèrie CZC6288P4Q
Núm. referència J9C05EA#ABE
Potència 250 W
Emplaçament c2/-135
Núm. inventari FIXME 020680xxx

Estació de treball pel BioSpec 70/30USR

PC HP Z240T - BioSpec 70/30USR
Data de compra 2016-07-20
DHCP UAB
Data d'alta 2016-08-29
Adreça MAC DC4A3E6F8DFB
Hostname cie-50-205
Adreça IP 158.109.50.205
DADES TÈCNIQUES
Descripció Estació de treball
Marca Hewlett Packard
Model HP Workstation Z240T
Núm. sèrie CZC6288P4Q
Núm. referència J9C05EA#ABE
Potència 250 W
Emplaçament FIXME c2/-135 (sala del Biospec 70/30USR)
HP Care Pack FIXME

Monitor ViewSonic VA2445-LED

Dades per l'inventari

Descripció Monitor ViewSonic VA2445-LED - MRI/MRS Off-Station
Marca ViewSonic
Model VA2445-LED
Núm. sèrie TSQ160140062
Núm. referència VS15453
Potència 22 W
Emplaçament FIXME c2/-135 (sala del BioSpec 70/30USR)
Núm. inventari 020680254

Dades tècniques

Monitor ViewSonic VA2445-LED - MRI/MRS Off-Station
Data de compra 2016-07-22 (4.500.308.789)
DADES TÈCNIQUES
Descripció Monitor LCD TFT TN WLED Backlit
Marca ViewSonic
Model VA2445-LED
Núm. sèrie TSQ160140062
Núm. referència VS15453
Potència 22 W
Emplaçament FIXME c2/-135 (sala del BioSpec 70/30USR)

Targeta de xarxa addicional

Per la connexió amb la consola via Ethernet compro a Misco una targeta Intel Ethernet I210-T1 Gigabit NIC comercialitzada per Hewlett Packard, HP Tarjeta Intel Ethernet L210-T1 GBE NIC ^ DADES TÈCNIQUES ^^ ^ Descripció | Intel Ethernet I210-T1 Gigabit NIC | ^ Marca | Intel (venuda per Hewlett Packard) | ^ Model | Intel Ethernet I210-T1 Gigabit NIC | ^ Núm. referència | Intel I210T1 (HP E0X95AA) | i la instal·lo en un port PCIe 3.0 x4. ==== Targeta port sèrie rs-232 ==== Per la connexió amb la consola via port sèrie, compro a Misco una targeta StarTech.com 2 Port Native PCI Express RS232 Serial Adapter Card with 16950 UART ^ DADES TÈCNIQUES ^^ ^ Descripció | 2 Port Native PCI Express RS232 Serial Adapter Card with 16950 UART | ^ Marca | StarTech | ^ Model | 2 Port Native PCI Express RS232 Serial Adapter Card with 16950 UART | ^ Núm. referència | PEX2S592 | i la instal·lo en un port PCIe 3.0 x1. ===== Preparació del disc per la instal·lació de Debian GNU/Linux ===== Aquest cop no cal fer cap operació especial amb el disc dur abans d'instal·lar el Debian GNU/Linux. ==== Particions Windows originals ==== El disc dur ve amb Windows 7 / Windows 10 pre-instal·lats. Com que no els volem per res, decideixo sobreescriure el contingut i les particions de Windows, i aprofitar tot el disc per la instal·lació de GNU/Linux. ===== Particions per Debian GNU/Linux ===== En comptes de crear les particions abans d'instal·lar el Debian GNU/Linux, faré servir el programa d'instal·lació per repartir el disc fent ús del gestor de volums lògics LVM2, però miraré de seguir l'esquema de partició emprat a altres estacions de treball d'espectròmetres: * Partició primària / (root) de 20 GiB. Inclou /usr i /tmp * Partició lògica /var de 10 GiB. * Partició swap de 12 GiB. * Partició lògica /opt de 40 GiB. Pel ParaVision i altre programari Bruker. * Partició lògica /home de 350 GiB. tot i que caldrà adaptar-ho al major volum de les dades adquirides amb el BioSpec, i a l'ús del gestor de volums lògics LVM2 en comptes de particions tradicionals. ===== Instal·lació de Debian GNU/Linux ===== Instal·lo la distribució de GNU/Linux instal·lada és la Debian version 8.5, released on June 4th, 2016, codenamed jessie, AMD64 architecture. a partir d'un pendrive. El programa d'instal·lació detecta que es tracta d'un ordinador compatible amb UEFI i tria aquesta versió del programa debian-installer. ==== Configuració inicial ==== * Language: English * Country: Spain * Locale: en_US.UTF-8 * Keymap: Spanish * Host name: cie-50-189 (configuració manual provisional) * Domain name: uab.cat (configuració manual provisional) * User name: * sermnuab (SeRMN-UAB Users) * sermnadmin (SeRMN-UAB Staff) * Time zone: Madrid ==== Partició del disc ==== Faig servir l'opció “Whole disk using LVM” que crea les següents particions al disc: FIXME esquema de particions: boot + ESP (UEFI) + LVM amb la configuració del LVM: FIXME <file> Physical volume: /dev/sda3 Volume groups: cie-50-189-vg Logical volumes: home, root, swap_1, tmp, var </file>

Un cop finalitzada la instal·lació, caldrà

  • ajustar la mida dels volums lògics; i
  • crear un volum lògic addicional /opt

==== Instal·lació i configuració inicial ==== === Instal·lació bàsica de programes === Les col·leccions de programes a instal·lar seleccionades són: * Desktop Environment * Standard System La resta de programes que poguessin ser necessaris, s'instal·laran més endavant. == GRUB Boot Loader == GRUB Boot Loader s'instal·la a /dev/sda == Reiniciar per primer cop == Un cop s'han instal·lat tots els paquets, reinicio l'ordinador i entro a la sessió de GNU/Debian Squeeze. ==== Problemes amb UEFI ==== Quan reinicio l'ordinador, surt un missatge que indica que no troba cap sistema operatiu al disc. Segueixo les indicacions a les pàgines següents per comprovar què passa: * https://wiki.debian.org/UEFI * https://wiki.debian.org/GrubEFIReinstall i la solució final és to force grub-efi installation to the removable media path o to hijack the uefi fallback boot loader. Per més informació sobre UEFI i els problemes associats a una implementació incorrecte consultar: * UEFI - Debian Wiki * UEFI - Ubuntu Official Documentation * Booting with EFI * Documentation for the rEFInd boot manager ==== Addició d'altres magatzems (repositories) de programes ==== Afegeixo altres magatzems (repositories) de programes a etc/apt/sources.list.d/: * :ok: 0-stable.list (Debian Stable repository) * :ok: 1-security.list (Debian Security repository) * :ok: 2-mozilla.list (Debian Mozilla repository). Proporciona el navegador Firefox. * :ok: 3-google-chrom.list (Google Chrome for Debian repository). Proporciona el navegador Chrome de Google. * :ok: 5-deb-multimedia.list (Debian Multimedia repository). Proporciona el programa Acrobar Reader. Abans de poder treballar amb el magatzem de Debian Mozilla instal·lo primer el paquet pkg-mozilla-archive-keyring del magatzem de Debian Stable. Per poder treballar amb el magatzem de Debian Multimedia, el primer paquet a descarregar i install·lo és el deb-multimedia-keyring. Per poder treballar amb el magatzem de Google Chrome per Debian, primer cal descarregar-se i instal·lar la seva clau de signatura amb la comanda wget -q -O - https://dl.google.com/linux/linux_signing_key.pub | sudo apt-key add -. A les següents pàgines es poden consultar altres magatzems disponibes: * Debian Wiki - Unofficial Repositories * My Debian source.list. Craigevil's Giant Debian /etc/apt/sources.list Updated October 24, 2012. Si aquesta data és correcta, llavors aquesta llista no està actualitzada i cal prendre-se-la amb precaució. ==== Altres paquets i programes de Debian ==== Afegeixo els següents paquets o programes (aquest no és un llistat exhaustiu, només inclou els dimonis i servidors de xarxa, i altres programes importants): * :ok: ssh (openssh-server, openssh-client) * :ok: mc (midnight commander) * :ok: htop, iotop, sysstat * :ok: glances, atop, nmon * :ok: iftop, nethogs, iptraf-ng * :ok: strace, ltrace, latrace * :fail: sysdig (Per ara no l'instal·lo perquè requereix la instal·lació d'un munt de paquets addicionals. M'hauré de pensar si compensa). * :ok: rsync * :ok: ftp-ssl en comptes de ftp * :fail: fail2ban (substitueix a denyhosts pels motius exposats a Debian Bug report logs - #732712. Per configurar fail2ban consultar els enllaços Replacing denyhosts with fail2ban for Debian i Migrate from DenyHosts to Fail2ban. * :fail: nfs-kernel-server * :fail: tftp-hpa * :fail: tftpd-hpa Cal reconfigurar! * :fail: bootparamd Cal reconfigurar! * :fail: xinetd (en comptes del programa per defecte: openbsd-inetd) * :ok: lshw i lshw-gtk Elimino els paquets o programes: * :ok: telnet * … Elimino els següents metapackages per poder eliminar altres paquets o programes que depenen d'ells sense haver de desinstal·lar altres paquets que sí que m'interessen, * :fail: gnome * :fail: gnome-desktop-environment * :fail: gnome-office Llavors desinstal·lo: * :fail: gnome-games, gnome-games-data, gnome-games-extra-data * :fail: simple-scan, xsane, xsane-common, i les biblioteques relacionades * … Substitueixo: * :fail: la versió lliure de Java (java-6-openjdk i paquets que en dependen) per la versió oficial (sun-java6-jdk i paquets que en depenen). ==== Configuració de la targeta gràfica ==== La pantalla es configura automàticament amb una resolució de 1024×768 en comptes de la resolució òptima del monitor: 1920×1080. Alhora, al menú Display no surt la marca i model del monitor, com si no el reconegués correctament, però comprovo que el sistema operatiu sí que detecta correctament el monitor, <file> root@cie-50-189:~# hwinfo –monitor 20: None 00.0: 10002 LCD Monitor [Created at monitor.95] Unique ID: rdCR.2arDg51H8e3 Hardware Class: monitor Model: “VIEWSONIC VA2445 SERIES” Vendor: VSC “VIEWSONIC” Device: eisa 0x712e “VA2445 SERIES” Serial ID: “TSQ160140056” Resolution: 720×400@70Hz Resolution: 640×480@60Hz … Resolution: 1600×900@60Hz Resolution: 1920×1080@60Hz Size: 521×293 mm Detailed Timings #0: Resolution: 1920×1080 Horizontal: 1920 2008 2052 2200 (+88 +132 +280) +hsync Vertical: 1080 1084 1089 1125 (+4 +9 +45) +vsync Frequencies: 148.50 MHz, 67.50 kHz, 60.00 Hz Driver Info #0: Max. Resolution: 1920×1080 Vert. Sync Range: 50-75 Hz Hor. Sync Range: 24-82 kHz Bandwidth: 148 MHz Config Status: cfg=new, avail=yes, need=no, active=unknown </file> i també la targeta gràfica que hi ha a la placa base, <file> root@cie-50-189:~# hwinfo –framebuffer 02: None 00.0: 11001 VESA Framebuffer [Created at bios.459] Unique ID: rdCR.QstqgPARaQB Hardware Class: framebuffer Model: “” Vendor: “” Device: “” SubVendor: “Intel(R) SKL Mobile/Desktop Graphics Chipset Accelerated VGA BIOS” SubDevice: Revision: “” Memory Size: 127 MB + 960 kB Memory Range: 0xc0000000-0xc7feffff (rw) Mode 0x0307: 1280×1024 (+1280), 8 bits … Mode 0x037d: 1920×1080 (+1920), 8 bits Mode 0x037e: 1920×1080 (+3840), 16 bits Mode 0x037f: 1920×1080 (+7680), 24 bits Config Status: cfg=new, avail=yes, need=no, active=unknown </file> Així doncs, tot apunta a que hi ha un problema amb el controlador de la targeta gràfica. === lsmod - Z240 vs Z230 ===

Z240

root@cie-50-189:~# lsmod | grep intel
kvm_intel             139116  0 
kvm                   388784  1 kvm_intel
aesni_intel           151423  0 
aes_x86_64             16719  1 aesni_intel
lrw                    12757  1 aesni_intel
glue_helper            12695  1 aesni_intel
ablk_helper            12572  1 aesni_intel
cryptd                 14516  2 aesni_intel,ablk_helper
snd_hda_intel          26407  6 
snd_hda_controller     26646  1 snd_hda_intel
snd_hda_codec         104500  5 snd_hda_codec_realtek,snd_hda_codec_hdmi,snd_hda_codec_generic,snd_hda_intel,snd_hda_controller
snd_pcm                88662  4 snd_hda_codec_hdmi,snd_hda_codec,snd_hda_intel,snd_hda_controller
snd                    65244  20 snd_hda_codec_realtek,snd_hwdep,snd_timer,snd_hda_codec_hdmi,snd_pcm,snd_hda_codec_generic,snd_hda_codec,snd_hda_intel
crc32c_intel           21809  0 

Z230

root@cie-55-32:/home/sermnadmin# lsmod | grep intel
intel_rapl             20480  0 
iosf_mbi               16384  1 intel_rapl
intel_powerclamp       16384  0 
aesni_intel           167936  0 
snd_hda_intel          36864  5 
snd_hda_codec         131072  4 snd_hda_codec_realtek,snd_hda_codec_hdmi,snd_hda_codec_generic,snd_hda_intel
snd_hda_core           69632  5 snd_hda_codec_realtek,snd_hda_codec_hdmi,snd_hda_codec_generic,snd_hda_codec,snd_hda_intel
aes_x86_64             20480  1 aesni_intel
lrw                    16384  1 aesni_intel
snd_pcm               102400  4 snd_hda_codec_hdmi,snd_hda_codec,snd_hda_intel,snd_hda_core
glue_helper            16384  1 aesni_intel
ablk_helper            16384  1 aesni_intel
cryptd                 20480  2 aesni_intel,ablk_helper
snd                    86016  18 snd_hda_codec_realtek,snd_hwdep,snd_timer,snd_hda_codec_hdmi,snd_pcm,snd_hda_codec_generic,snd_hda_codec,snd_hda_intel
crc32c_intel           24576  0 

=== hwinfo –cpu - Z240 vs Z230 ===

Z240

root@cie-50-189:~# hwinfo --cpu
01: None 00.0: 10103 CPU
  [Created at cpu.455]
  Unique ID: rdCR.j8NaKXDZtZ6
  Hardware Class: cpu
  Arch: X86-64
  Vendor: "GenuineIntel"
  Model: 6.94.3 "Intel(R) Xeon(R) CPU E3-1245 v5 @ 3.50GHz"
  Features: fpu,vme,de,pse,tsc,msr,pae,mce,
  cx8,apic,sep,mtrr,pge,mca,cmov,
  pat,pse36,clflush,dts,acpi,mmx,
  fxsr,sse,sse2,ss,ht,tm,pbe,
  syscall,nx,pdpe1gb,rdtscp,lm,
  constant_tsc,arch_perfmon,pebs,
  bts,rep_good,nopl,xtopology,
  nonstop_tsc,aperfmperf,eagerfpu,
  pni,pclmulqdq,dtes64,monitor,
  ds_cpl,vmx,smx,est,tm2,ssse3,
  fma,cx16,xtpr,pdcm,pcid,sse4_1,
  sse4_2,x2apic,movbe,popcnt,
  tsc_deadline_timer,aes,xsave,
  avx,f16c,rdrand,lahf_lm,abm,
  3dnowprefetch,ida,arat,epb,
  xsaveopt,pln,pts,dtherm,
  tpr_shadow,vnmi,flexpriority,
  ept,vpid,fsgsbase,tsc_adjust,
  bmi1,hle,avx2,smep,bmi2,erms,
  invpcid,rtm,mpx,rdseed,adx,smap,
  clflushopt
  Clock: 800 MHz
  BogoMips: 7004.91
  Cache: 8192 kb
  Units/Processor: 16
  Config Status: cfg=new, avail=yes, need=no, active=unknown

Z230

root@cie-55-32:/home/sermnadmin# hwinfo --cpu
01: None 00.0: 10103 CPU                                        
  [Created at cpu.455]
  Unique ID: rdCR.j8NaKXDZtZ6
  Hardware Class: cpu
  Arch: X86-64
  Vendor: "GenuineIntel"
  Model: 6.60.3 "Intel(R) Xeon(R) CPU E3-1246 v3 @ 3.50GHz"
  Features: fpu,vme,de,pse,tsc,msr,pae,mce,
  cx8,apic,sep,mtrr,pge,mca,cmov,
  pat,pse36,clflush,dts,acpi,mmx,
  fxsr,sse,sse2,ss,ht,tm,pbe,
  syscall,nx,pdpe1gb,rdtscp,lm,
  constant_tsc,arch_perfmon,pebs,
  bts,rep_good,nopl,xtopology,
  nonstop_tsc,aperfmperf,eagerfpu,
  pni,pclmulqdq,dtes64,monitor,
  ds_cpl,vmx,smx,est,tm2,ssse3,
  sdbg,fma,cx16,xtpr,pdcm,pcid,sse4_1,
  sse4_2,x2apic,movbe,popcnt,
  tsc_deadline_timer,aes,xsave,
  avx,f16c,rdrand,lahf_lm,abm,
  ida,arat,epb,pln,pts,dtherm,
  tpr_shadow,vnmi,flexpriority,
  ept,vpid,fsgsbase,tsc_adjust,
  bmi1,avx2,smep,bmi2,erms,
  invpcid,xsaveopt
  Clock: 3491 MHz
  BogoMips: 6983.65
  Cache: 8192 kb
  Units/Processor: 16
  Config Status: cfg=new, avail=yes, need=no, active=unknown

=== Intel Linux Drivers === Algun d'aquests enllaços podria ser útil: * Graphics Drivers for Linux - Support Home Intel® Graphics Drivers¡ * Intel Graphics for Linux * Intel Graphics Installer for Linux* 1.4.0 - Intel Graphics for Linux * Early Intel Skylake Linux Users May Run Into A Silly Issue * Intel Skylake HD Graphics 530 Performance On Linux * Can't get Intel HD Graphics 530 (Skylake i7 6700) to work * Missing firmware in Debian? Learn how to deal with the problem === Diagnòstic final === Al final, després de consultar un munt de pàgines i fòrums a Internet, i després de comprovar els registres del sistema (entre altres: Xorg.0.log, dmesg, lspci) i comparlar-los amb els de l'estació de treball HP Z230, aconsegueixo acotar el problema al DRM/DRI del gestor de gràfics. Així doncs, al fitxer Xorg.0.log de l'estació de treball HP Z240 veig que manca la línia (II) xfree86: Adding drm device (/dev/dri/card0) que sí que surt al fitxer de registre Xorg.0.log de l'estació de treball HP Z230, i que això es tradueix en un seguit d'errors a l'hora d'instal·lar diferents mòduls del gestor de gràfics X11.

Z240

root@cie-50-189:/var/log# more Xorg.0.log 
[     9.613] 
X.Org X Server 1.16.4
Release Date: 2014-12-20
[     9.613] X Protocol Version 11, Revision 0
[     9.613] Build Operating System: Linux 3.16.0-4-amd64 x86_64 Debian
[     9.613] Current Operating System: Linux cie-50-189 3.16.0-4-amd64 #1 SMP Debian 3.16.7-ckt25-2+deb8u3 (2016-07-02
) x86_64
[     9.613] Kernel command line: BOOT_IMAGE=/vmlinuz-3.16.0-4-amd64 root=/dev/mapper/cie--50--189--vg-root ro
[     9.613] Build Date: 11 February 2015  12:32:02AM
[     9.613] xorg-server 2:1.16.4-1 (http://www.debian.org/support) 
...
[     9.685] (==) ModulePath set to "/usr/lib/xorg/modules"
[     9.685] (II) The server relies on udev to provide the list of input devices.
	If no devices become available, reconfigure udev or disable AutoAddDevices.
[     9.685] (II) Loader magic: 0x7f8383d1ed80
[     9.685] (II) Module ABI versions:
[     9.685] 	X.Org ANSI C Emulation: 0.4
[     9.685] 	X.Org Video Driver: 18.0
[     9.685] 	X.Org XInput driver : 21.0
[     9.685] 	X.Org Server Extension : 8.0
[     9.687] (--) PCI:*(0:0:2:0) 8086:191d:103c:802f rev 6, Mem @ 0xd0000000/16777216, 0xc0000000/268435456, I/O @ 0x0
0003000/64
[     9.687] (II) LoadModule: "glx"
[     9.688] (II) Loading /usr/lib/xorg/modules/extensions/libglx.so
...
[     9.758] (EE) open /dev/dri/card0: No such file or directory
[     9.758] (WW) Falling back to old probe method for modesetting
[     9.758] (EE) open /dev/dri/card0: No such file or directory
...

Z230

root@cie-55-32:/var/log# more Xorg.0.log
[    24.069] 
X.Org X Server 1.16.4
Release Date: 2014-12-20
[    24.069] X Protocol Version 11, Revision 0
[    24.069] Build Operating System: Linux 3.16.0-4-amd64 x86_64 Debian
[    24.069] Current Operating System: Linux cie-55-32 4.4.0-0.bpo.1-amd64 #1 SMP Debian 4.4.6-1~bpo8+1 (2016-03-20) x
86_64
[    24.069] Kernel command line: BOOT_IMAGE=/boot/vmlinuz-4.4.0-0.bpo.1-amd64 root=UUID=71ea6b15-3a41-424f-8ade-86b90
d79aece ro
[    24.069] Build Date: 11 February 2015  12:32:02AM
[    24.069] xorg-server 2:1.16.4-1 (http://www.debian.org/support) 
...
[    24.168] (==) ModulePath set to "/usr/lib/xorg/modules"
[    24.168] (II) The server relies on udev to provide the list of input devices.
	If no devices become available, reconfigure udev or disable AutoAddDevices.
[    24.168] (II) Loader magic: 0x5572dcb65d80
[    24.169] (II) Module ABI versions:
[    24.169] 	X.Org ANSI C Emulation: 0.4
[    24.169] 	X.Org Video Driver: 18.0
[    24.169] 	X.Org XInput driver : 21.0
[    24.169] 	X.Org Server Extension : 8.0
[    24.169] (II) xfree86: Adding drm device (/dev/dri/card0)
[    24.170] (--) PCI:*(0:0:2:0) 8086:041a:103c:1905 rev 6, Mem @ 0xef000000/4194304, 0xd0000000/268435456, I/O @ 0x00
00f000/64
[    24.170] (II) LoadModule: "glx"
[    24.181] (II) Loading /usr/lib/xorg/modules/extensions/libglx.so
...

=== Solució === La solució és tan simple com actualitzar els paquets libdrm a la darrera versió disponible a jessie-backports, <file> root@cie-50-189:/boot# apt-cache search libdrm libdrm-dev - Userspace interface to kernel DRM services – development files libdrm-intel1 - Userspace interface to intel-specific kernel DRM services – runtime libdrm-intel1-dbg - Userspace interface to intel-specific kernel DRM services – debugging symbols libdrm-nouveau2 - Userspace interface to nouveau-specific kernel DRM services – runtime libdrm-nouveau2-dbg - Userspace interface to nouveau-specific kernel DRM – debugging symbols libdrm-radeon1 - Userspace interface to radeon-specific kernel DRM services – runtime libdrm-radeon1-dbg - Userspace interface to radeon-specific kernel DRM services – debugging symbols libdrm2 - Userspace interface to kernel DRM services – runtime libdrm2-dbg - Userspace interface to kernel DRM services – debugging symbols libdrmaa1.0-java - Distributed resource management Application API library - Java bindings libdrmaa1.0-java-doc - Distributed resource management Application API library - Java bindings docs libdrmaa1.0-ruby - Distributed resource management Application API library - Ruby bindings libdrm-amdgpu1 - Userspace interface to amdgpu-specific kernel DRM services – runtime libdrm-amdgpu1-dbg - Userspace interface to amdgpu-specific kernel DRM services – debugging symbols root@cie-50-189:/boot# root@cie-50-189:/boot# apt-get -t jessie-backports install libdrm-intel1 libdrm2 Reading package lists… Done Building dependency tree Reading state information… Done The following packages will be upgraded: libdrm-intel1 libdrm2 2 upgraded, 0 newly installed, 0 to remove and 112 not upgraded. Need to get 102 kB of archives. After this operation, 53.2 kB disk space will be freed. Get:1 http://ftp.caliu.cat/debian/ jessie-backports/main libdrm2 amd64 2.4.70-1~bpo8+1 [35.9 kB] Get:2 http://ftp.caliu.cat/debian/ jessie-backports/main libdrm-intel1 amd64 2.4.70-1~bpo8+1 [65.7 kB] Fetched 102 kB in 0s (660 kB/s) Reading changelogs… Done (Reading database … 153262 files and directories currently installed.) Preparing to unpack …/libdrm2_2.4.70-1~bpo8+1_amd64.deb … Unpacking libdrm2:amd64 (2.4.70-1~bpo8+1) over (2.4.58-2) … Preparing to unpack …/libdrm-intel1_2.4.70-1~bpo8+1_amd64.deb … Unpacking libdrm-intel1:amd64 (2.4.70-1~bpo8+1) over (2.4.58-2) … Setting up libdrm2:amd64 (2.4.70-1~bpo8+1) … Setting up libdrm-intel1:amd64 (2.4.70-1~bpo8+1) … Processing triggers for libc-bin (2.19-18+deb8u4) … root@cie-50-189:/boot# /etc/init.d/gdm3 restart [ ok ] Restarting gdm3 (via systemctl): gdm3.service. </file>

Potser seria recomanable actualitzar altres paquets relacionats amb el gestor gràfic per processadors Intel, com ara:

  • xserver-xorg-video-intel [1]

[1] La recomanació és desinstal·lar-ho del tot i emprar el modeset driver, però aquesta opció requereix una versió de Xorg més nova que la disponible a jessie o jessie-backports. Per més detalls consultar [stretch/sid] Get rid of xserver-xorg-video-intel!, Intel SNA vs. Modesetting GLAMOR - DDX Benchmarks, i Intel Graphics Gen4 and Newer Now Defaults to Modesetting Driver on X

==== Modificacio dels volums logics ==== El programari de Bruker s'installa a la carpeta /opt i per evitar que estigui al volum logic root creo un volum logic per opt, pero per fer-ho haure de reduir de mida algun dels volums existents, <file> root@debian:/mnt/testroot/etc/lvm/backup# pvs PV VG Fmt Attr PSize PFree /dev/sda3 cie-50-189-vg lvm2 a– 930.77g 0 root@debian:/mnt/testroot/etc/lvm/backup# vgs VG #PV #LV #SN Attr VSize VFree cie-50-189-vg 1 6 0 wz–n- 930.77g 0 root@debian:/mnt/testroot/etc/lvm/backup# lvs LV VG Attr LSize Pool Origin Data% Meta% Move Log Cpy%Sync Convert home cie-50-189-vg -wi-a—– 905.51g root cie-50-189-vg -wi-ao—- 6.52g swap_1 cie-50-189-vg -wi-a—– 15.58g tmp cie-50-189-vg -wi-a—– 380.00m var cie-50-189-vg -wi-ao—- 2.79g </file> El volum logic triat es home perque es el mes gran. Arrenco l'ordinador amb una versio de Debian Live i instalo els seguents paquets per poder treballar amb els volums logics, * lvm2 i paquets dels que depen * system-config-lvm Des del programa system-config-lvm selecciono el volum logic home i edito les seves propietats per reduir-lo de mida i alliberar 100 GBytes d'espai al grup de volums. Llavors creo un nou volum logic amb el nom opt que ocupa l'espai de 100 GBytes disponible al grup de volums. Mes endavant, si cal, ja ajustare la mida d'aquest i altres volums logics. El resultat es la creacio d'un nou volum logic opt dins el grup de volums cie-50-189-vg del volum fisic dev/sda3: <file> root@debian:/mnt/testroot/etc/lvm/backup# pvs PV VG Fmt Attr PSize PFree /dev/sda3 cie-50-189-vg lvm2 a– 930.77g 0 root@debian:/mnt/testroot/etc/lvm/backup# vgs VG #PV #LV #SN Attr VSize VFree cie-50-189-vg 1 6 0 wz–n- 930.77g 0 root@debian:/mnt/testroot/etc/lvm/backup# lvs LV VG Attr LSize Pool Origin Data% Meta% Move Log Cpy%Sync Convert home cie-50-189-vg -wi-a—– 805.51g opt cie-50-189-vg -wi-ao—- 100.00g root cie-50-189-vg -wi-ao—- 6.52g swap_1 cie-50-189-vg -wi-a—– 15.58g tmp cie-50-189-vg -wi-a—– 380.00m var cie-50-189-vg -wi-ao—- 2.79g </file> amb les seguents especificacions, <file> — Logical volume — LV Path /dev/cie-50-189-vg/opt LV Name opt VG Name cie-50-189-vg LV UUID zGzc38-VmXs-LtyG-m9TI-7Mhc-FV81-YikQ5H LV Write Access read/write LV Creation host, time debian, 2016-08-29 08:42:23 +0000 LV Status available # open 1 LV Size 100.00 GiB Current LE 25601 Segments 1 Allocation inherit Read ahead sectors auto - currently set to 256 Block device 254:5 </file> Llavors munto provissionalment els volums logics root i opt i, * copio el contingut de la carpeta root/opt/ a opt, * canvio el nom de la carpeta root/opt/ a root/opt2 per conservar-la com a copia de seguretat, i * creo una nova carpeta root/opt on es muntara el volum logic opt. Tot seguit, edito el fitxer /etc/fstab per afegir el punt de muntatge del nou volum logic opt i fer que es munti al posar en marxa l'ordinador, <file> /dev/mapper/cie–50–189–vg-opt /opt ext4 defaults 0 2 </file> Finalment, reinicio l'ordinador per comprovar que els canvis s'apliquen i que tot funciona correctament. ==== Configuració de la xarxa ==== La connexió a la placa base s'identifica com a eth1 i és una <file> Ethernet interface /0/100/19 product: Ethernet Connection I217-LM [8086:153A] vendor: Intel Corporation [8086] bus info: pci@0000:00:19.0 logical name: eth1 version: 05 serial: 50:65:f3:3a:12:5e size: 100Mbit/s capacity: 1Gbit/s width: 32 bits clock: 33MHz capabilities: Power Management, Message Signalled Interrupts, bus mastering, PCI capabilities listing, ethernet, Physical interface, twisted pair, 10Mbit/s, 10Mbit/s (full duplex), 100Mbit/s, 100Mbit/s (full duplex), 1Gbit/s (full duplex), Auto-negotiation configuration: autonegotiation: on broadcast: yes driver: e1000e driverversion: 2.3.2-k duplex: full firmware: 0.13-4 latency: 0 link: no multicast: yes port: twisted pair speed: 100Mbit/s resources: irq: 40 memory: efc00000-efc1ffff memory: efc3d000-efc3dfff ioport: f080(size=32) this device has been disabled </file> i la targeta de xarxa addicional s'identifica com a eth0 és una <file> Ethernet interface /0/100/1c.1/0 product: I210 Gigabit Network Connection [8086:1533] vendor: Intel Corporation [8086] bus info: pci@0000:02:00.0 logical name: eth0 version: 03 serial: a0:36:9f:8f:0a:b3 size: 1Gbit/s capacity: 1Gbit/s width: 32 bits clock: 33MHz capabilities: Power Management, Message Signalled Interrupts, MSI-X, PCI Express, bus mastering, PCI capabilities listing, extension ROM, ethernet, Physical interface, twisted pair, 10Mbit/s, 10Mbit/s (full duplex), 100Mbit/s, 100Mbit/s (full duplex), 1Gbit/s (full duplex), Auto-negotiation configuration: autonegotiation: on broadcast: yes driver: igb driverversion: 5.0.5-k duplex: full firmware: 3.16, 0x800004ff, 1.304.0 ip: 192.168.2.14 latency: 0 link: yes multicast: yes port: twisted pair speed: 1Gbit/s resources: irq: 17 memory: efa00000-efafffff memory: efb00000-efb03fff memory: ef900000-ef9fffff </file> Cal comprovar el fitxer /etc/udev/rules.d/70-persistent-net.rules (veure més avall) per tal que l'assignació de les targetes al sistema operatiu sigui estàtica i no es faci cada cop que es reinicia l'ordinador, de forma que la targeta a la placa base sigui sempre eth1 i correspongui a la connexió a la consola (IPSO), i que la targeta addicional sigui sempre eth0 i es faci servir per la connexió a la xarxa local (LAN). Actualment la configuració de la xarxa interna del SeRMN la proporciona el propi ordinador en mode estàtica i els paràmetres són, * Hostname: cie-55-32 * Domain: sermn.net * IP address: 192.168.2.14 * Broadcast: 192.168.2.255 * Netmask: 255.255.225.0 * DNS: * domain sermn.net * search sermn.net * nameserver 192.168.2.1 tal i com es pot comprovar a partir de la configuració del dispositiu eth0, <file> eth0 Link encap:Ethernet HWaddr a0:36:9f:8f:0a:b3 inet addr:192.168.2.14 Bcast:192.168.2.255 Mask:255.255.255.0 inet6 addr: fe80::a236:9fff:fe8f:ab3/64 Scope:Link UP BROADCAST RUNNING MULTICAST MTU:1500 Metric:1 RX packets:347295 errors:0 dropped:0 overruns:0 frame:0 TX packets:242868 errors:0 dropped:0 overruns:0 carrier:0 collisions:0 txqueuelen:1000 RX bytes:356548362 (340.0 MiB) TX bytes:29710200 (28.3 MiB) Memory:efa00000-efafffff </file> i dels servidors de noms, <file> root@cie-55-32:/etc# more resolv.conf # Generated by NetworkManager nameserver 192.168.2.1 root@cie-55-32:/etc# </file> El dispositiu eth1 també es reconeix, <file> eth1 Link encap:Ethernet HWaddr 50:65:f3:3a:12:5e BROADCAST MULTICAST MTU:1500 Metric:1 RX packets:0 errors:0 dropped:0 overruns:0 frame:0 TX packets:432 errors:0 dropped:0 overruns:0 carrier:0 collisions:0 txqueuelen:1000 RX bytes:0 (0.0 B) TX bytes:36715 (35.8 KiB) Interrupt:20 Memory:efc00000-efc20000 </file> però no té una configuració assignada. Caldrà configurar-ho de forma estàtica amb els paràmetres de connexió emprats actualment per la connexió de l'estació de treball a la consola. === Paquets i programes de Debian === Com que la configuració de la xarxa és estàtica, per evitar problemes elimino els paquets, * :ok: isc-dhcp-client (que alhora desinstal·la :ok: network-manager i :ok: network-manager-gnome), i * :ok: isc-dhpc-common, i instal·lo * :ok: ifupdown-extra, que alhora arrossega els paquets * curl, i * ethtools * :ok: wireshark === Configuració de les targetes de xarxa === Per evitar que en algun moment es pugui bescanviar la configuració de les targetes de xarxa poso en pràctica les opcions esmentades a How to reorder or rename logical interface names in Linux. Una consulta al fitxer /etc/udev/rules.d/70-persistent-net.rules indica que l'assignació del nom de dispositiu, eth0 o eth1 feta pel programa udev és fixe, i que no hi ha perill de que canviï en reiniciar l'ordinador, <file> root@cie-55-32:/etc/udev/rules.d# more 70-persistent-net.rules # This file was automatically generated by the /lib/udev/write_net_rules # program, run by the persistent-net-generator.rules rules file. # # You can modify it, as long as you keep each rule on a single # line, and change only the value of the NAME= key. # PCI device 0x8086:0x1533 (igb) SUBSYSTEM==“net”, ACTION==“add”, DRIVERS==“?*”, ATTR{address}==“a0:36:9f:8f:0a:b3”, ATTR{dev_id}==“0x0”, ATTR{type}==“1”, KERNEL==“eth*”, NAME=“eth0” # PCI device 0x8086:0x153a (e1000e) SUBSYSTEM==“net”, ACTION==“add”, DRIVERS==“?*”, ATTR{address}==“50:65:f3:3a:12:5e”, ATTR{dev_id}==“0x0”, ATTR{type}==“1”, KERNEL==“eth*”, NAME=“eth1” </file> Així doncs, podem fer servir eth0 i eth1 al fitxer de configuració etc/network/interfaces sense preocupacions. === Bibliografia === * Network Configuration a la wiki de Debian. * NetworkManager a la wiki de Debian. * Chapter 5. Network setup, a Debian Reference, by Osamu Aoki. * Disable NetworkManager * … === Fitxers de configuració provissionals === Aquesta és la configuració de xarxa provissional emprada per la instal·lació i configuració del sistema operatiu i del programa TopSpin. /etc/hosts <file> 127.0.0.1 localhost 192.168.2.14 cie-55-32.sermn.net cie-55-32 </file> /etc/resolv.conf <file> # Generated by NetworkManager nameserver 192.168.2.1 </file> /etc/network/interfaces <file> # This file describes the network interfaces available on your system # and how to activate them. For more information, see interfaces(5). source /etc/network/interfaces.d/* # The loopback network interface auto lo iface lo inet loopback # Ethernet interfaces are assigned to physical devices in a # persistent way according to rules in file: # # /etc/udev/rules.d/70-persistent-net.rules # # Hence, each of eth0 and eth1 will always correspond to # the same device. The configuration below assumes that, # # eth0 → lan (internet) # eth1 → nmr (spectrometer ccu or ipso) # auto eth0 eth1 # LAN / INTERNET - Assigned to the primary network interface, # which usually will be the motherboard integrated NIC. # iface eth0 inet static address 192.168.2.14 netmask 255.255.255.0 broadcast 192.168.2.255 gateway 192.168.2.1 # NMR CONSOLE LAN - Assigned to the secondary network interface, # which usually will be the added NIC. # iface eth1 inet static address 149.236.99.1 netmask 255.255.255.0 network 149.236.99.0 broadcast 10.10.255.255 </file> /etc/udev/rules.d/70-persistent-net.rules**

# This file was automatically generated by the /lib/udev/write_net_rules
# program, run by the persistent-net-generator.rules rules file.
#
# You can modify it, as long as you keep each rule on a single
# line, and change only the value of the NAME= key.

# PCI device 0x8086:0x1533 (igb)
SUBSYSTEM=="net", ACTION=="add", DRIVERS=="?*", ATTR{address}=="a0:36:9f:8f:0a:b3", ATTR{dev_id}=="0x0", 
ATTR{type}=="1", KERNEL=="eth*", NAME="eth0"

# PCI device 0x8086:0x153a (e1000e)
SUBSYSTEM=="net", ACTION=="add", DRIVERS=="?*", ATTR{address}=="50:65:f3:3a:12:5e", ATTR{dev_id}=="0x0", 
ATTR{type}=="1", KERNEL=="eth*", NAME="eth1"
root@cie-55-32:/etc/udev/rules.d# 

Configuració de serveis

Avahi

FIXME S'ha de configurar (fitxer /etc/avahi/avahi-daemon.conf) per tal de restringir la difusió dels serveis disponibles a l'ordinador i, potser, la cerca de serveis a la xarxa.

Trivial FTP daemon

Bootparam

Cal configurar-lo per servir el sistema operatiu de la consola.

NFS

:ok: Cal configurar-lo per servir el sistema operatiu de la consola.

NTP

:ok: Instal·lo el paquet ntp i al final del fitxer /etc/ntp.conf afegeixo els següents servidors de temps,

  • server swisstime.ethz.ch
  • server ntp.uab.es
  • server ntp.univ-lyon1.fr

DHCP Server

:ok: Instal·lo el paquet isc-dhcpd-server que alhora reinstal·la el paquet isc-dhcp-common.

Dial-in terminal (cu)

:ok: Instal·lo el paquet cu

Addició de l'arquitectura de 32-bits

Executo la comanda dpkg –add-architecture i386 per afegir els paquets de 32-bits que es necessiten per executar alguns programes de Topspin de 32-bits (per exemple, el servei bfsd).

Instal·lo els següents paquets:

  • libc6-i386

Instal·lació del ParaVision

This website uses cookies. By using the website, you agree with storing cookies on your computer. Also you acknowledge that you have read and understand our Privacy Policy. If you do not agree leave the website.More information about cookies
informatica/hp_z240mt_biospec.1472475502.txt.gz · Last modified: 2016/08/29 14:58 by miquel